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炎症性肠病
Gut:应对IBD的关键——饮食(必读综述)
① 近3年来,关于炎症性肠病(IBD)的发生机制有激动人心的进展,特别是明确了在遗传之外,环境尤其是因饮食而改变的肠道菌群至关重要;② 在针对克罗恩病人的治疗中,肠外营养被证明可缓解症状,施行4周以上,可减少外科手术介入;③ 基于肠外营养方案剔除特定成分的饮食、特定天然食品都可缓解病情,并作为生物或组合疗法失效后的挽救治疗;④ 对病人进行饮食教育值得推崇,虽然还在起步阶段,但利用饮食治疗IBD的方法应该会在临床带来获益。
炎症性肠病
克罗恩病
溃疡性结肠炎
饮食干预
Diet
乳腺癌
多吃蔬菜水果,或可降低乳腺癌风险
① 两个队列共182145名女性,随访起始年龄27-59岁,中位随访时间23.7年,共发生10911例浸润性乳腺癌;② 较高的总果蔬摄入量与较低的乳腺癌风险显著相关,尤其是十字花科和黄色/橙色蔬菜;③ 蔬菜摄入与较低的雌激素受体阴性肿瘤风险相关;④ 对不同分子亚型的肿瘤而言,较高的总果蔬摄入量与较低的HER2阳性肿瘤、基底样瘤和管腔A型肿瘤强相关;⑤ 多吃蔬菜水果,尤其是十字花科和黄色/橙色蔬菜,可能减少乳腺癌(特别是侵袭性肿瘤)风险。
乳腺癌
饮食
蔬菜水果
公民科学
EMBO Reports:发动公众一起参与研究厨房里的菌群
① American Gut等组织公众参与的众筹型研究项目备受关注,大众得以和科学家一起解决科学问题;② 类似的,在英国牛津的一个社区,科学家组织公众参与关注厨房菌群的研究;③ 研究主要目的:厨房里有什么微生物,清洁带来的变化,微生物如何占领一块新砧板,冰箱里的微生物;④ 可选研究点:宠物微生物会出现在哪,圣诞树会带来什么,有机和传统蔬菜有什么区别,日常和假期会有什么区别;⑤ 研究已取得初步成果并发布,方法和技术也在持续优化中。
公民科学
众筹
厨房菌群
关键分类
Nature Reviews:迄今为止,已有200+关键菌群分类被鉴定!
① 菌群的物种组成极为复杂,但科学家在土壤、植物、海洋和人体共生菌群中鉴定出超过200个关键分类,它们对菌群结构和功能起到驱动作用;② 利用生态网络分析方法可以鉴定出这些关键分类,联合高平均度、高接近中心度和低中介中心度鉴定等方法,准确率可达85%;;③ 基于统计的方法存有局限性,尤其需要注意相关性不意味着一定具有因果关系,对此应谨慎解读;④ 结构方程模型等方法可突破相关性,在关键分类和菌群组成或功能之间探索因果关系。
关键分类
菌群
结构方程模型
网络评分
代谢产物
Science子刊:肠道细菌如何合作生成腐胺
① 之前的研究发现,摄入精氨酸及益生菌(双歧杆菌属)后,结肠内腔中的腐胺丰度显著增加;② 鉴定出一条新的腐胺生成通路,在环境酸化的条件下,由精氨酸经中间产物胍基丁胺最后生成腐胺;③ 双歧杆菌属为代表的产酸细菌可将环境酸化,而合成腐胺的通路需要两群细菌的参与;④ 耐酸性大肠杆菌可将精氨酸转化为胍基丁胺,粪肠球菌为代表的具有胍基丁胺脱亚氨酶系统的细菌将胍基丁胺转化为腐胺。
代谢产物
代谢通路
腐胺
环境辐射污染
核辐射之果:切尔诺贝利田鼠的肠道菌群变化
① 分析乌克兰切尔诺贝利辐射污染和非污染区以及基辅(非污染区)中堤岸田鼠的肠道菌群;② 环境放射性核素水平上升不影响肠道菌群丰富度,但污染区的厚壁菌门:拟杆菌门比值比非污染区升高近1倍;③ 两处非污染区的田鼠肠道菌群组成相似,可基于区域辐射水平高低对菌群组成进行区分,准确性>90%;④ 辐射区田鼠的菌群功能改变,以碳水化合物的降解、同化和转运、外源物质生物降解和DNA损伤通路为特征;⑤ 环境辐射可显著改变动物的肠道菌群。
环境辐射污染
肠道菌群组成
肠道菌群功能
线粒体自噬
Cell:线粒体自噬力助杀伤大肠癌细胞的机制
① 在两种wnt/β-连环蛋白依赖性肠道肿瘤模型中,采用让Stat3功能缺失的方法,揭示适应性免疫应答新机制;② 肠道上皮细胞(IEC)内线粒体自噬升高,导致上皮溶酶体内铁离子(II)聚集,驱动溶酶体膜通透性增加(LMP);③ 向胞浆内释放蛋白酶,促进MHC I类分子的提呈,通过使树突状细胞“易装”,激活CD8+T细胞;④ 线粒体功能、溶酶体完整性与IEC内MHC I类分子提呈联系,驱动线粒体自噬或诱导IEC内的LMP,可转换结直肠癌内的抗肿瘤免疫平衡。
线粒体自噬
CD8+T细胞
溶酶体膜通透性
适应性免疫
无菌动物
重庆畜牧科学院葛良鹏团队:无菌乳猪的基因表达谱变化
① 选取4只雄性无菌乳猪及4只同窝正常乳猪,对5种组织(口腔粘膜、空肠、结肠、肝脏、脾脏)的RNA进行测序,分析基因表达谱;② 共鉴定出14个基因在无菌乳猪及正常乳猪中存在表达差异,均在无菌乳猪中下调,其中7种是干扰素诱导表达的基因;③ 与其它组织相比,结肠中的转录因子表达受到菌群的影响最大;④ 免疫相关基因在无菌乳猪中的表达下调,发育相关基因也受到影响,提示肠道菌群影响肠道之外的基因表达。
无菌动物
无菌猪
基因表达谱
79个超强微生物知识,全力助你孕育99分超优宝宝!
本文介绍与育儿有关的卫生假说和微生物知识,鉴于目前该领域科学家对细菌的研究最深入,部分内容所指微生物,如无特别说明,指的是细菌;这篇文章我筹划了半年,专为女儿一周岁生日所写;知识主要来源于科学文献,部分来源于家庭实践。
热心肠先生:139张纯干货,助你彻底了解菌群、药物和疗法!
2018年4月16日,受中国药科大学研究生院副院长许风国教授的邀请,我在中国药科大学玄武门校区给2017级硕士研究生讲了一堂《新药研发前沿概论》课。
35张图,看懂肠道和大脑的魔性关系,绝对涨知识!
我们一般认为,是大脑在控制内心和思想。但中西方语言中这两个魔性的短语,却在冥冥中暗合了现代科学研究带给我们的颠覆性认识——大脑的功能,至少有一部分是受肠道及微生物控制的
赵立平等《科学》亮剑:用膳食纤维"钓"出15株缓解糖尿病的细菌!
《科学》杂志上线了一篇论文,介绍了上海交通大学赵立平、张晨虹和彭永德教授等人合作完成的重量级研究成果——利用多种膳食纤维的组合,改善了糖尿病人的肠道菌群,选择性地促进一组产短链脂肪酸细菌的富集,这组菌的丰度和多样性越高,血糖改善越好。
马丁:益生菌领域,几乎失控,何去何从?
1948年生于纽约,现任纽约大学朗格尼医学中心医学教授、微生物学教授,纽约大学人类微生物组计划负责人。美国医学院院士,美国人文与科学院院士。
39张图,读懂中国医生的菌群移植创新!
张发明,一个临床医生,却具有超强的产品经理能力,能不断发明、发现和发展;一个超强产品经理,却因为医功和医德成为知名临床医生!
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