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PNAS
文章数:61篇
蝉科
PNAS:昆虫内共生菌在进化中分裂为多个谱系
这是发表在PNAS[IF:9.661]上关于某种蝉科昆虫的内共生菌复合体起源的研究。该研究表明,多个Hodgkinia cicadicola菌株是从共同的始祖菌株“分裂”而来,形成共生菌复合体,彼此间通过基因组互补以行使完整的功能;与此相似的是线粒体基因组,在不少真核生物中,线粒体基因组并非是完整的环状结构,而是以多个“碎片”的形式存在。有趣的研究,推荐专业人士阅读。
蝉科
基因组进化
线粒体
细胞器
内共生菌
食品安全
PNAS:监测食品安全,测序正走上舞台!
这是PNAS关于利用基于微生物组测序的方法来监测食品安全的观点文章,介绍了美国部分公司利用二代测序技术用于食品中微生物的监测的实践,并对未来普遍使用测序技术用于食品安全监测做了展望。这是很值得关注的文章,特别推荐。
食品安全
Khald Blau
Kornelia Smalla
溶质转运蛋白
PNAS:大西洋海水菌群的溶质转运蛋白
这是PNAS发表的结合利用宏蛋白组与宏基因组分析研究大西洋海水菌群中特定类型蛋白质的研究,值得专业人士关注,特别推荐。
溶质转运蛋白
Atlantic Ocean
deep sea
Metaproteomics
organic matter
CTLA-4抑制剂
PNAS:CTLA-4抑制剂恶化小鼠结肠炎,双歧杆菌可缓解
这是PNAS[IF:9.661]近期发表的关于特定肠道细菌(双歧杆菌)缓解肿瘤免疫抑制剂引发的小鼠结肠炎的研究,领衔的是上海交通大学医学院上海市免疫学研究所王锋研究员。这是很重要的肿瘤相关菌群研究,特别推荐!
CTLA-4抑制剂
双歧杆菌
Bifidobacterium
CTLA-4
immune checkpoint blockade
哺乳动物
PNAS:地域分布促进哺乳动物肠道菌群的多样化
这是PNAS[IF:9.661]在近期发表的野生动物菌群研究,通过研究发现,对比宿主亲缘关系及饮食的影响,地域分布对菌群的塑造作用很显著,包括在捕食者和猎物之间存在相似度高的肠道菌群。这是很值得关注的研究,特别推荐。
哺乳动物
生物地理学
Janelle A Skinner
Tracy L Burrows
纬度
PNAS:纬度或是土壤细菌生物合成结构域的最大影响因素
这是PNAS发表的关于影响土壤菌群生物合成结构域的因素的研究,认为纬度可能是其中的最大因素。值得关注,特别推荐土壤相关微生物专业人士阅读。
纬度
细菌天然产物
chemical biogeography
continental soil analysis
eDNA
生殖隔离
PNAS:果蝇交配偏好可能与肠道菌群无关
这是一项重要的探索肠道菌群是否会影响果蝇的生殖隔离的研究,结论是不支持菌群对生殖隔离的普遍作用。这方面研究极少,所以这篇更值得专业人士好好看看。
生殖隔离
果蝇
交配偏好
Hengzhong Lun
Yunshan Wang
宿主间传播
PNAS:菌群在斑马鱼间的传播可覆盖基因型对菌群的影响
这是PNAS[IF:9.661]在本月初发表的一项重要研究,利用斑马鱼作为模式生物,阐明了在不同斑马鱼之间传播的菌群,对宿主菌群的塑造作用可以充分覆盖基因缺陷的影响。这充分说明了不同个体间的菌群传播可以独立于基因之外影响菌群生态学。这是非常重要的模式生物研究,对在人身上的粪菌移植等疗法都有一些参考意义,未来或许我们可以看到人和其他动物身上的类似研究。
宿主间传播
dispersal
innate immunity
metacommunity
Microbiome
空间分布
PNAS:“看到”肠道细菌的空间分布
这是Jeffrey I Gordon等人在9月发表在PNAS的重要研究,通过将已知菌群移植到小鼠并利用原位杂交及光谱成像分析研究不同菌株的空间分布情况。文章五颜六色,看起来漂亮,更令人激动!相关技术会推动肠道菌群的研究变得可视化,进而更深入。
空间分布
Wentao Jiao
Xin Jiang
Mao Ye
多发性硬化
PNAS:多发性硬化患者的肠道菌群,促进小鼠自身免疫病
PNAS连发两篇多发性硬化患者肠道菌群的研究,都表明了菌群在促进自身免疫性疾病中的作用,非常值得关注,特别推荐!
多发性硬化
experimental autoimmune encephalomyelitis
Germ-free mice
gut microbiome
multiple sclerosis
多发性硬化
PNAS:多发性硬化患者的肠道菌群,促进炎症及自身免疫病
PNAS连发两篇多发性硬化患者肠道菌群的研究,都表明了菌群在促进自身免疫性疾病中的作用,非常值得关注,特别推荐!
多发性硬化
Autoimmunity
Microbiome
multiple sclerosis
David J Miller
抵抗素
PNAS:肠道抗菌蛋白武器库的新成员
这是PNAS[IF:9.661]今年8月底发表的关于肠道上皮层分泌的抗菌蛋白的重要研究,确定抵抗素样分子β(RELMβ)为肠道抗菌蛋白的新成员,很值得看看研究思路,必有收获。
抵抗素
抵抗素样分子β
抗菌蛋白
Maxime M Mahe
Holly M Poling
藻类多糖
PNAS:食草热带鱼的肠道菌群,体现饮食习惯
这是针对食草热带鱼肠道内的巨大细菌与饮食习惯的关系研究,鱼肠道里的细菌,像陆地食草动物一样,能更好利用植物纤维(多糖)。PNAS发表,值得关注。
藻类多糖
食草热带鱼
巨大细菌
碳水化合物酶
木质纤维素酶
1型糖尿病
PNAS:保护性MHC等位基因通过肠道菌群预防1型糖尿病
关于肠道菌群如何参与1型糖尿病预防的基因和分子生物学研究,推荐专业人士研究。
1型糖尿病
主要组织相容性复合物
NOD mice
autoimmune disease
Microbiome
黑色素瘤
BRAF抑制剂耐药机制:NRAS同工酶2过表达
① BRAF耐药黑色素瘤细胞株及肿瘤患者组织中NRAS同功酶2上调,当BRAF突变黑色素瘤细胞株过表达同功酶2,在BRAFi处理时细胞增殖和体内肿瘤生长仍明显增加,在BRAFi耐药细胞株中shRNA处理基因敲除同功酶2,恢复对BRAFi的敏感性;② 同功酶2过表达的细胞MAPK通路下调,PI3K通路上调;③ 免疫沉淀同功酶2验证了该同功酶与PI3K 和BRAF/RAF1的结合亲和性;④ AKT抑制剂联合BRAFi,部分恢复高表达同功酶2细胞对BRAFi的敏感性。
黑色素瘤
耐药
威罗菲尼
BRAF
NRAS
药物联合
血液肿瘤治疗新风尚:靶向药联合
① 122例各种血液系统恶性肿瘤患者分离的原发单核细胞样本,已获得FDA批准的、不同分类、靶向非重叠的生物学通路的48个药物联合的间接体外敏感性分析;② 几乎所有的联合均包括BCL2抑制剂,对髓系恶性肿瘤有效,选择性联合包括PI3K、CSF1R或溴结构域抑制剂对淋巴系恶性肿瘤有效;③ 对AML和CLL扩大性分析揭示,间接体外药物联合疗效的特定方式与选择的遗传学、细胞遗传学和表型疾病亚群相关;④ 强调整合基因组学鉴定新的治疗方法的启发价值。
药物联合
间接体外分析
血液系统恶性肿瘤
靶向治疗
drug combinations
神经母细胞瘤
表观遗传学药物+促分化诱导剂:治疗神经母细胞瘤
① 神经母细胞瘤(NBM)的预后多样,从自发性消退到致命性进展;② 高风险NBM接受清髓化疗和造血干细胞移植,后续辅助维甲酸分化治疗,预后差;③ 系统性联合DNA去甲基化药物5-Aza-脱氧胞苷(AZA)和维甲酸(RA)治疗,快速诱导HIF2α相关的缺氧样转录应答,后续神经元基因表达增加、细胞周期基因表达减少,抑制肿瘤生长,延长生存期;④ 高水平HIF2α,与神经元分化基因表达及预后正相关,与MYCN扩增负相关,HIF2α在NBM中发挥抑癌基因作用。
神经母细胞瘤
分化
维甲酸
5-Aza-dC
HIF2a
恶性脑胶质瘤
纳米包装的RNA能抗脑瘤?
① 脑肿瘤起始细胞(BTIC)被认为是导致脑胶质瘤产生治疗抵抗,复发和进展的主要原因,但血脑屏障隔离及肿瘤内异质性阻碍了针对BTIC治疗手段的发展;② 作者运用脂多聚物纳米颗粒(LPNP)包装针对已经确认的BTIC4个主要转录因子(SOX2,OLIG2,SALL2,POU3F2)的siRNA,尝试运用该方法进行治疗;③ 体外实验证明该颗粒可以被肿瘤细胞吞进去并有效敲低靶基因;④ 体内实验证明该方法可有效延长荷瘤小鼠的生存期,提示该方法有临床应用价值。
恶性脑胶质瘤
脂多聚物纳米颗粒
RNA干扰(RNAi)
brain tumor-initiating cells
convection-enhanced delivery
溶瘤病毒
间充质干细胞+溶瘤病毒=抗癌利器?
① 颈内动脉注射患者来源黑色素瘤和脑亲和性黑色素瘤细胞株,建立可体内成像小鼠模型,以及同基因脑转移小鼠模型;② 实时体内成像技术,脑内广泛分布镜下和肉眼转移灶,再现患者多灶性转移;③ 用不同的溶瘤单纯疱疹病毒(oHSV)异构体武装间质干细胞(MSCs)(MSC-oHSV),颅内MSC-oHSV可有效地示踪转移灶,延长脑转移小鼠的生存期;④ 在同基因模型中,联合MSC-oHSV和PD-L1阻断剂,促进产生IFNγ的CD8+肿瘤浸润T淋巴细胞,延长中位生存期。
溶瘤病毒
干细胞
黑色素瘤
体内成像
imaging
tRNA片段
肿瘤tsRNA:必读综述
① 肿瘤中,tRNA来源的小RNAs即tsRNAs失调,肿瘤的进展调控tsRNA的表达;② 癌基因的激活和抑癌基因的失活导致特定tsRNAs的失调,在HEK-293细胞中建立ts-101和ts-46的基因敲除模型,基因表达模式明显不同,参与细胞生存的基因活化,参与凋亡和染色质结构的基因下调;③ 在两个肺癌细胞株中过表达ts-46和ts-47,细胞克隆形成受抑,tsRNAs影响细胞的生长和生存,在肿瘤病理发生中起作用;④ tsRNAs可作为诊断标志物或治疗的靶点。
tRNA片段
非编码RNA
ncRNA
tDR
tRF
硫酸乙酰肝素
PNAS:多形拟杆菌如何降解糖胺聚糖?
这是一项关于人体肠道菌群中的多形拟杆菌降解糖胺聚糖的分子机制的研究,有点复杂,热心肠先生看不太懂,但感觉很牛,就这样懵懵啊懂懂啊地推荐给大家吧!
硫酸乙酰肝素
肝素
多形拟杆菌
糖胺聚糖
Duo Li
铜
PNAS:大肠杆菌中铜耐受及酸耐受机制的相互作用
关于大肠杆菌的一项分子生物学研究,值得好好读一读。
铜
Cu传感器(CueR)
Cu输出泵(CopA)
大肠杆菌
谷氨酰胺(Gln)
结肠水流量
PNAS:结肠水流量及化学环境对结肠菌群的影响
① 本文研究结肠生理状态如何影响结肠细菌的生长,从而最终影响菌群的组成;② 结合对细菌生理学的检测及对已发表的人体生理学数据的分析,建立定量综合模型框架,关注水流量等生理因素如何决定主要细菌门的丰度;③ 结肠内腔的局部pH值对不同的细菌有着不同的影响,驱动菌群组成的改变;④ 影响结肠pH值的关键因素包括结肠上皮的水吸收、营养流入、内腔缓冲能力。
结肠水流量
结肠pH值
结肠化学环境
colon physiology
colonic pH
球孢白僵菌
PNAS:肠道菌群与病原真菌互作加速蚊子死亡
PNAS上的一项重要研究,值得认真读一读。
球孢白僵菌
蚊子
粘质沙雷氏菌
Anopheles
Dysbiosis
T细胞存活
PNAS:肠道菌群促进T细胞的全身存活
这是关于肠道菌群和免疫细胞和免疫系统功能的重量级研究,特别推荐。
T细胞存活
Erdr1凋亡因子
Fas
T cells
Toll-like receptors
脂蛋白运输
PNAS:LolA/LolB途径并非外膜脂蛋白运输的必需途径
PNAS上的细菌基础研究,推荐专业人士阅读。
脂蛋白运输
细菌外膜
LolA/LolB途径
cognition
PNAS:睡眠不足对菌群的影响有限
一篇关于睡眠不足对人和大鼠的菌群的影响的文章,之前就很多人关注,小秘书特别再次分享。
cognition
Gut
Microbiome
sleep deprivation
Sleep restriction
Anaplasma
PNAS:人类病原体改变蜱虫菌群以促进感染
这项研究发现能感染人类的病原体改变蜱虫的菌群以利于自身的定殖,这个研究有很大意义,值得一读。
Anaplasma
Ixodes scapularis
antifreeze protein
biofilm
Microbiome
GOS
PNAS:低聚半乳糖改善乳糖不耐受人群的肠道菌群
这是最近关于益生元(低聚半乳糖)的最高水平研究之一,强烈推荐。
GOS
lactose intolerance
Microbiome
prebiotic
Hila Mizrahi
益生元
PNAS:什么是益生元?一致性共识或将发表
关于益生元的定义问题,是这两年争论得很厉害的问题,居然连PNAS也特别关注了,没理由不好好看看这篇文章是不是。。
益生元
益生菌
菊粉
寡糖
Yongzhi Yang