Adrian J Verster

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Adrian J Verster

文章数：2篇

菌群内互作

Nature：肠道细菌攻防战中的防御系统

除了饮食和宿主免疫等菌群外部因素，肠道菌群的组成还受到菌群内成员之间互作的影响，其中很关键的一部分，是由细菌接触引发的细菌间的拮抗作用，比如拟杆菌目的多个成员表达的VI型分泌系统（T6SS），可将毒素蛋白输送进邻近的细菌中，从而杀死对方。细菌如何抵抗这种来自其它细菌的恶意攻击呢？Nature发表的一项最新研究发现，肠道拟杆菌目细菌广泛含有一套抵抗T6SS毒性作用的免疫机制，这种细菌免疫主要由一类称为“获得性细菌间防御”（AID）的基因簇来编码，不仅如此，AID基因簇还可在细菌之间转移，使得受体细菌也能得到保护。看来肠道细菌之间不光有“你死我活”般的竞争，也有“好东西大家分享”式的友爱互助。这项研究也说明，细菌虽小但也有不简单的免疫系统：抵抗噬菌体有CRISPR-Cas系统，抵抗细菌的T6SS毒素有AID系统。

菌群内互作 Bacterial evolution Bacterial secretion Microbiome VI型分泌系统

竞争性彩票模型

肠道菌群中存在基于竞争性彩票模型的组装模式

竞争性彩票模型认为来自区域物种池的不同生物群能够在相同的生态位定殖，且第一个到达的物种将占据整个生态位并排除其它群体成员。对于进化关系较近的同一属的细菌来说，因其具有类似的代谢能力，可能更契合这一模型。

竞争性彩票模型菌群组装 Competitive lottery model Computational modeling ecology