Bradley E Bernstein

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Cell：基因组大规模拓扑改变抑制大肠癌恶性进展

尽管已发现癌细胞中DNA甲基化和染色体发生广泛改变，但高阶染色体结构如何改变仍不明确。最新发表在Cell的研究通过对结直肠癌细胞基因组拓扑结构、表观遗传学和转录特征的综合分析，发现大量的基因组隔室重组与肿瘤抑制相关。

结肠癌 genome topology chromatin DNA methylation colon cancer

胃肠道间质瘤

Nature：改变染色体拓扑结构驱动胃肠道间质瘤致癌程序

表观遗传异常在癌症中广泛存在，但目前对其潜在机制和因果关系仍知之甚少。胃肠道间质瘤（GISTs）的一个亚群缺乏典型的激酶突变，但具有琥珀酸脱氢酶（SDH）缺陷和整体DNA高甲基化。最新发表在Nature杂志的一项研究，将这种高甲基化与激活致癌程序的基因组拓扑结构变化联系起来。该研究主要关注一个被破坏的绝缘体，其反复丢失改变了SDH缺陷GISTs的拓扑结构，并上调FGF4表达。另一个绝缘子在KIT癌基因附近反复丢失，其在SDH缺陷GISTs中也高表达。建立了相同表观遗传状态的SDH缺陷GISTs的PDX模型，其对FGFR抑制剂或FGFR/KIT联合抑制敏感。该研究揭示了表观遗传改变如何在缺乏典型激酶突变的情况下驱动致癌程序，这对癌症中异常通路的机制靶向具有启示意义。

胃肠道间质瘤琥珀酸脱氢酶染色体拓扑结构绝缘体 FGFR抑制