《热心肠日报》2019榜单-全球肠道菌群研究五大机构
热心肠小伙伴们 ,热心肠先生 2020-01-03
哈佛大学、麻省理工学院、斯坦福大学、加州大学旧金山分校、华盛顿大学入选。

2019 年,全球肠道领域研究继续高歌猛进,取得了颇多令人瞩目的进展。

这一年《热心肠日报》 解读的 2700 多篇肠道及其相关领域的 SCI 论文中,影响因子超过 15 分的有 900 多篇,来自 Cell 、 Nature 、 Science 的文章 160 篇,来自 NEJM 、 Lancet 、 JAMA 的文章约 100 篇。

我们向所有取得突破的科学家表示祝贺,并坚信在 2020 年我们依然能够看到肠道科学领域的持续高产。

为了对 2019 年做一个阶段性的回顾,我们对日报中收录的 2019 年发表的肠道领域研究论文和综述论文,进行了多维度的加权评分,在充分考虑杂志影响力、日报阅读数、转发和讨论数等客观数据的基础上,形成了 2019 年《热心肠日报》的 5 个年度榜单:

2019 年度榜单参评的文章共有 2350 篇,来自 107 个国家(地区)的 2563 个研究团队(以通讯作者数量计), 发表在 395 种不同的期刊上,累计影响因子达到了 34532.2。据不完全统计(仅包括访问热心肠网站),《热心肠日报》的读者累计访问了这些文章超过 255 万次。

本榜单仅代表热心肠生物技术研究院基于自身数据所做的优选,可能存在主观因素干扰等不足,仅供参考。欢迎在文末留言提出批评、建议和意见。

本篇发布“全球肠道菌群研究五大机构”。

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哈佛大学开展“肠道菌群”研究的下属机构主要包括哈佛医学院、麻省总医院、公共卫生学院及其与麻省理工学院合办的 Broad 研究所等。2019 年的《热心肠日报》解读了哈佛大学 35 个研究团队(以通讯作者数目计算,下同)发表的 30 多篇论文,所涉及的领域包括炎症性肠病、大肠癌、免疫、肠脑轴、代谢等。主要的研究团队由 Ramnik J XavierWendy S GarrettCurtis HuttenhowerAleksander Kostic 等领衔。在这其中包括 2018、2019 连续两年被评为全球肠道菌群研究十大人物(以下称“十大人物”)的 Ramnik J Xavier 教授,以及去年被评为 2018“十大人物”的 Curtis Huttenhower 教授。

2019代表性论文

Curtis HuttenhowerNature:炎症性肠病肠道微生态系统的多组学分析

2019-05-29, Nature, doi: 10.1038/s41586-019-1237-9 [IF: 43.07]

Eric J Alm; Ramnik J XavierScience:肠内生存不易,倒位子或是细菌适应肠道环境的利器

2019-01-11, Science, doi: 10.1126/science.aau5238 [IF: 41.037]

Ramnik J XavierCell:剖析宿主-菌群互作机制及治疗IBD(综述)

2019-08-22, Cell, doi: 10.1016/j.cell.2019.07.045 [IF: 36.216]

麻省理工学院开展“肠道菌群”研究的下属机构包括与哈佛大学共建的 Broad研究所、微生物组信息学和治疗学中心以及霍华德·休斯医学院等。2019 年的《热心肠日报》解读了麻省理工 15 个团队的近 20 篇高水平研究成果,所涉及的领域包括肠道疾病、以及研究中用到新方法和新技术等。麻省理工一方面与哈佛大学共有一部分研究人员,包括 Ramnik J XavierWendy S Garrett 等人,另一方面还有自己独有的优秀研究人员。其中包括被评为 2019“十大人物”的 Eric J Alm 教授。

2019代表性论文

Simon H YeCell:20种宏基因组学物种分类工具大比拼

2019-08-08, Cell, doi: 10.1016/j.cell.2019.07.010 [IF: 36.216]

Martin PolzCell:PopCOGenT新方法鉴定微生物基因组间的基因流动

2019-08-08, Cell, doi: 10.1016/j.cell.2019.06.033 [IF: 36.216]

R J Xavier; E J AlmNature子刊:人体肠道菌群研究再添重要资源

2019-09-02, Nature Medicine, doi: 10.1038/s41591-019-0559-3 [IF: 30.641]

斯坦福大学下属的相关研究机构有人类微生物组中心、医学院和医学与遗传学系等。2019 年,斯坦福大学的 14 个研究团队发表的十余篇“肠道菌群”相关的高水平论文被《热心肠日报》解读。斯坦福大学有不少高水平的微生物组研究团队,例如 2018 年上榜“全球十大人物”的 Justin L Sonnenburg 教授,在菌群代谢产物研究方面有颇多建树的 Michael A Fischbach 教授,以及参与主导“整合人类微生物组计划(iHMP)”的 Michael Snyder 教授等。

2019代表性论文

Michael Snyder; George WeinstockNature:多组学纵向追踪,揭示糖尿病前期的宿主和菌群特征

2019-05-29, Nature, doi: 10.1038/s41586-019-1236-x [IF: 43.07]

Michael A Fischbach; Matthew H SpitzerScience:研究肠道菌产物对宿主影响的新利器

2019-12-13, Science, doi: 10.1126/science.aav1282 [IF: 41.037]

Justin L Sonnenburg; Erica D SonnenburgScience:工业化塑造的人类肠道菌群(综述)

2019-10-25, Science, doi: 10.1126/science.aaw9255 [IF: 41.037]

如果把各个分校的研究加起来,加州大学在“肠道菌群”方面的研究成果是2019 年最多的。分开来算,加州大学旧金山分校则是最为突出的一个。设立在加州大学旧金山分校内的“陈-扎克伯格”生物枢纽,是该校“肠道菌群”研究的主要力量。2019 年,加州大学旧金山分校的年轻 PI Peter Turnbaugh 在肠道菌群的药物学和营养学领域取得了多项重要成果,被评为 2019“十大人物”。

2019代表性论文

Michael A Fischbach; Matthew H SpitzerScience:研究肠道菌产物对宿主影响的新利器

2019-12-13, Science, doi: 10.1126/science.aav1282 [IF: 41.037]

Peter J Turnbaugh; Emily P BalskusScience:肠道菌群如何代谢帕金森病药物

2019-06-14, Science, doi: 10.1126/science.aau6323 [IF: 41.037]

Peter J TurnbaughCell子刊:精准医疗中的菌群-药物互作(综述)

2019-07-10, Cell Host and Microbe, doi: 10.1016/j.chom.2019.06.011 [IF: 15.753]

圣路易斯华盛顿大学从事“肠道菌群”研究的下属机构包括医学院、基因组学与系统生物学爱迪生家庭中心等。2019 年,圣路易斯华盛顿大学的 12 个研究团队发表的 15 篇“肠道菌群”相关的高水平论文被《热心肠日报》解读,主要涉及对肠道菌群饮食干预的探索、病毒组等。其中,Jeffrey I Gordon 教授因其在肠道菌群及饮食干预方面取得的重量级研究成果入选 2019 “十大人物”。

2019代表性论文

Jeffrey I GordonScience:促进肠道菌群成熟的辅食或可治疗营养不良儿童

2019-07-12, Science, doi: 10.1126/science.aau4732 [IF: 41.037]

Jeffrey I GordonScience:含15个共变细菌的菌群“框架”,可反映肠道菌群发育程度

2019-07-12, Science, doi: 10.1126/science.aau4735 [IF: 41.037]

Jeffrey I GordonCell:新方法助力研发菌群导向性食物

2019-09-19, Cell, doi: 10.1016/j.cell.2019.08.011 [IF: 36.216]

(本榜单内容结束)

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