北京生科院提出环形RNA全长转录本重建和定量新方法
北京生命科学研究院 2019-01-24

1月19日,国际学术期刊Genome Medicine 在线发表了中国科学院北京生命科学研究院计算基因组学实验室赵方庆团队题为Reconstruction of full-length circular RNAs enables isoform-level quantification 的最新研究成果。该研究提出全新的环形转录本重构与定量的方法(CIRI-full),通过环形转录本测序中的反向重叠区特征获得全长序列,既有效解决了环形转录本内部结构的重构难题,也为环形转录本中不同剪切产物的定量提供了新思路。目前绝大多数环形RNA的功能尚未明确,并且现有方法无法提供足够充足序列特征信息,该方法可以帮助研究者更有效地筛选出具有潜在功能的环形可变剪接产物,对环形RNA的功能研究与转录本水平上的差异表达分析具有重要意义。

详见原文链接:http://www.cas.cn/syky/201901/t20190124_4677975.shtml

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专家简介
赵方庆
中国科学院北京生命科学研究院科研部副主任、研究员
中国科学院北京生命科学研究院教授
赵方庆,博士,中国科学院北京生命科学研究院“百人计划”研究员、中国科学院大学医学院岗位教授、优青基金获得者、首届北京市杰出青年基金获得者。近年来,先后主持国家自然科学基金7项(青年、面上、培育、重点和优青等)、国家重点研发计划课题3项、国防科技创新特区项目、中国科学院“科技创新交叉与合作团队”项目和中科院院长特别奖基金等。在Gut、Genome Biology、Nature Communications、ISME J、Current Biology和Nucleic Acids Res 等刊物上发表通讯作者论文40余篇,平均影响因子超过11;研究论文总引用次数超过5500次(H-index 37),其中多篇入选ESI高被引论文;参与编写中英文专著4部;连续3年荣获“中国科学院优秀导师奖”(2017,2018,2019);培养的研究生已有5人次获得“中科院院长奖”和“中科院优秀博士学位论文”。
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