郑浩+张翀:用微流控单细胞技术,解析肠道菌群的菌株多样性
热心肠小伙伴们 2022-09-02
中国农业大学郑浩团队与清华大学张翀团队合作在Microbiome发表的最新研究中,建立了一个基于微液滴的微流控平台,将蜜蜂的单个肠菌用微液滴包裹住并进行培养,这样能排除肠菌间的竞争,在培养后富集一些稀有菌株。而后通过宏基因组测序和组装得到细菌基因组,对这些基因组的分析揭示出了蜜蜂肠道菌群中潜在的新菌种,也为肠菌适应宿主的机制提供了新见解。该方法未来有望拓展为高通量培养组学技术,以及分析其他复杂菌群的多样性和功能,值得专业人士参考。

菌群分析的单细胞技术能在菌株层面拓展我们对于肠菌的认知。蜜蜂肠道菌群中包含的细菌种类有限,某些菌株拥有独特的基因组潜力和功能,这为菌株水平分析提供了一个很好的模型。中国农业大学郑浩团队与清华大学张翀团队合作在Microbiome发表的最新研究Strain-level profiling with picodroplet microfluidic cultivation reveals host-specific adaption of honeybee gut symbionts中,建立了一个基于微液滴的微流控平台,将蜜蜂的单个肠菌用微液滴包裹住并进行培养,这样能排除肠菌间的竞争,在培养后富集一些稀有菌株。而后通过宏基因组测序和组装得到细菌基因组,对这些基因组的分析揭示出了蜜蜂肠道菌群中潜在的新菌种,也为肠菌适应宿主的机制提供了新见解。该方法未来有望拓展为高通量培养组学技术,以及分析其他复杂菌群的多样性和功能,值得专业人士参考。

专家简介
郑浩
中国农业大学食品科学与营养工程学院教授
美国德克萨斯大学奥斯汀分校Nancy Moran院士实验室博士后,现任中国农业大学食品科学与营养工程学学院教授。近五年在Nature Communications、PNAS、Microbiome等杂志发表论文40余篇。现任中国昆虫学会昆虫微生物组专委会副主任、中国食品科技学会青年工作委员会委员、中国微生物学会微生物组专委会委员等。
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