锤炼1500天,热心肠也发SCI啦,秘笈大公开!
高春辉博士 2020-03-20
用好我们的重磅产品,论文写作变 easy 。

编者按:

2016 年 2 月 14 日,我们怀揣着“知识分享”的初心创办了《热心肠日报》。经过四年多的积累,日报今天已经成为一个具有一定深度、广度的和专业的“肠道菌群”研究知识库。在即将迎来日报“创刊”1500 天的日子,我们依托日报提供的便捷特性发表了第一篇 SCI 论文。今天,来讲讲这篇文章背后的故事。

最近,热心肠研究院第一次以第一作者发表学术论文了。这篇题为“Seven facts and five initiatives for gut microbiome research”的论文是以“评论”的形式发表在 Protein& Cell 杂志上的。

论文由热心肠研究院的蓝灿辉先生,李丹宜和高春辉博士,联合王军、马永慧、张发明、杨瑞馥教授等合作撰写,并受到了赵立平教授的特别支持。

说起来这篇文章,背后还有两大功臣。一个是参与“关于肠道菌群研究的 7 大事实和 5 大倡议”联署的各位“网友”,一个是我们引以为豪的产品——《热心肠日报》。

七大事实和五大倡议

关于肠道菌群研究的 7 大事实和 5 大倡议”在网上发起联署后,先后有 300 多位老师、专家学者、产业界和社会人士对文中观点表示支持,多人提议我们将文章整理发表,于是我们才决定撰写这篇论文。

在这篇论文写作的过程中,我们惊喜的发现:对于每一个需要关注的领域,在日报中都能找到相对比较详尽的中文解读,对于提炼论点很有帮助。

(注:只需要在热心肠研究院的官方网站右上角的检索框中输入想要了解的话题,点击搜索,超一万篇文献的中文解读便触手可及。)

与此同时,每一篇日报文章中还附有原文链接、延伸阅读等资源,在需要深入了解的时候可以“一键直达”。

因为《热心肠日报》提供的资源极大的方便了我们的写作,所以我们将其列为第二个“功臣”。

举例来说,当我们想要了解“肥胖”相关的研究进展时,搜索“肥胖”可以得到 1400 多条结果。这些结果关联到包括糖尿病、胰岛素抵抗、益生菌等在内的多个关键词,按不同的文章类型、发表时间,以及文章的影响因子等信息有条理的展示了出来。

如果搜索“益生元”,可以得到 500 多条结果,不仅仅包括益生元的定义、作用范围,还包括关于益生元的争论、对益生元效果的争议等论文。由此也可以看出,客观性也是日报坚持的价值观之一。

对于一些权威综述,我们还会编译“一图读懂”,用更加直观的方式展示文章的核心观点,例如下图中最后一篇文章。

即便是“母乳低聚糖”这样一个非常具体的益生元,仍然可以得到 35 条记录。包括母乳低聚糖的定义、功效、应用概述和使用母乳低聚糖干预肠道菌群的最新研究进展等。

在检索结果页,点击上方的链接,可以启用复合筛选。如下图设置可以得到 2018 年发表的,关于“肠道菌群”研究,影响因子在 40~50 之间的综述论文。

不仅如此,《热心肠日报》中的每一篇文章页面中,在短科普的内容和主编推荐语下方,还有关键词、延伸阅读和评论等功能。

关键词不仅包括研究主题,还包括知名学者的名字,点击关键词的链接,可以到达相应主题(或者对应学者)的汇总页面。

比如下面这样的关键词块中,包含“昼夜节律”,“菌群-肠-脑轴”等中文关键词,“circadian rhythm”和“Microbiota-gut-brain axis”等英文关键词,以及“John F Cryan”等作者关键词。

如果点击“菌群-肠-脑轴”,会得到相关的 53 篇日报文章。

如果点击 “John F Cryan”会得到该作者 41 篇日报文章。

延伸阅读中,我们加入了文章的原文链接,以及我们认为靠谱的中文自媒体平台的解读文章。他们的解读文章可以补充日报短科普对内容介绍可能存在的不足,展现文章的更多细节。

比如下面这篇短科普的延伸阅读中,包括了Nature 的原文链接、Nature Metabolism 的评论文章,以及微信公众号 BioArt 对文章的详细解读等内容。


Nature:果糖促进脂肪肝,菌群起了啥作用?

Nature——[IF:43.07]

① 肝脏中,酶ACLY能将果糖代谢产生的柠檬酸转化为乙酰辅酶A,为脂肪酸合成提供底物,但在小鼠肝脏中敲除该酶不能抑制果糖引起的肝脏脂肪生成;② 大剂量摄入时,肠道菌群将果糖转化为乙酸,在肝脏中被酶ACSS2转化为乙酰辅酶A,促进脂肪酸生成;③ 逐渐摄入果糖可促进其在小肠的吸收,这种情况下肝细胞中的柠檬酸裂解以及肠道菌群产生的乙酸,都参与肝脏脂肪生成;④ 果糖诱导ChREBP-β等肝脏脂肪生成相关基因的表达,不依赖于乙酰辅酶A代谢。

Dietary fructose feeds hepatic lipogenesis via microbiota-derived acetate

03-18, doi: 10.1038/s41586-020-2101-7

【主编评语】饮食中添加的蔗糖和高果糖玉米糖浆等,是膳食果糖的一个主要来源,而大量摄入果糖会增加肝脏脂肪生成,可引起脂肪肝。此前研究认为,果糖代谢产生的柠檬酸,经ATP柠檬酸裂解酶(ACLY)转化为乙酰辅酶A,为脂肪生成提供原料。然而Nature发表的一项最新研究却揭示了一种新的机制,表明果糖诱导的肝脏脂肪生成包含两方面的因素:① 肝细胞中的果糖分解诱导脂肪生成基因的表达;② 肠道菌群发酵果糖产生的乙酸,为脂肪生成提供底物乙酰辅酶A。这些发现为脂肪肝等代谢疾病中的饮食、菌群与宿主代谢之间的关系,提供了新视角。值得注意的是,酒精在体内可被转化为乙酸,而且菌群发酵膳食纤维也可产生乙酸,这些乙酸是否也参与果糖诱导的脂肪肝发生,或许值得进一步研究。(@mildbreeze)


需要说明的是,延伸阅读的添加是支持用户推荐的,点击“一键推荐好文章”按钮,用户可以将自己认为合适的文献解读提交到后台,通过审核后予以展示。

就像这样,我们可以借助于《热心肠日报》提供的工具,快速整合自己的“头脑风暴”,形成大纲和目录,并以此为基础完成文章的写作。

这就是我们将《热心肠日报》作为一个工具来提高工作效率的例子。

今天的日报,在我们的眼中已经成长为一个可以“独当一面”的可用之才。因此,我们还迫不及待地想向大家分享《热心肠日报》的成长之路。

四年如一日

《热心肠日报》是热心肠研究院最早的产品,通过 200 字的短科普对肠道菌群及相关研究的论文进行中文解读,促进学术成果的传播,帮助学生、研究人员和专业人士了解最新的研究进展。

自 2016 年 2 月 14 日我们“创刊”始,在 1400 多期的日报中,我们每天解读 8 篇英文文献。除新年间短暂休息外,从不停歇。经过 1400 多期的“持续输出”,截止今天(2020 年 3 月 20 日),《热心肠日报》已经解读了超 11111 篇文献,累计原创文字(含标题、内容、评语等)超过 450 万字。

“五个一”就像点点滴滴的积累一样,带领《热心肠日报》不断走向远方。

起于肠道菌群,岂止于肠道菌群

最初,《热心肠日报》主要关注“肠道菌群”的研究成果。后来,热心肠日报的内容不断丰富,先后加入微生态、营养饮食、免疫、肿瘤、代谢与内分泌、生物信息学、肠脑轴与神经疾病,以及其它一些常见慢性疾病的科普内容。

经过了四年多的发展,现在的《热心肠日报》不仅关注研究本身的科学价值,也关注疾病和健康,用靠谱的文献向读者倡导健康的生活方式。

通过下方的关键词词云,我们对日报涉足的主要领域有一个大体印象。在这幅图中,“肠道菌群”是当之无愧的第一名,同时“皮肤菌群”,“阴道菌群”,”口腔菌群“或者其它“菌群”也是重要成员;关注“益生菌”,“益生元”,“饮食”,“粪菌移植”,是希望能够借助这些工具调理出健康的肠道;关注“肥胖”,“炎症性肠病”,“糖尿病”,“心血管疾病”等疾病,是想要弄清菌群在这些疾病中发挥的作用。

你在其中发现了感兴趣的主题了吗?

苦读论文

每一篇《热心肠日报》的文献解读只有不到 200 字,加上主编评语通常也不会超过 400 字。但是我们努力将文献的研究背景和主要结论予以充分展示。

在日报的创作页面,下面一段话总能够提醒我们为“专业性”负责。

  • 您“创作”了一篇优秀的 200 字短科普,而不只是翻译了文献摘要;
  • 行文主谓宾定状补要规范,逻辑通畅,没有语病,让即便是非专业人士也能基本理解;
  • 没有遗漏文献中的重要观点,充分参考了摘要、简介和结论部分的内容。

在目前解读的 11000 多篇文献中,研究论文所占的比例最大,近三年的比例均在 70%以上;其次是综述性文章,不同年份的占比在 10%~26%之间;除此之外,我们也解读一些新闻、编辑评论、监管机构发布的新闻等其它内容。力图将最完整的信息以时效性比较强的方式全面展现出来。

精挑细选

要知道,在“肠道菌群”这一个日新月异的大学科内做科普创作,素材的选取本身就是一大难事。我们不单纯依靠影响因子和关键词检索的方式选材,而是在使用影响因子初步筛选之后,通过人工核查的方式来确定选材,同时还要特别关注重点期刊的新文献。

为此,有时候需要浏览 10 篇甚至 50 篇以上的文章才能找出一篇精彩的文章。但是只有这样,科普的素材才能更“有温度”。

最近几年的数据显示,日报来源文章的影响因子在总体稳定的情况下不断攀升。影响因子小于 5 分的论文越来越少,大于 10 分的越来越多,影响因子的中位数目前已经上升到 10 分以上。

从下面的图中也可以看到,以 Nature、Science、JAMA、Cell、Lancet、Gut  等为代表的顶级期刊,是日报最主力的素材来源。

“全球协作”,各有所长

为了能够创作出更多的精彩、专业的内容,我们通过 IT 系统,将来自于世界各地的创作者连接了起来,使在线协作创作《热心肠日报》成为可能。

在日报的创作者中,有的来自于清华大学、北京大学、复旦大学、浙江大学等一流综合性高校,有的来自于北京协和医院、首都医科大学、北京中医药大学、安徽医科大学等医学院校,有的来自于中国农业大学、南京农业大学、华中农业大学等农业院校,有的来自于中科院、中国农业科学院位于全国各地的研究所,除此之外,有的创作者是正在美国哈佛大学、麻省理工、英国帝国理工大学等海外知名院校学习深造的留学生。因此,说是“全球协作”并不过分。

国内的创作者们最多生活的城市分别是北京、上海、深圳、西安、成都、南昌、南京、武汉……在下面的图片中,每一个浅色的点都代表一个日报的创作者,每一个深色的点都代表两个或更多的创作者。

超三分之一的创作者拥有博士学位或博士研究生在读。他们会选取自己擅长和关注领域的论文,详细阅读并创作短科普,并通过《热心肠日报》分享自己的见解。

继续加油

热心肠研究院本身是一家盈利性的企业,但是我们对《热心肠日报》的运营始终以学术性、专业性为主要价值取向,以针对专业人士的科普作为定位开展工作。

2018 年底,由中国科协科普部主办的“科普中国·2018”互联网科普产品征集活动终选在北京成功举办。135 个互联网科普项目参与征集活动,最终有 21 个项目获得了中国科协“科普中国”的品牌支持,成为“科普中国”传播矩阵的组成部分。《热心肠日报》凭借在中国肠道领域所做的科学普及贡献,成为“科普国家队”的一员。

2019 年底,北京万方医学信息技术有限公司与热心肠生物技术研究院签订战略合作协议,双方将依托各自的优质学术资源、专业信息服务能力和平台优势,共建“万方肠道”。《热心肠日报》的优质内容将被整合进入一个面向肠道领域基础、临床工作者提供在线参考、学习的平台服务,帮助用户及时获取最前沿的科学基础研究和应用进展,从而推动整个行业的发展。

今年,日报进入第五年,我们已经建设了流动的日报创作者团队,对主编的培养也已经开始实施,而日报内容也变得更加系统,每天都会有不同的主题,同时每天的文章数目从原来的 8 篇增加的 9 篇。

只为精彩呈现

最初的日报文章,主要通过微信公众号传播。但是随着日报文章数目的不断增加,《热心肠日报》不经意间成长为肠道菌群及相关研究领域一个巨大的中文文献知识库。

为了能够快速的从这个知识库中找到自己需要的信息,我们上线了搜索功能,并不断打磨,添加筛选、关键词、延伸阅读等众多子系统,使每篇短科普不在是孤立的一员,而是与其它日报知识库中的相关内容连接成为有机的整体。

所有这一切,都是为了向我们的用户呈现更好用的检索工具。

总之,现在的《热心肠日报》是一个开放、协作、共享的肠道研究相关知识库,解读高水平外文文献,连接中文科普媒体,服务数十万专业人士。

未来,我们将持续优化日报的使用体验,并不断丰富日报的内容,向下一个 1500 天迈进。

我们相信,对于中国人来说,阅读中文始终比阅读英文要更便捷,希望我们的《热心肠日报》也能够为你的学习、科研助力。

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