刘星吟:研发微生物绝对丰度变化新方法(QMD)
热心肠小伙伴们 2023-01-19
南京医科大学刘星吟团队发表研究,提出一种基于微生物相对丰度来估计不同条件下各类群中微生物绝对丰度变化的新方法(QMD),同时作者构造了基于QMD开展组间差异菌(DA)识别的统计检验假设模型。研究表明,微生物绝对丰度组间差异可以用其相对丰度加上组间的总微生物丰度的变化来估计。QMD方法得到了真实的微生物绝对丰度变化数据的验证。与其他方法相比,QMD在微生物差异丰度定量、DA识别、运行速度上都表现出较好的性能。

南京医科大学刘星吟团队发表研究QMD: A new method to quantify microbial absolute abundance differences between groups,提出了一种基于微生物相对丰度来估计不同条件下各类群中微生物绝对丰度变化的新方法(quantification of microbial absolute abundance differences,QMD),同时作者构造了基于QMD开展组间差异菌识别(differential abundant taxa,DA)的统计检验假设模型。研究表明,微生物绝对丰度组间差异可以用其相对丰度加上组间的总微生物丰度的变化来估计。QMD方法得到了真实的微生物绝对丰度变化数据的验证。与其他方法相比,QMD在微生物差异丰度定量、DA识别、运行速度上都表现出较好的性能。

专家简介
刘星吟
南京医科大学特聘教授,江苏省特聘教授
南京医科大学肠道微生态创新团队组长
刘星吟,教授, 博士生导师,2006年获中山大学理学博士学位,2006年8月至2010年10月,先后在美国Rochester大学从事表观遗传学以及肠道微生物研究。2010-2015 在美国爱因斯坦医学院从事自闭症关联基因的表观遗传学研究。2015年10月作为高层次引进人才受聘于南京医科大学基础医学院。2016年9月被评为南京医科大学特聘教授,2016年被评为江苏特聘医学专家,2017年被评为江苏特聘教授,2018年担任南京医科大学肠道微生态创新团队的组长。2019年兼聘生殖医学国家重点实验室PI,并担任生殖医学国家重点实验室孤独症研究中心副主任。学术兼职:江苏微生物学会理事,中国医药教育协会微生态专业委员会常务委员,中国优生科学协会医学遗传学专业委员会副主任委员,同时是Science Advance, Gut Microbes,  Acta Pharmacologica Sinica 等权威期刊的专职审稿人。团队主要致力于肠道微生物与人类疾病关联的基础和临床转化研究。近五年以第一作者或通讯作者在Cell Host & Microbe, Cell Reports, Gut Microbes 等国际权威期刊发表。
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