华科宁康等:海洋宏基因组资源促进了对新蛋白质的结构和功能预测
热心肠小伙伴们 2020-02-26
华中科技大学生命学院宁康教授团队,联合软件学院薛志东教授团队和美国密歇根大学计算医学与生物信息系张阳教授团队在 Genome Biology 发表研究。

2019年11月1日,来自华中科技大学生命学院宁康教授团队,联合软件学院薛志东教授团队和美国密歇根大学计算医学与生物信息系张阳教授团队在 Genome Biology 发表研究 Fueling ab initio folding with marine metagenomics enables structure and function predictions of new protein families,利用微生物组大数据辅助预测蛋白质三维结构领域取得新突破。宁康等认为海洋微生物组包含大量独特的新基因和蛋白质,它们的序列可以用作计算“密接”关系的素材。随后证明了这种方法在预测新蛋白结构上的有效性。

专家简介
宁康
华中科技大学生命科学与技术学院教授
生物信息与系统生物学系系主任
宁康,华中科技大学生命科学与技术学院教授,博士生导师,生物信息与系统生物学系系主任。2003年本科毕业于中国科学技术大学计算机科学技术专业,2008年博士毕业于新加坡国立大学生物信息学专业,2010年于美国密歇根大学完成博士后工作。2015年开始担任华中科技大学生命科学与技术学院基于生物信息与系统生物学系系主任。是“教育部分子生物物理重点实验室”、“生物信息与分子成像湖北省重点实验室”等多个省部级实验室的管理或骨干成员。在生物信息学领域从事科研工作10余年,研究重点方向为微生物组大数据的人工智能挖掘及其在健康与环境等领域的应用。目前主持国家自然科学基金项目、科技部重大研究计划课题等。已做为通讯作者在PNAS、Nature Communications、Gut、Annals of the Rheumatic Diseases、Genome Biology、Genome Medicine、Microbiome、Briefings in Bioinformatics、Bioinformatics、Nucleic Acids Research等生物学、医学和生物信息学顶级学术期刊发表学术论文100余篇,文章总引用超过6000次,H指数40(Google Scholar)。获得软件著作权6项,申请国家发明专利20余项。入选2021-2023年全球前2%顶尖科学家“年度科学影响力”(single recent year impact)榜单。担任Genomics Proteomics Bioinformatics、Microbiology Spectrum、iMeta等国际期刊编委。担任中国生物信息学学会-基因组信息学分会副主任等;担任湖北省生物信息学会秘书长等。2022年当选中国计算机协会CCF杰出会员。已作为主编出版中英文教材和专著6本,并是6届iGEM金牌团队的指导老师。
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