《热心肠日报》解读

乔建军+郭菲+杨爱东:构建人类肠道菌群群体感应网络

Nature Communications [IF:17.694]
① 建立一个系统工作流程,包括3个模块(收集、扩展和挖掘)和基于机器学习的4个分类器,对人类肠道菌群的群体感应(QS)通讯系统进行收集挖掘;② 基于818个人类肠道微生物,构建了包含28567条去冗余QS条目的人类肠道微生物群体感应(QSHGM)数据库;③ 借助QSHGM可以预测基于QS的微生物互作,进一步建立了可视化的QS通讯网络(QSCN),并对收集整理的9大类常见的QS进行了分析。
【主编推荐语】群体感应(QS)是微生物之间交流的一种主要方式。Nature Communications近期发表了来自天津大学乔建军团队、中南大学郭菲团队、牛津大学杨爱东团队的合作研究,建立了人类肠道菌群的QS数据库(http://www.qshgm.lbci.net/)和QS通讯网络,为进一步解析肠道菌群互作、构建合成菌群和开发微生态疗法具有重要参考意义。(@mildbreeze)
Machine learning aided construction of the quorum sensing communication network for human gut microbiota
06-02, doi:10.1038/s41467-022-30741-6
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