复旦+华大:迄今最大规模的中国汉族人皮肤菌群宏基因组研究

Microbiome [IF:11.607]
① 采用宏基因组测序法检测了822个健康汉族人群面部皮肤菌群的样本,结合HMP数据,构建了首个皮肤菌群基因集iHSMGC;② 表皮葡萄球菌属是皮肤菌群耐药基因的重要来源,耐药基因的分布具有微生物特异性和部位特异性;③ 发现了中国汉族人群显著富集的一种皮肤微生物奥斯陆莫拉菌;④ 基于皮肤菌群鉴定出了2种广泛存在的皮肤亚型,分别以痤疮丙酸杆菌和奥斯陆莫拉菌为指示菌;⑤ 2种皮肤亚型表现出不同代谢功能特征,或与宿主提供的营养不同有关。
【主编推荐语】近年来,越来越多的微生物组研究将目光从肠道转向了肠外。其中,皮肤菌群备受关注。此前的研究已表明皮肤菌群对皮肤外观和皮肤健康具有重要作用。但是由于皮肤菌群的生物量较低,已发表的大多研究均采用了16S rRNA测序法。近期,复旦大学生命科学学院王久存团队与深圳华大生命科学研究院发表于Microbiome的这篇文章,采用宏基因组测序法检测了超过800个来自健康中国汉族人群面部皮肤菌群样本,分析了皮肤菌群的组成和功能特点,并提出了两种不同的皮肤亚型,加深了我们对皮肤菌群的理解。这些结果将有助于我们后续进一步探究皮肤菌群与皮肤疾病之间的关系。(@元气少女617(ꈍᴗꈍ))
Characterization of the human skin resistome and identification of two microbiota cutotypes
2021-02-17, doi:10.1186/s40168-020-00995-7

Nature展望:一图读懂皮肤菌群——人体的第二皮肤

Nature [IF:42.778]
① 皮肤表面拥有庞大而复杂的微生物生态系统,与免疫系统相互作用和调节皮肤健康;② 油性皮肤、潮湿皮肤、干燥皮肤以及脚等不同的皮肤部位拥有着多样化的微生物生态系统;③ 皮肤表层的细菌可以与细胞互作分泌抗菌肽或产生抗炎物质,加强细胞间紧密连接,加固皮肤屏障,训练免疫系统;④ 金黄色葡萄球菌产生破坏表皮屏障的酶,分泌引起免疫反应的分子,刺激肥大细胞损伤皮肤;⑤ 基因、环境和生活方式等因素可能破坏细菌的生态平衡。
【主编推荐语】除肠道微生态外,皮肤表面也驻留有细菌,构成皮肤微生态对人体的健康发挥着重要的作用。近来发表在Nature上的科普文章概括了皮肤微生态的组成和功能。尽管皮肤表面本身缺乏营养,但仍然驻留着一些细菌比如表皮葡萄球菌和痤疮丙酸杆菌等,这些细菌通过与表皮细胞的相互作用,调剂皮肤免疫功能以加强皮肤的保护功能。我们特别将配图编译为一图读懂,希望能帮你涨知识。(@Zhonghua)
The skin microbiome and its relationship with the human body explained
2020-12-16, doi:10.1038/d41586-020-03524-6

微生物抱团影响宿主:菌群比单个微生物对于皮肤的影响更大!

Microbiome [IF:11.607]
① 从健康人中的前臂、肘前窝和前额分离和培养得到的细菌作为皮肤微生物的代表菌;② 利用3D-全厚度人类皮肤组织模型,转录组结果揭示代表菌处理能够显著改变皮肤组织的细胞凋亡、增殖及细胞外基质的相关基因表达;③ 混合菌群样本处理影响了皮肤表皮层厚度,减少活跃增殖的细胞数并增加了聚丝蛋白的表达;④ 这些变化只在混合处理组显著,在单个菌处理组中没有变化;⑤ 在对宿主的影响中,皮肤微生物群的作用要大于其各部分的总和。
【主编推荐语】皮肤作为人体重量上最大的器官,寄居着许多微生物,它们同肠道菌群一样,影响着宿主的健康,然而目前对于单个菌以及菌群的互作对于皮肤的影响,仍然有很多值得我们探究的地方。Microbiome上发表的一篇文章,通过体外皮肤模拟器,发现了菌群对于皮肤细胞的凋亡,增殖,蛋白表达水平等都产生了影响,而单菌并没有菌群群落对皮肤的影响大,了解单个微生物对宿主的影响很重要,但是一个完整的微生物群落对皮肤的影响要大于其各部分的总和。(@Vera)
A mixed community of skin microbiome representatives influences cutaneous processes more than individual members
2021-01-22, doi:10.1186/s40168-020-00963-1

上海中医药大学:减肥手术减少肠道胆汁酸和脂质吸收,改善代谢

PNAS [IF:9.412]
① VSG无法改善FXR全身敲除小鼠的代谢表型,但肝脏及肠道中的FXR对于VSG诱导的代谢改善作用并非必需;② VSG通过下调肝脏FXR靶基因的表达(包括胆盐外排泵Bsep),以降低小鼠小肠中的胆汁酸水平,从而减少小肠的脂质吸收,这一过程不依赖于肝脏及肠道中的FXR;③ VSG无法显著改善Cyp27a1−/−小鼠(肠道胆汁酸水平较低,脂肪吸收较少)的代谢表型;④ 口服补充牛磺胆酸可部分逆转VSG诱导的代谢改善作用。
【主编推荐语】垂直袖胃切除术(VSG)是一种有效的减肥方法,胆汁酸可能介导了VSG的作用。来自上海中医药大学的杨莉团队与国外团队合作在PNAS上发表的一项最新研究,发现全身敲除(而非肝脏或肠道特异性敲除)胆汁酸受体——法尼醇X受体(FXR),或口服补充胆汁酸(牛磺胆酸),可抑制VSG对小鼠的代谢改善作用。机制上,VSG通过下调FXR靶基因表达,以降低小鼠小肠中的胆汁酸水平及脂质吸收,从而起到代谢改善作用。(@szx)
Vertical sleeve gastrectomy confers metabolic improvements by reducing intestinal bile acids and lipid absorption in mice
2021-02-01, doi:10.1073/pnas.2019388118

Nature Reviews:靶向脂质GPCR治疗2型糖尿病(综述)

Nature Reviews Endocrinology [IF:28.8]
① 多种刺激作用通过GPCR调节肠内分泌和胰岛激素分泌;② 脂质GPCR包括游离脂肪酸受体1 (FFA1,也称GPR40)、FFA2 (GPR43)、FFA3 (GPR41)和FFA4 (GPR120)及脂代谢特异性葡萄糖依赖性促胰岛素受体(GPR119),是胰岛和肠道激素分泌的重要调节因子;③ 许多脂质GPCR激动剂已在临床前研究中显示出对糖稳态的调控作用;④ 但脂质GPCR激动剂在临床治疗2型糖尿病是否能得到成功应用仍然面临挑战。
【主编推荐语】β-细胞及胃肠道内分泌细胞均表达多种G蛋白偶联受体(GPCR)以调节胰岛素分泌,靶向这些GPCR是开发2型糖尿病治疗药物的策略之一。Nature Reviews Endocrinology上发表的一篇综述文章,详细介绍了游离脂肪酸特异性GPCR(即脂质GPCR)的表达分布、生理功能、信号通路及天然配体,并概述了靶向这些GPCR的脂质GPCR激动剂的临床前及临床研发的情况。(@szx)
Targeting lipid GPCRs to treat type 2 diabetes mellitus — progress and challenges
2021-01-25, doi:10.1038/s41574-020-00459-w
延伸阅读: 【药渡】

Nature子刊:中枢和外围GLP-1系统独立抑制进食

Nature Metabolism [IF:N/A]
① 孤束核(NTS)的胰高血糖素原(PPG)神经元在小鼠中编码饱食感,PPGNTS神经元抑制进食但不干扰行为;② 表达胰高血糖素样肽-1(GLP- 1)受体的迷走神经传入神经元抑制进食和条件味觉回避;③ PPGNTS神经元主要从表达催产素受体,而不是表达GLP-1受体的迷走神经元接受迷走神经输入;④ PPGNTS神经元是催产素诱导,而不是GLP-1受体激动剂(GLP-1RA)诱导进食抑制所必需的;⑤ 同时激活PPGNTS神经元增强GLP-1RA semaglutide 诱导的进食抑制。
【主编推荐语】厌食肽胰高血糖素样肽-1(GLP-1)可由肠内分泌细胞和脑胰高血糖素(PPG)神经元分泌,分别定义为外周和中枢GLP-1系统。孤束核(NTS)中的PPG神经元被认为通过一个统一的肠-脑饱足回路来连接外周和中枢GLP-1系统,但缺乏相应的证据。Nature Metabolism近期发表的文章,发现孤束核(NTS)的PPG神经元编码饱足感,主要接受表达催产素的迷走神经输入,且中枢和外周GLP-1系统是独立作用,并不通过肠-脑回路进行联结。提示我们可将PPGNTS神经元激活和GLP-1受体激动剂联用,用于治疗肥胖。(@爱的抉择)
Central and peripheral GLP-1 systems independently suppress eating
2021-02-15, doi:10.1038/s42255-021-00344-4
今日Cell:迄今最大人类肠道噬菌体数据库发布
本期话题:肠道噬菌体,瘤内菌群,猪肠道微生物组,三代测序,新生儿,城市化,农药残留,糖尿病
2021-02-19
自然·综述:朱书等详述新冠的肠道感染与粪口传播
本期话题:新冠,饮食干预,生殖,肠脑轴,标志物,双向障碍,IBS,粪菌移植,大熊猫
2021-02-18
尹恝/周宏伟/何彦等GUT突破:脑卒中与肠道菌群密切相关
本期话题:肠脑轴,中风,肥胖,衰老,心血管,绿茶,咖啡,老年人,猕猴桃,钙,生物利用度,呼吸道
2021-02-10
改变教科书:肠道效应T细胞主要由微生物塑造,而非传统范式
本期话题:肠道T细胞,脊柱炎,IBD,疗效预测,益生菌,类风湿性关节炎,膳食纤维,牙周炎
2021-02-09
6项中国研究:聚焦大肠癌机理/治疗/研究方法
本期话题:大肠癌,新冠,Nod1,癌症相关细菌,免疫微环境,表观遗传,外泌体,类器官培养,纳米医学
2021-02-08
50万中国人10年随访:吃辣或降低胃肠道癌风险
本期话题:辛辣食物,水果,癌症,DASH饮食,饮食质量,肠道感染,鱼油,糖尿病,西式饮食,IBD
2021-02-07
今日Cell:肠道真菌诱导抗体,助全身抵抗真菌感染!
本期话题:肠道真菌,抗真菌免疫,可持续发展,育儿行为,乳腺癌,饮食,胰腺癌,IBS
2021-02-06
今日Science:粪菌移植+抗PD-1,再传临床抗癌好消息
本期话题:FMT,肿瘤免疫治疗,天然产物,急性胰腺炎,急性阑尾炎,GLP-1,益生菌,肥胖,肝损伤,污染物,口腔菌群
2021-02-05
一图读懂+重磅综述:2顶刊聚焦"菌群-肠-脑轴"
本期话题:菌群-肠-脑轴,高血压,斑马鱼,西式饮食,脂肪肝,粪菌移植,狮尾狒
2021-02-04
代谢疾病恶化新冠肺炎?21分综述全面解析
本期话题:新冠肺炎,糖尿病,肥胖,卫生假说,生物钟,肠道感染,肠道免疫,定植抗性,小檗碱,合成微生物组,细菌粘附
2021-02-03