衰老及肠道菌群扰动对大脑免疫系统的影响

Cell Reports [IF:8.109]
① 通过单细胞转录组测序以及表位抗原细胞鉴定的方法(CITE-Seq)揭示了年轻和老年小鼠在稳态及肠道菌群扰动时大脑免疫特征的变化;② Ly6C+单核细胞在老年小鼠大脑中起到主要促炎作用,而ILC3向ILC2转变;③ 抗生素处理显著改变了老年小鼠而非年轻小鼠的大脑ILC可塑性模式,且该变化在肠道中不可重复;④ 衰老会增加ILC样细胞表达记忆T细胞干性特征,这种特征会随着抗生素的干扰而减弱;⑤ 预示着肠道菌群紊乱在衰老性神经炎症中起到作用。
【主编推荐语】神经免疫细胞的表型及功能可塑性对于脑组织维持稳态至关重要,然而肠道菌群紊乱和衰老对于脑组织的免疫细胞的影响及机制尚不清楚。Cell Reports近期发表的一项研究,通过单细胞转录组及免疫表位同时鉴定的方法,分析了老年和年轻小鼠,以及使用抗生素治疗后小鼠的大脑免疫图谱特征,发现老年小鼠大脑中富集了更多的促炎髓源免疫细胞,且肠道紊乱只影响老年小鼠的ILC的可塑性, 该研究为肠道紊乱在年龄相关的神经性疾病中发挥的作用提供了更深的见解。(@Vera)
Multi-modal Single-Cell Analysis Reveals Brain Immune Landscape Plasticity during Aging and Gut Microbiota Dysbiosis
2020-12-01, doi:10.1016/j.celrep.2020.108438

国内团队:小檗碱改善大鼠结肠炎的菌群机制

Pharmacological Research [IF:5.893]
① BBR可显著改善DSS诱导结肠炎大鼠的病理表型,改善受损肠道屏障功能;② BBR改善结肠炎依赖于肠道菌群,BBR可以缓解DSS导致的菌群失调,并具有显著上调拟杆菌属和艾克曼菌的功能;③ BBR能够显著恢复DSS导致23个下调代谢产物中的14个,特别是改善了结肠炎所导致的色氨酸代谢的改变;④ 动物和Caco-2细胞模型均显示,BBR通过调节肠道微生物色氨酸代谢,激活色氨酸受体(AhR)通路从而改善受损肠屏障。
【主编推荐语】炎症性肠病(IBD)是目前影响人类健康的主要疾病之一,然而对于疾病致病机制的理解和临床对于疾病的干预仍然是我们面临的重大挑战。近期一篇由国内上海交通大学吕海涛与西安交通大学王嗣岑课题组联合发表在Pharmacological Research上的工作发现,植物活性成分小蘖碱(BBR)在治疗大鼠DSS诱导结肠炎中有显著的作用。BBR可以显著改善结肠炎大鼠的病理表型,改善肠屏障功能。机制研究发现BBR对于结肠炎的改善依赖于肠道菌群,BBR通过调节肠道菌色氨酸代谢,激活宿主色氨酸受体(AhR)通路,从而改善结肠炎的症状。这一发现为BBR保护肠屏障功能提供了新的机制,并为临床IBD治疗提供了新的线索。(@Zhonghua)
Berberine improves colitis by triggering AhR activation by microbial tryptophan catabolites
2020-12-04, doi:10.1016/j.phrs.2020.105358

评估IBD风险的多基因风险评分

Gastroenterology [IF:17.373]
① 纳入美国BioMe生物库队列不同族裔共29358人,通过基于外显子组和SNP的GWAS分析,构建评估IBD风险的多基因风险评分,并在其他队列中检验;② 整合多族裔数据以及常见和罕见基因变异,有助于提高预测力;③ 鉴定出不同族裔中的多个与极早发IBD相关的基因,包括ADAM17和LRBA等,并计算了其外显率;④ 非洲裔中一个主要的LRBA等位基因与LRBA和CTLA-4的表达降低相关,伴随T细胞活化,提示该基因变异可能通过增强自身免疫炎症促进IBD。
【主编推荐语】多基因风险评分(PRS)或能用于预测炎症性肠病(IBD)风险。Gastroenterology近期发表的一项研究,对大型、多种族、基于医疗系统的BioMe生物库队列中近3万人的外显子组和SNP数据进行分析,构建了评估IBD风险的PRS模型,鉴定出多个与极早发IBD相关的风险基因,特别分析了其中的脂多糖反应性米色样锚定蛋白(LRBA)基因变异与免疫细胞基因表达的关系,为预测IBD以及研究IBD发病机制和治疗靶点,带来新启示。(@mildbreeze)
Common and rare variant prediction and penetrance of IBD in a large, multi-ethnic, health system-based biobank cohort
2020-12-24, doi:10.1053/j.gastro.2020.12.034
房静远等GUT突破:具核梭杆菌增加糖酵解以促肠癌
本期话题:大肠癌,具核梭杆菌,乳酸菌,线粒体蛋白酶,早发性大肠癌,肠道干细胞,坚果,生酮饮食,卵巢癌
2020-12-28
调节菌群真能抗衰老?8分综述全面阐述
本期话题:衰老,蘑菇,晚期糖基化终末产物,油酸,亚油酸,个性化营养,升糖指数,坚果,认知功能
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9文一览:益生菌基础和临床研究新进展
本期话题:工程菌,双歧杆菌,乳酸菌,帕金森,阿尔茨海默,Hp根除,肥胖,糖尿病,益生菌封装
2020-12-26
3篇高分综述:剖析肠道菌群在肝病中的关键作用
本期话题:肠肝轴,代谢疾病,肝病,miRNA,流行病学,肝小叶,胃肠疼痛,抗菌剂
2020-12-25
赵立平携女回顾2020:菌群走向因果,回归培养!
本期话题:因果性研究,微生物单细胞RNA测序,NEC,HMO,IBS,脆弱拟杆菌,关节炎,神经炎症,共生
2020-12-24
如何加强新冠与微生物组研究?国际专家发出4大倡议
本期话题:新冠病毒,肠道感染,真菌-细菌互作,耐药基因,定植抗性,菌群-宿主互作,表冠遗传调控
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年度回顾:肠屏障与IBD的4大研究
本期话题:肠道屏障,IBD,糖基化,CD4+ T细胞,甘露糖,益生菌,钙卫蛋白,生发中心
2020-12-22
不速之客!金橙橙等纵论不同癌症里的微生物
本期话题:肿瘤微环境,胆管癌,肿瘤免疫,预后预测,慢性炎症,单细胞测序,食管鳞癌,生物材料,LINE-1
2020-12-21
Nature Outlook小专题:4文聚焦可持续营养
本期话题:可持续营养,精神健康,细胞培养肉,心血管,青少年,鸡蛋,运动锻炼,牛油果
2020-12-20
9篇17分重磅综述:聚焦菌群产学研!
本期话题:健康肠道菌群,IBD,代谢,肿瘤,慢性肝病,功能性胃肠病,儿童发育,衰老,益生菌
2020-12-19