华人团队:肝细胞癌早期检测新方法

Gut [IF:17.943]
① 利用5hmC-Seal技术获得循环无细胞DNA(cfDNA)中的5-氢氧甲基胞嘧啶(5hmC)全基因组测绘;② cfDNA样本来自2552位中国受试:1204位肝细胞癌(HCC)患者、392位慢性乙肝病毒(CHB)携带者或肝硬化(LC)患者、958位健康受试和肝脏良性病变患者;③ 依据巴塞罗那临床肝癌分期系统可精确区分早期HCC(stage 0/A)和非HCC;④ 并可高效区分早期HCC和CHB/LC病史,诊断性能优于甲胎蛋白(AFP);⑤ 该诊断模型不受吸烟、酒精摄入等干扰因素影响。
【主编推荐语】肝细胞癌患者预后效果差,原因之一在于缺乏高度灵敏和特异性诊断标志物。由复旦大学中山医院樊嘉、第二军医大学东方肝胆外科医院王红阳、美国西北大学Wei Zhang和芝加哥大学Chuan He合作主导发表于Gut的最新报道显示,通过对2552位中国受试者进行循环无细胞DNA(cfDNA)中的5-氢氧甲基胞嘧啶(5hmC)全基因组测绘及分析,开发出一项非入侵性早期肝细胞癌诊断方法,可高效诊断早期肝细胞癌且可区分早期肝细胞癌与乙肝、肝硬化病史。(@楂小夭)
Genome-wide mapping of 5-hydroxymethylcytosines in circulating cell-free DNA as a non-invasive approach for early detection of hepatocellular carcinoma
2019-07-29, doi:10.1136/gutjnl-2019-318882

国内团队:DNA损伤应答参与结直肠癌脑转移

Nature Communications [IF:11.878]
① 对19组患者匹配的脑转移(BM)、原发性结直肠癌(CRC)和癌旁组织进行全外显子组测序(WES)和全基因组测序(WGS);② BM比CRC有更多同源重组缺陷(HRD)和错配修复缺陷(MMRD)突变标签;③ DNA损伤应答(DDR)在早期原发癌出现并在BM中增多,后在相应CRC中被清除;④ BM微卫星不稳定和免疫(CD4+和CD8+ T淋巴细胞)浸润程度比CRC高;⑤ 鉴定了携带BM特异性突变相关基因(SCN7A,SCN5A,SCN2A,IKZF1和PDZRN4),或是脑转移潜在驱动基因。
【主编推荐语】结直肠癌脑转移较为罕见,但杀伤力强,目前对于脑转移的基因组景观研究较为缺乏。南京医科大学第一附属医院顾艳宏、束永前与南京医科大学沈洪兵与团队在Nature Communications发文,记录了结直肠癌脑转移进展的基因组标签,鉴定了脑转移治疗临床可控靶点及潜在驱动基因,揭示了DNA损伤应答缺陷与结直肠癌脑转移之间的潜在联系,为脑转移基因突变景观及治疗提供更多思考和理解。(@楂小夭)
Genomic signatures reveal DNA damage response deficiency in colorectal cancer brain metastases
2019-07-18, doi:10.1038/s41467-019-10987-3

国内团队:泛素连接酶促进结直肠癌转移

Oncogene [IF:6.634]
① 分析50对结直肠癌(CRC)和癌旁组织,发现TRIM65在CRC中表达上调,且与更坏预后和转移相关;② TRIM65过表达促进KM12移植瘤增殖、入侵和转移,TRIM65敲低可抑制该过程;③ TRIM65将Rho GTPase激活蛋白(GAP)ARHGAP35泛素化使之降解,增强Rho GTPase活性,促进细胞迁移;④ TRIM65通过重塑肌动蛋白和微管细胞骨架增强癌细胞迁移能力,促进其向肝、肺转移;⑤ 在CRC中磷酸化TRIM65或可削弱其致癌活性。
【主编推荐语】作为E3泛素连接酶,TRIM65在调节不同细胞甚至肿瘤进展过程中起到关键作用。中山大学第六附属医院团队在Oncogene上最新发表的文章指出TRIM65与结直肠癌转移及更坏预后相关。除此之外,该团队还发现了TRIM65新底物——ARHGAP35。ARHGAP35是一种Rho GTPase激活蛋白,被TRIM65泛素化后降解,导致Rho GTPase长期激活,从而促进细胞增殖与转移。TRIM65–ARHGAP35互做或可成为潜在的结直肠癌治疗靶点。(@楂小夭)
Ubiquitin ligase TRIM65 promotes colorectal cancer metastasis by targeting ARHGAP35 for protein degradation
2019-07-22, doi:10.1038/s41388-019-0891-6
抗生素小专题:战胜抗生素耐药的机遇和挑战
话题:抗生素,耐药性,新型疗法,耐药基因,病毒,肝移植,PPI,肠感染,过敏。
2019-08-04
《自然》:特定饮食限制或能帮助抗癌
话题:饮食干预,甲硫氨酸,鱼,大肠癌,糖尿病,维生素D,花青素,全谷,苹果菌群,食品安全
2019-08-03
《科学》:用菌群“正常”的小鼠,提升研究的转化价值!
话题:动物模型,宿主-菌群互作,猪,宏基因组学,诊断,感染,霍乱毒素,胎盘菌群。
2019-08-02
7月,最值得看的30篇肠道健康文献!
话题:2019年7月,根据“热心肠因子”计算的30篇必读文献。
2019-08-01
肠道菌群如何代谢三大营养物质?
话题:肠道菌群代谢物,生物膜,红斑狼疮,怀孕,脓毒症,呼吸道菌群,干细胞。
2019-07-31
炎症性肠病小专题:新见解与新疗法
话题:IBD,巨噬细胞,并存病,肠脑轴,scRNA-seq,抗TNF治疗,成本效益,微生
2019-07-30
关于我国高发的食道癌,你需要了解这些
话题:食道癌,结直肠癌,肝癌,类器官,胃癌,耐药,免疫治疗,乙酸代谢,脂肪细胞。
2019-07-29
除了少吃精制碳水和红肉,预防糖尿病还要在吃上注意啥?
话题:糖尿病,素食,烤肉,膳食脂肪,个性化营养,生酮饮食,辣椒,古式饮食。
2019-07-28
《自然生物技术》发表新一代微生物组分析平台QIIME 2——菌群分析步入可重复时代
回顾近10年菌群分析领域的软件和算法,认识这些推动微生物组学规律发现的幕后英雄!
2019-07-27
《科学》:免疫缺陷促肥胖?肠道菌群要背锅
话题:肥胖,免疫-菌群互作,内脏脂肪,腹部肥胖,脂肪组织巨噬细胞,胃肠蠕动,骨骼肌。
2019-07-26