Nature:肿瘤细菌多肽或为癌症免疫治疗提供新靶点

Nature [IF:42.778]
① 通过16S rRNA基因测序和HLA(人类白细胞抗原)多肽组学方法,分析9位患者的17个黑色素瘤转移瘤的瘤内菌群以及源于这些细菌的HLA呈递的多肽库;② 鉴定出41种瘤内细菌,并表明其能进入肿瘤细胞内;③ 鉴定出源自瘤内细菌的248个HLA-I和35个HLA-II多肽,这类细菌多肽可被肿瘤细胞和肿瘤内的抗原呈递细胞所呈递,并能引发T细胞免疫反应;④ 一些瘤内细菌和HLA呈递的细菌多肽,在同一患者的多个肿瘤以及在多个患者中反复出现。
【主编推荐语】肿瘤内定植的微生物可以影响肿瘤微环境,比如引发炎症反应或局部免疫抑制,从而影响机体的抗肿瘤免疫以及癌症治疗的效果。Nature最新发表来自以色列魏茨曼科学研究所团队的一项最新研究,发现源自瘤内细菌的抗原多肽可以被肿瘤细胞呈递给免疫系统,并能引起免疫反应,提示这类细菌多肽可能是一类新的肿瘤抗原,或能成为抗肿瘤免疫治疗的新靶点。(@mildbreeze)
Identification of bacteria-derived HLA-bound peptides in melanoma
2021-03-17, doi:10.1038/s41586-021-03368-8

深圳大学:消化道肿瘤免疫治疗的新靶点

Gut [IF:19.819]
① 原发性食道鳞状细胞癌(OSCC)中,WNT2+癌症相关成纤维细胞(CAFs)与激活的CD8+ T细胞呈负相关;② 抗WNT2单抗恢复肿瘤内的抗肿瘤T细胞反应,在小鼠OSCC和结肠直肠癌(CRC)同基因肿瘤模型中,anti-WNT2增加树突细胞(DC)活性,增强anti-PD-1的疗效;③ 直接敲低CAFs分泌的WNT2,可恢复DC分化和DC介导的抗肿瘤T细胞反应,抑制肿瘤生长;④ CAFs分泌的WNT2通过SOCS3/p-JAK2/p-STAT3信号通路抑制DC介导的抗肿瘤T细胞反应。
【主编推荐语】实体瘤对免疫检查点抑制剂治疗的反应较差,其中一个主要原因是抑制性的肿瘤微环境。而肿瘤相关的成纤维细胞(CAFs)是肿瘤微环境的重要组分,负向调控抗肿瘤的T细胞反应,在食管鳞癌和结直肠癌的恶性进展中有重要作用。深圳大学付利团队在Gut上发表文章,发现CAFs可以通过分泌WNT2抑制抗肿瘤免疫,靶向WNT2或可增加免疫检查点阻断疗法的效果。(@爱的抉择)
Targeting cancer-associated fibroblast-secreted WNT2 restores dendritic cell-mediated antitumour immunity
2021-03-10, doi:10.1136/gutjnl-2020-322924

缺乏血清素或可导致胃排空延迟

Gastroenterology [IF:17.373]
① 构建一种可诱导的、肠嗜铬细胞(EC)特异性的Tph1CreERT2/+小鼠,用于生成报告小鼠系Tph1- tdtom和EC减少品系Tph1- DTA;② Tph1-tdTom小鼠EC分布不均,主要分布在胃窦和近端结肠;③ 小鼠肠道存在两种EC亚群:隐窝底部的自我更新细胞和绒毛中的成熟细胞;④ Tph1-DTA小鼠表现出胃排空延迟、胃肠道运输和结肠运输变慢的症状,这些症状可通过补充5-羟色氨(5-HT)逆转;⑤ 特发性胃轻瘫病人胃窦EC数量及5-HT含量明显减少,且与胃排空率呈负相关。
【主编推荐语】胃肠道(GI)运动是由5-羟色胺(5- HT,血清素)调节的,它主要由胃肠道中的特化的肠内分泌细胞肠嗜铬细胞(EC)产生。在EC中,5-HT的合成是由限速酶色氨酸羟化酶1 (TPH1)催化的,其中TPH2是神经元特异性的TPH亚型。然而,EC来源的5-HT的确切生理作用尚未完全阐明。Gastroenterology发表的文章,利用一种新的转基因小鼠品系,研究了EC的分布以及5-HT缺乏对小鼠和人胃运动的病理生理作用,发现EC及其5-HT的缺失导致胃排空延迟和结肠运动减慢,而灌胃5-HT能挽救小鼠受损的肠道运动。此外,与健康人相比,特发性胃轻瘫患者的胃窦黏膜活检标本中5-HT含量和EC数量减少。本研究结果提示特发性胃轻瘫患者5-HT缺乏或是该病理生理机制之一。(@nana)
Serotonin Deficiency is Associated with Delayed Gastric Emptying
2021-03-01, doi:10.1053/j.gastro.2021.02.060

Nature子刊:消化性溃疡的遗传因素,及其与抑郁症的关联

Nature Communications [IF:12.121]
① 对英国生物库45万余人进行全基因组关联研究(GWAS)分析,鉴定出35个与不同消化系统疾病相关的独立SNP(含19个新的SNP);② 其中8个SNP与消化性溃疡相关,位于/邻近MUC1、MUC6、FUT2、PSCA、ABO、CDX2、GAST和CCKBR基因,这些基因之前被发现在幽门螺杆菌感染、抵抗感染相关损伤和胃分泌中发挥作用;③ 进一步分析凸显了神经系统和胃肠道之间的联系,孟德尔随机化分析提示胃肠道疾病和抑郁症可能存在双向因果关系,或多效性效应。
【主编推荐语】遗传因素被认为是导致消化性溃疡疾病(PUD)和其他胃肠道疾病的一个重要原因。近期发表于Nature Communications的研究,通过对英国生物库队列的大规模GWAS分析,鉴定出与PUD相关的8个遗传位点,揭示了PUD与其他胃肠道疾病(胃食管反流、肠易激综合征)之间的遗传相似性,并探究了胃肠道疾病与抑郁症之间的因果关系。(@mildbreeze)
GWAS of peptic ulcer disease implicates Helicobacter pylori infection, other gastrointestinal disorders and depression
2021-02-19, doi:10.1038/s41467-021-21280-7

环境和遗传,谁对口腔菌群的影响更大?

Microbiome [IF:11.607]
① 生母-孩子和养母-孩子间口腔菌群相似程度没有差异,表明宿主遗传对口腔菌群传递影响很小;② 领养的和亲生孩子的口腔菌群都更像他们自己的母亲,说明接触和环境在口腔菌群传递中的重要作用;③ 母子间共享的菌株数随儿童年龄的增加而增加;④ 阴道分娩或母乳喂养对母子间菌株相似程度没有影响;⑤ 父亲-孩子和母亲-孩子之间,口腔菌群的相似程度一致,同居夫妇比母子间表现出更大的口腔菌群相似性。
【主编推荐语】目前对影响口腔微生物群建立的因素尚不清楚。以往对同卵双胞胎和异卵双胞胎的比较研究表明,宿主遗传学在其中起着一定作用。然而,所有的双胞胎都有来自于父母的相同的一部分基因组,所以这个模型对于研究父母-孩子间口腔菌群传递的帮助作用不大。Microbiome发表的研究,通过比较生物学母亲-孩子和养母-孩子的口腔微生物群,发现宿主遗传机制在人类中是普遍共享的,因为遗传亲缘关系对微生物传播的保真度没有影响。相反,日常接触和共享的环境是微生物传播的驱动因素,这些因素的独特组合最终形成高度个性化的人类口腔微生物群。(@nana)
Acquisition of oral microbiota is driven by environment, not host genetics
2021-02-23, doi:10.1186/s40168-020-00986-8

日本鹌鹑可作为研究鸟类的宿主-菌群互作机制的模式动物

Microbiome [IF:11.607]
① 利用日本鹌鹑在应激下的皮质酮应答的个体差异,分析宿主-菌群互作位点(如肠道)的应激相关神经化学物质浓度(肾上腺素、5羟色胺等)与盲肠菌群之间的关联;② 对于在应激下具有不同的皮质酮应答的日本鹌鹑,有着显著的盲肠菌群群落结构差异,肠道结构形态及其中的神经化学物质浓度也有所不同;③ 在肠道之外(肝脏、肺部)也可观察到菌群对神经化学物质浓度的影响,提示鸟类的盲肠菌群与全身的生理功能相关。
【主编推荐语】微生物内分泌学主要研究基于神经内分泌的跨物种信号传导,为理解宿主-菌群互作的因果机制提供了框架。来自Microbiome上发表的一项最新研究,发现日本鹌鹑在应激下的皮质酮应答差异与盲肠菌群组成相关,盲肠菌群可能影响肠道及肠道之外的神经化学物质浓度,提示日本鹌鹑或可作为模式动物,用于研究鸟类的基于微生物内分泌学的宿主-菌群互作机制。(@szx)
Japanese quail (Coturnix japonica) as a novel model to study the relationship between the avian microbiome and microbial endocrinology-based host-microbe interactions
2021-02-02, doi:10.1186/s40168-020-00962-2
《柳叶刀》子刊灵魂一问:何为“肠道健康”?
本期话题:肠道健康,SCFA,维生素K,二甲双胍,Akk菌,生酮饮食,帕金森,血液透析
2021-03-17
调菌群治类风湿?16.6分自然综述详解“肠-关节”轴
本期话题:肠-关节轴,肠屏障,免疫-菌群互作,Graves眼病,Treg,神经免疫,IBD,IL-10R
2021-03-16
助癌为虐!坏细菌在大肠癌中的角色再被深度揭示
本期话题:饮食,饮酒,咖啡,热量限制,细菌性炎症,KODE,基因组成,T细胞,非甾体抗炎药
2021-03-15
芝麻:维护心血管健康的好食品?
本期话题:芝麻,咖啡,炎症性饮食,睡眠,ω-3,低蛋白饮食,天然淀粉,枸杞,营养政策
2021-03-14
最新Science:深挖致病菌如何与肠道免疫"斗智斗勇"
本期话题:宿主-致病菌互作,IgA-菌群互作,肠肝轴,脂肪肝,甜饮料,高脂饮食,肝癌
2021-03-13
今日Science:一种食品工业常用酵母阻碍肠道损伤修复!
本期话题:肠道真菌,肠组织修复,肠道干细胞,胆汁酸,糖尿病,代谢手术,血脂,罕见病
2021-03-12
今日Cell:深挖自闭症,基因/菌群分别造什么孽?
本期话题:菌群-肠-脑轴,自闭症,脊髓损伤,COPD,癌症免疫治疗,益生菌,遗传-菌群关联,抗生素
2021-03-11
从肠道角度再看新冠肺炎
本期话题:新冠肺炎,代谢组,呼吸道菌群,代糖,耐药基因,新冠相关肠道症状,肠道炎症,轮状病毒,具核梭杆菌
2021-03-10
何必拘泥活菌?再有高水平“死菌”研究发表
本期话题:细菌裂解物,肠肝轴,miRNA,放射性肠炎,乳糜泻,肠道炎症,致癌突变,IBD,TREM-1
2021-03-09
中山大学突破二连发:发现大肠癌诊疗新标记物
本期话题:转移性结直肠癌,诊断标志物,肝移植,生酮饮食,乳腺癌,食管癌,辅助化疗,大肠杆菌,线粒体,微卫星稳定
2021-03-08