Nature子刊:现代饮食和医疗系统促进艰难梭菌的演化

Nature Genetics [IF:25.455]
① 分析906株艰难梭菌的基因组,根据1322个核心基因将其分为4个进化种群PG1/2/3/4;② PG4与其它3个种群在进化上分离的更早,把PG1/2/3称为艰难梭菌分支A,PG4称为分支B;③ 两个分支的物种形成过程与核心基因的正选择有关,这些基因主要参与孢子形成和简单膳食糖的代谢;④ 与分支B相比,分支A的细菌在利用单糖(葡萄糖、果糖)时能产生更多的孢子、有更强的肠道定植能力,且其孢子对消毒剂有更强的抗性,从而更易在人群中传播。
【主编推荐语】细菌如何在演化中获得更强的宿主适应能力?Nature Genetics近期发表的研究表明,能引起常见医院感染之一的肠道细菌艰难梭菌,在进化上形成了两个主要分支,其中一个分支演化出了更多利于其在人群中传播的特性,比如有更强的抵抗消毒剂的能力,并能更好地利用现代人饮食中的简单碳水化合物(如葡萄糖和果糖)来促进自身的传播和定植,说明现代医疗和饮食习惯在艰难梭菌的演化中施加了选择压力。(@mildbreeze)
Adaptation of host transmission cycle during Clostridium difficile speciation
2019-08-12, doi:10.1038/s41588-019-0478-8

复杂的肠道菌群保护小鼠肝脏

FASEB Journal [IF:5.391]
① ASF小鼠(菌群简单)和SPF小鼠(菌群较复杂)中,通过胆总管结扎(BDL)或四氯化碳(CCl4)诱导肝纤维化,分析门静脉压力(PP)、门体分流(PSS)和组织变化;② BDL或CCl4处理后,两组小鼠的PP、PSS和肝脏胶原沉积均增加;③ 但ASF组的PP、纤维化程度和标志物表达均高于SPF组,与ASF小鼠中较高的肝脏免疫细胞活化及肠上皮紧密连接蛋白表达降低有关;④ 在晚期慢性肝病模型中,ASF小鼠的肝损伤、纤维化和门脉高压比SPF小鼠严重。
【主编推荐语】慢性肝病中存在肠道细菌移位,可引起炎症促进肝纤维化,据此推测,简单的肠道菌群或许在肝脏疾病中有保护性作用。但FASEB Journal近期发表的研究表明,拥有复杂肠道菌群的小鼠,在诱导肝损伤和肝病时,其肝纤维化程度更轻,与更好的肠道屏障功能和更少的肝脏免疫细胞活化有关,再次印证了多样化的肠道菌群的促健康作用,也为靶向肠道菌群改善肝脏疾病的干预疗法提供思路。(@mildbreeze)
Attenuated fibrosis in specific pathogen-free microbiota in experimental cholestasis- and toxic-induced liver injury
2019-08-20, doi:10.1096/fj.201901113R
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