呼吸道中的核心耐药组

American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine [IF:16.494]
① 收集慢性呼吸道疾病(严重哮喘、COPD、支气管扩张)患者及健康对照的呼吸道样本,并收集患者的吸入器样本进行宏基因组测序分析;② 呼吸道核心耐药组以大环内酯类抗生素耐药基因为主,并包括β-内酰胺、氟喹诺酮及四环素耐药基因,核心耐药组不受疾病状态及抗生素暴露的影响;③ 链球菌属与放线菌属为大环内酯类抗生素耐药基因(ermX、ermF、msrD等)的潜在储存库;④ 患者的呼吸道样本与其使用的吸入器之间,菌群及耐药组与有着显著重叠。
【主编推荐语】《American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine》上发表的一项最新研究,对患有严重哮喘、慢性阻塞性肺病(COPD)、支气管扩张等慢性呼吸道疾病的患者及健康人的呼吸道样本进行宏基因组分析,鉴定出了一类以大环内酯类抗生素耐药基因为主的核心耐药组,该核心耐药组与疾病状态及抗生素暴露无关。另外,通过对比分析患者的呼吸道样本及其使用的吸入器,发现两者之间的菌群及耐药组有着很大的重叠,提示吸入器菌群可作为替代,用于评估慢性呼吸道疾病患者的呼吸道菌群。(@szx)
Metagenomics Reveals a Core Macrolide Resistome Related to Microbiota in Chronic Respiratory Disease
2020-04-22, doi:10.1164/rccm.201911-2202OC

皮肤鳞状细胞癌或与金黄色葡萄球菌过剩有关

Cancers [IF:6.162]
① 分析13例基底细胞癌(BCC)、25例光化角质病(AK)、22例皮肤鳞状细胞癌(SCC)组织样本和28例健康皮肤样本;② 相比健康皮肤,肿瘤样本的α-多样性显著增加,丰度依次为AK>SCC>BCC;③ AK与SCC菌群组成相似,以金黄色葡萄球菌(S. aureus)为主;④ SCC为典型的晚期肿瘤,常由AK发展而来,其人β防御素2(hBD-2)表达升高与S. aureus丰度过高显著相关;⑤ 结合细胞实验证实,S. aureus过度生长可增加hBD-2表达而促进肿瘤细胞生长。
【主编推荐语】皮肤微生物群对人体健康至关重要,但其对皮肤肿瘤的作用尚不明确。最新发表在《Cancers》的研究比较了人类主要非黑素瘤皮肤癌,光化角质病(AK)、皮肤鳞状细胞癌(SCC)和基底细胞癌(BCC)组织标本的微生物群落组成。该研究发现以金黄色葡萄球菌过剩为代表的SCC中微生物群落组成的改变,可能通过调节人β防御素2(hBD-2)的表达来促进肿瘤细胞的生长。(@Lexi)
Molecular Profiling of Keratinocyte Skin Tumors Links Staphylococcus aureus Overabundance and Increased Human β-Defensin-2 Expression to Growth Promotion of Squamous Cell Carcinoma
2020-02-26, doi:10.3390/cancers12030541
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