Nature子刊:大数据分析构建药物代谢组学图谱

Nature Medicine [IF:30.641]
① 纳入18873人进行横断面研究,分析87种常见处方药与150种血浆内源性代谢物的关联;② 校正BMI、吸烟和共治疗等主要混杂因素后,鉴定出1071个药物-代谢物关联;③ 以二甲双胍和2型糖尿病为例,表明一些药物-代谢物关联实际上反映了疾病与代谢物的关联;④ 以他汀类药物为例,表明该研究的发现与纵向和遗传学观察研究的结果具有可比性;⑤ 以质子泵抑制剂(PPI)为例,表明PPI-代谢物关联与肠道菌群组成和肝脏功能有关。
【主编推荐语】Nature Medicine近期发表的一项药物-代谢物关联性大数据研究,对荷兰生物银行和生物分子资源研究基础设施(BBMRI-NL)中的10个队列进行荟萃分析,构建了一个涉及87种常见处方药与150种血液代谢物(非药物代谢物的内源性代谢物)的药物-代谢物关联性图集(http://bbmri.researchlumc.nl/atlas/),并列举了该图集的3个应用实例(二甲双胍、他汀类药物和质子泵抑制剂),包括分析药物-代谢物关联与肠道菌群的关系等。(@mildbreeze)
Integration of epidemiologic, pharmacologic, genetic and gut microbiome data in a drug–metabolite atlas
2020-01-13, doi:10.1038/s41591-019-0722-x

评估供体粪便微生物组,提高FMT安全性(观点)

Trends in Microbiology [IF:11.974]
① 粪菌移植(FMT)对多种疾病有临床疗效;② 需提高FMT安全性,以减少受者的全身感染风险(如FMT传播耐药病原体引起败血症);③ 肠道菌可与病原体、宿主互作,降低败血症风险;④ 供体粪菌除筛查病原体外,还应考虑菌群组成和结构,如菌群多样性,关键细菌种类(如产短链脂肪酸细菌),专性和兼性厌氧菌比例;⑤ 粪便处理时保护共生菌、减少病原菌可提高FMT安全性,改造粪便菌群或可降低败血症风险;⑥ 建议FMT受者采用高纤维饮食促进有益菌生长。
【主编推荐语】粪菌移植对越来越多的疾病显示临床疗效。但是最近的报道中,耐药性病原菌通过粪菌移植传递给粪菌受者,引起败血症的案例,强调了重新评估供体筛选方法和提高FMT安全性的必要。Trends in Microbiology最近发表的观点文章指出,肠道菌对感染风险有深远影响,但在供体粪便中不进行常规评估。对供体粪便的评估除筛查病原体外,还应考虑菌群组成和结构,以减少FMT受者的感染并发症,提高FMT安全性。(@nana)
Improving Risk–Benefit in Faecal Transplantation through Microbiome Screening
2020-01-15, doi:10.1016/j.tim.2019.12.009
炎症性肠病:新靶点与新思路
本期话题:炎症性肠病,AhR激动剂,血管生成,泛素化,宿主-菌群互作,肠道免疫,组织修复。
2020-01-22
糖尿病和心血管健康:聚焦菌群和代谢组学研究
本期话题:2型糖尿病,血浆脂质,肠道菌群,血浆代谢组,肠道菌群,心血管疾病,粪便脂肪酸,肥胖预测
2020-01-21
预防结直肠腺瘤复发,小檗碱或有帮助
本期话题:结直肠腺瘤,结直肠癌,小檗碱,耐药,药物递送,风险因素,UC,FFAR,肿瘤代谢,癌症转移
2020-01-20
饮酒别过度,“伤心”又促癌
本期话题:饮酒,心血管,癌症,房颤,疾病负担,茶,骨折,SCFA,饮食干预,前列腺癌
2020-01-19
群落结构形成:随机性vs决定性
本期话题:随机性,确定性,固氮,植物免疫,冠状病毒,培养基预测
2020-01-18
Science观点:慢性疾病能经菌群“传染”吗?
本期话题:非传染性疾病,血栓形成,脂多糖,真菌数据库,堆肥,饮食,关节炎,咖啡,纤维,减肥,IBS
2020-01-17
NEJM综述:详解间歇性禁食
本期话题:间歇性禁食,膳食补充剂,癌症复发,游离脂肪酸受体,膳食胆碱,血糖,Hp根除
2020-01-16
柑橘皮中或许藏着改善肥胖和代谢的新型益生元
本期话题:多甲氧基黄酮,代谢综合征,粪菌移植,克罗恩病,微生物组分析工具,代谢产物,空气污染,肝病
2020-01-15
生活方式与菌群,如何影响神经退行性疾病?
本期话题:菌群-免疫互作,小胶质细胞,神经退变,Treg,交叉反应,乳糜泻,多糖A,IgA,SCFA
2020-01-14
《自然综述》详解:大肠癌中的表观遗传学
本期话题:结直肠癌,表观遗传,风险评估,细胞自噬,促癌大肠杆菌,纳米颗粒,肝癌,食管癌,胃癌
2020-01-13