仁济医院:具核梭杆菌调控大肠癌糖酵解的新机制

Gut [IF:19.819]
① 分析33位结直肠癌(CRC)患者,发现具核梭杆菌丰度与患者糖代谢较高相关;② 具核梭杆菌通过增加CRC细胞的糖代谢(如上调糖酵解途径中的关键组分ENO1等),促进肿瘤生成;③ 具核梭杆菌通过上调转录因子SP1与lncRNA ENO1-IT1启动子区域的结合效率,激活ENO1-IT1的转录;④ ENO1-IT1可与组蛋白乙酰转移酶KAT7结合,调控其靶基因(包括ENO1)的组蛋白修饰模式,促进CRC糖代谢;⑤ CRC中,具核梭杆菌、ENO1-IT1和ENO1三者相关,且可预测患者预后。
【主编推荐语】上海交通大学医学院附属仁济医院的房静远、洪洁、陈豪燕与团队,近期在Gut上发表文章,发现具核梭杆菌和糖酵解在机制上、生物学上和临床上都与结直肠癌(CRC)具有相关性,而且具核梭杆菌通过上调长链非编码RNA——烯醇酶1(ENO1)-内含子转录物1(ENO1-IT1),调控ENO1(糖酵解途径中的一个关键组分)等基因的组蛋白修饰,影响CRC细胞的代谢重编程。这些发现提示,在具核梭杆菌丰度高的CRC病人中,靶向ENO1通路或是一种潜在的治疗策略。(@爱的抉择)
F. nucleatum targets lncRNA ENO1-IT1 to promote glycolysis and oncogenesis in colorectal cancer
2020-12-14, doi:10.1136/gutjnl-2020-322780

国内团队:揭示出与结直肠癌预后和治疗相关的分子亚型

Briefings in Bioinformatics [IF:8.99]
① 表观调控的基因表达图谱鉴定出结直肠癌四种分子亚型:② S-I,高代谢活性,对5-氟尿嘧啶等化疗预后良好;③ S-II:代谢活性中等,增殖显著,KRAS突变频繁,预后中等;④ S-III:代谢活性中等,增殖显著,启动子DNA甲基化,突变负荷高,BRAF和EGFR突变频繁,EMT和TGFβ信号中等,免疫炎症表型,对西妥昔单抗和死亡蛋白-1抑制剂敏感,预后相对较差;⑤ S-IV:miRNA过度表达,干细胞/间质样特性,缺氧,EMT和TGFβ信号高,免疫排斥表型和预后差。
【主编推荐语】天津市南开医院的吴雄志和武汉大学的Maohui Feng合作在Briefings in Bioinformatics上发表文章,发现结直肠癌病人中,DNA甲基化相关(METcor)和miRNA相关(MIRcor)基因异常的频率具有共调节特征。通过对METcor和MIRcor基因表达谱的整合聚类,从肿瘤基因组图谱中识别出CRC患者的4个分子亚型。这四个亚型具有良好的特征,并显示出明显的临床和分子特征,或为个性化医疗提供参考。(@爱的抉择)
Epigenetically regulated gene expression profiles reveal four molecular subtypes with prognostic and therapeutic implications in colorectal cancer
2020-12-10, doi:10.1093/bib/bbaa309

武汉大学团队:线粒体蛋白酶OMA1促进结直肠癌的发展

EMBO Reports [IF:7.497]
① 应激激活的线粒体蛋白酶OMA1在人类结直肠癌中上调,且被低氧所激活;② OMA1缺失抑制小鼠中AOM/DSS诱导和异种移植的结直肠癌的发展;③ 低氧激活OMA1-OPA1轴,增加线粒体ROS以稳定HIF-1α,从而促进结直肠癌细胞的糖酵解;④ 缺氧条件下,OMA1缺失促进线粒体呼吸链复合物组分NDUFB5、NDUFB6、NDUFA4和COX4L1的积累,即可能是OMA1的蛋白水解底物;⑤ 低氧条件下,OMA1抑制线粒体呼吸链复合物的组装,从而抑制结直肠癌的氧化磷酸化。
【主编推荐语】由于线粒体氧化磷酸化(OXPHOS)的不可逆缺陷,许多癌细胞维持着较强的有氧糖酵解,这种现象称为Warburg效应。但近期的研究表明大多数癌细胞都维持OXPHOS,那么癌细胞如何协调糖酵解和OXPHOS?武汉大学生命科学学院的宋质银团队在EMBO Reports发表文章,发现应激激活的线粒体蛋白酶OMA1在协调糖酵解和OXPHOS中的作用,以促进结直肠癌的发展,OMA1或是结直肠癌治疗的潜在靶点。(@爱的抉择)
OMA1 reprograms metabolism under hypoxia to promote colorectal cancer development
2020-12-13, doi:10.15252/embr.202050827

饮食如何调控肠道干细胞与大肠癌(综述)

Trends in Endocrinology and Metabolism [IF:11.641]
① 热量限制可增加Lgr5+成体肠干细胞(ISCs)数量、增殖率和再生能力;② 新西式饮食以维生素D依赖的方式削弱Lgr5+干细胞的自我更新;③ 高糖饮食可减少小鼠ISCs数量和功能,促进其向盘状细胞和杯状细胞分化;④ 高脂饮食提高了ISCs数量和再生能力,生酮饮食增加ISC数量和功能;⑤ 肠道菌群可调节ISC自我更新和分化以维持肠道内稳态,且可对饮食改变作出反应;⑥ 促进ISC活性的饮食模式或可通过增加癌症启动干细胞数量而增加癌症发病率。
【主编推荐语】食物和营养对机体健康和疾病有着深刻的影响,组织特异性成体干细胞可响应饮食信号,在协调组织维护中发挥关键作用。成体肠干细胞(ISCs)根据饮食和营养状态主动调整其命运决定,以驱动肠道适应。最新发表在Trends in Endocrinology and Metabolism的综述总结了热量摄入和营养成分、禁食模式、饮食诱导生长因子和微生物群对ISCs调节饮食反应的信号机制,以及它们与肠道肿瘤发生的相关性。(@Lexi)
Nutritional Control of Intestinal Stem Cells in Homeostasis and Tumorigenesis
2020-12-01, doi:10.1016/j.tem.2020.11.003
调节菌群真能抗衰老?8分综述全面阐述
本期话题:衰老,蘑菇,晚期糖基化终末产物,油酸,亚油酸,个性化营养,升糖指数,坚果,认知功能
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本期话题:工程菌,双歧杆菌,乳酸菌,帕金森,阿尔茨海默,Hp根除,肥胖,糖尿病,益生菌封装
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3篇高分综述:剖析肠道菌群在肝病中的关键作用
本期话题:肠肝轴,代谢疾病,肝病,miRNA,流行病学,肝小叶,胃肠疼痛,抗菌剂
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如何加强新冠与微生物组研究?国际专家发出4大倡议
本期话题:新冠病毒,肠道感染,真菌-细菌互作,耐药基因,定植抗性,菌群-宿主互作,表冠遗传调控
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本期话题:肠道屏障,IBD,糖基化,CD4+ T细胞,甘露糖,益生菌,钙卫蛋白,生发中心
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本期话题:肿瘤微环境,胆管癌,肿瘤免疫,预后预测,慢性炎症,单细胞测序,食管鳞癌,生物材料,LINE-1
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本期话题:健康肠道菌群,IBD,代谢,肿瘤,慢性肝病,功能性胃肠病,儿童发育,衰老,益生菌
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中国团队Cell子刊突破:猪为何不得糖尿病
本期话题:胆汁酸,2型糖尿病,药物研发,非酒精性脂肪肝,菌群疗法,肠道激素,胰岛素,升压素,热平衡
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