“健康”微生物组的多态多元性(综述)

Gastroenterology [IF:17.373]
① 微生物组即在机体中共生菌群基因信息的集合,含细菌、病毒和真菌。其“健康”的定义受环境、饮食及生活方式等因素影响;② 定义“健康”微生物组就要正确分类、找出核心菌群并采用离群值细化范畴;③ 如以社会工业化程度、非传播性慢性疾病风险作为指标界定工业化、非工业化菌群;④ 微生物组具功能冗余性,采用保守的功能性定义如代谢更能区分常态、非常态;⑤ 还需关注菌种特异性、生物节律、微生物组在人生进程中的进化等重要参数。
【主编推荐语】从2008年人类微生物组工程(HMP)开启至今,我们对微生物的认知越来越广泛也越来越深化。在继续推进微生物诊断、微生物疗法向临床转化前,应该更准确的给出什么才是健康肠道微生物组的定义。Gastroenterology发表的综述对此进行了探讨。显然“健康”微生物组是一个受多因素影响、多态多元的概念。不同群体都需建立相应的标准参。在这十多年的研究中,我们获得了很多已知,但还有更多已知的未知,和未知的未知需要探索。其中一个大方向在最近几篇综述中均有提及,即肠道研究从菌群组成转向菌群功能性分类。(@solo)
The Healthy Microbiome (What is the definition of a healthy gut microbiome?)
2020-11-26, doi:10.1053/j.gastro.2020.09.057
延伸阅读: 【微生态】

肠道菌群与慢性肝病综合管理(综述)

Gastroenterology [IF:17.373]
① 肠道菌群失调是所有慢性肝病(CLD)共有特征,菌群随病程(前期-进展-恶化)变化并起重要作用;② 无菌动物和粪菌移植揭示菌群是CLD同谋,其中致病共生菌决定肝脏损伤程度;③ 菌群是卓越的生物感受器,在CLD的肝-脑-肠轴中至关重要;④ 菌群和宿主在饮食、生活方式改变下继续共同进化;⑤ 饮食(如富含纤维)、益生菌治疗等或可通过调节菌群改善CLD;⑥ 微生物疗法应聚焦相关检测、肝脏移植前或危重病护理、口肠轴、个性化饮食和噬菌体疗法等。
【主编推荐语】随着肥胖、非酒精性脂肪肝和酗酒的日益增多,慢性肝病(CLD)已成为流行病,发病率及死亡率均不可小觑。Gastroenterology发表综述,讨论微生物组与CLD的相关性。CLD病因复杂,与遗传背景、并发症、社会经济因素及饮食相关,需要分而视之。举例说明,酒精性肝病和非酒精性脂肪肝在北美、欧洲常见,而非洲、亚洲则更多见乙肝病毒感染。尽管如此,肠道菌群失调却越来越被认同作为各种CLD共同点之一。这一认识有助于我们对CLD的了解,以期达到尽早诊断,综合治疗的目的。文章图文并茂,并提出了很多需要关注的问题和未来研究领域。(@solo)
Chronic Liver Diseases and the Microbiome: Translating Our Knowledge of Gut Microbiota to Management of Chronic Liver Disease
2020-11-27, doi:10.1053/j.gastro.2020.10.056
延伸阅读: 【微生态】

菌群失调或可加速衰老?(综述)

Gastroenterology [IF:17.373]
① 衰老、衰弱人群常呈现肠道菌群紊乱、免疫力下降及代谢功能失调;② 菌群失调特别是产丁酸菌减少和促炎菌增多,或可导致老年性衰弱;③ 也可能加重炎性衰老及免疫衰老,诱发阿尔兹海默症、帕金森等老年疾病;④ 使用抗生素或其它药物可引起菌群失调及多药耐药菌的产生,特别是在养老院护理系统中;⑤ 长寿人群菌群多样性高且富含产短链脂肪酸的有益菌;⑥ 关注功能性核心菌群,采用益生菌、益生元和健康饮食等手段或可调节菌群从而延缓衰老。
【主编推荐语】社会老龄化已经是一个全球现象。Gastroenterology发表的综述探讨了肠道微生物组与衰老及老年性疾病的关系。深度解析了肠道菌群失调如何影响衰老、衰弱等人类生理状态,也相应讨论了年轻化菌群是否能延缓衰老以及如何使菌群年轻化。怎样才能健康地老去?与肠道菌群又何相干?也许在阅读此篇综述的同时,也可再翻看由现代微生物学与免疫学开创元老Élie Metchnikoff撰写的《寿命延长:乐观的研究》这本书。(@solo)
Aging, Frailty, and the Microbiome: How Dysbiosis Influences Human Aging and Disease
2020-12-07, doi:10.1053/j.gastro.2020.09.060
延伸阅读: 【微生态】
中国团队Cell子刊突破:猪为何不得糖尿病
本期话题:胆汁酸,2型糖尿病,药物研发,非酒精性脂肪肝,菌群疗法,肠道激素,胰岛素,升压素,热平衡
2020-12-18
年度回顾:肠道与行为互作的3大发现
本期话题:肠脑轴,内源性大麻素,酒精滥用,肠神经系统,单细胞测序,交感神经,菌群培养,口腔菌群
2020-12-17
NEJM+BMJ不约而同:说透“胃食管反流”
本期话题:胃食管反流,电针灸,便秘,运动员,短链脂肪酸,儿童肥胖,共进化,肠道致病菌,益生菌
2020-12-16
魔高一尺:3文聚焦肠道致病菌如何攻破宿主免疫防线
本期话题:肠道致病菌,亚硝酸盐,营养免疫,食物过敏,自身免疫疾病,IBD,自噬,定殖抗性,菌群-免疫互作
2020-12-15
从益生菌到3D打印,7文一览中国消化道肿瘤新研究
本期话题:3D打印,肠道真菌,视黄酸,乳杆菌,益生菌,聚合物胶束,大肠癌EMT,外泌体,回肠免疫张力,大肠癌筛查
2020-12-14
分析8500+中国中年人:多吃水果,菌群多样,血糖更好
本期话题:水果,蔬菜,2型糖尿病,乳腺癌,维生素K2,含糖饮料,虚弱,脂肪,吸烟,饮酒,ω-3,蛋白尿,生酮饮食
2020-12-13
子刊火力全开:9文聚焦微生物组数据挖掘
本期话题:人体菌群、CRISPR、深度学习、小蛋白注释、细菌基因组、基因编辑、代谢组学、建模、anti-CRISPR、元数据库、网络分析
2020-12-12
今日Science:粪菌移植+PD-1疗法,临床抗癌传好消息
本期话题:癌症免疫治疗,FMT,循环细菌DNA,肥胖,胆汁酸合成,环境污染物,抗生素
2020-12-11
3篇高分论文:利用宏观生态学原理研究菌群渐入佳境
本期话题:微生物生态学,功能冗余性,宏观生态学,肠脑轴,抑郁症,焦虑,膳食纤维,帕金森,食欲,纳米医学
2020-12-10
Lancet权威综述,读懂缺铁和补铁
本期话题:缺铁,代谢紊乱,高血脂,高血压,心血管疾病,乳糖不耐,营养补充剂,高脂饮食,肥胖
2020-12-09