Science子刊:增加托儿所的自然微生物多样性,或能改善儿童免疫调控

Science Advances [IF:13.116]
① 纳入10个托儿所共75名儿童,4个进行28天的生物多样性干预(用森林地被物/草皮覆盖院子)、3个不干预(阴性对照)、3个每天带孩子去森林玩(阳性对照);② 生物多样性干预增加了儿童的皮肤细菌多样性(尤其是变形菌),使其趋近于阳性对照组,而不干预组的变形菌多样性逐渐降低;③ 皮肤γ变形菌多样性增加与血液TGF-β1水平和调节性T细胞比例的升高相关;④ 干预增加了儿童血液中的IL-10(抗炎细胞因子)/IL-17A(促炎细胞因子)的比值。
【主编推荐语】生命早期是免疫系统发育的关键时期,在这一时期增加环境微生物的暴露,或能通过调节共生菌群来改善免疫功能。Science Advances最新发表了一项来自芬兰的干预性研究,表明旨在增加托儿所环境中的自然微生物多样性的干预措施,能改变儿童的皮肤和肠道菌群,并增强免疫调节功能,或许有助于降低城市儿童未来发生免疫相关疾病的风险。(@mildbreeze)
Biodiversity intervention enhances immune regulation and health-associated commensal microbiota among daycare children
2020-10-14, doi:10.1126/sciadv.aba2578
延伸阅读: 【Medical Xpress】

Nature子刊:三代长读长宏基因组序列组装新方法metaFlye

Nature Methods [IF:30.822]
① 与碎片化短读长组装相比,长读长测序技术能大大改善了许多分离细菌基因组的组装;② 作者最近开发了一种快速的长读长基因组组装程序Flye,并证明它可以产生准确且连续的组装;③ 使用模拟细菌群落对metaFlye进行了基准测试,结果表明与最先进的长读长组装程序相比,它始终可以产生具有更好完整性和连续性的组装;④ 基于人类微生物组的长读长测序进行装配,可以发现编码生物医学上重要天然产物的全长生物合成基因簇。
【主编推荐语】长读长测序技术已大大改善了许多筛选的细菌基因组的组装。但最先进的长读长组装软件,仍然很难装配出复杂的宏基因组数据集。在这里,作者介绍了metaFlye,它解决了重要的长读长宏基因组组装难题,例如细菌组成不均和种内异质性,并表明它可以产生准确且连续的装配。作者使用各种模拟的和真实的细菌群落对其进行基准测试,证明了它比最新的长读长装软件Canu,FALCON,miniasm,OPERA-MS和wtdbg结果都更好。(@刘永鑫-中科院-宏基因组)
metaFlye: scalable long-read metagenome assembly using repeat graphs
2020-10-05, doi:10.1038/s41592-020-00971-x

中山大学:间歇性禁食改善代谢综合征的心血管风险因素和肠道菌群

Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism [IF:5.399]
① 招募39名代谢综合征(MS)患者,随机分成间歇性禁食组(IF)和对照组,IF组在禁食日要比不禁食日减少69%的热量摄入;② 8周后,IF组显著降低脂肪含量,改善氧化应激,调控炎症细胞因子,改善血管舒张参数,不影响血脂、葡萄糖代谢或血压;③ IF诱导肠道微生物群落发生显著变化,增加短链脂肪酸(SCFAs)的产生,降低循环性脂多糖的水平;④ IF组的肠道菌群改变与心血管风险因素显著相关,并导致肠道菌群的碳水化合物代谢途径发生明显变化。
【主编推荐语】中山大学夏敏团队在Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism上发表文章,揭示出间歇性禁食一定程度上引起代谢综合征患者肠道微生物群落和功能途径的显著改变,这与心脏代谢风险因素的缓解密切相关。研究或为预防代谢综合征相关的不良后果提供了潜在机制。(@爱的抉择)
Intermittent Fasting Improves Cardiometabolic Risk Factors and Alters Gut Microbiota in Metabolic Syndrome Patients
2020-10-06, doi:10.1210/clinem/dgaa644
延伸阅读: 【梅斯】

国内团队:富硒食用农产品的效益-风险评估

Journal of Hazardous Materials [IF:9.038]
① 对中国10个地区的普通和富硒食用农产品中的硒及相关金属含量进行检测;② 富硒农产品的硒检出率和硒含量均高于普通农产品;③ 二者相关金属的检出率一致,但富硒的大米、面粉、食用菌藻、肉和茶的含量更高;④ 增加富硒农产品的摄入可使所有人群的实际硒摄入量达到各自的日推荐摄入量;⑤ 18岁以下人群的铬摄入量超过暂定每日耐受摄入量(PTDI),而砷和镉摄入量接近PTDI;⑥ 日常膳食中硒、铬、砷和镉的主要来源分别是肉、食用菌藻、大米、大米。
【主编推荐语】硒是人体必需的微量元素。通过膳食富硒食用农产品是当前预防硒缺乏症的有效途径,但过量摄入硒会造成硒中毒等多种潜在的安全风险。我国是硒资源大国,富硒食用农产品分布广、品种多、产量大,因此对相关产品的精准追踪和风险评估,对居民膳食营养和产业发展具有极其重要的指导意义。来自浙江大学馥莉食品研究院的陆柏益团队和江苏省农业科学院农产品质量安全与营养研究所刘贤金团队发表在Journal of Hazardous Materials上的一项研究,通过大数据精准测量了我国10个地区2756份普通和4894份富硒食用农产品样品中的硒及其相关金属的含量情况,并通过效益-风险评估实验对不同人群相关金属的摄入量进行了评估。该研究进一步支持了通过摄入富硒食用农产品能有效补充硒,但也强调了富硒食用农产品伴生相关金属的潜在风险,特别是重金属铬。(@EADGBE)
Benefit–risk assessment of dietary selenium and its associated metals intake in China (2017-2019): Is current selenium-rich agro-food safe enough?
2020-06-17, doi:10.1016/j.jhazmat.2020.123224
新老药物与机制,5项研究关注IBD治疗最新进展
本期话题:IBD,Cobiolimod,巯嘌呤,托法替尼,工程菌,蓝莓,乳糜泻,IEL,肠道病毒感染
2020-10-14
曹崟团队GUT发文:代谢失衡,肠癌易发!
本期话题:代谢疾病,早发性大肠癌,小檗碱,肝纤维化,胆汁酸,心血管,乳化剂,肠炎,神经痛,纤维肌痛
2020-10-13
巧用益生元和益生菌对抗大肠癌,武大团队报道新方法
本期话题:益生菌/元,mRNA疫苗,PTPN2,ctDNA,TP53,银屑病,结直肠癌,胃癌,口腔癌
2020-10-12
喝茶能防癌吗?纳入113项研究的综述给出积极提示
本期话题:茶,皮肤癌,乳腺癌,急性冠脉综合征,咖啡因,油菜籽,电子屏幕,n-3 PUFA,膳食纤维
2020-10-11
疾病不同,"坏"菌群却相似?中国大样本分析发表
本期话题:菌群与疾病,遗传,中草药,益生菌,细菌素,抗生素,耐药组,肠道组织修复,幽门螺杆菌
2020-10-10
肝硬化患者如何避免营养不良?20分期刊发出关键指导
本期话题:肝病,营养管理,病毒组,色氨酸代谢,β-葡聚糖,蜜蜂,单细胞组学,肠道涂层,雄性激素,产气
2020-10-09
今日Cell+Nature:三文聚焦肠道,关注感染/类器官/IBD
本期话题:内源性大麻素,类器官,IBD,肠神经,瘤胃菌群,二氧化钛纳米颗粒,肠屏障,丙肝病毒
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越胖记性越差?肥胖或通过菌群损伤记忆
本期话题:菌群-肠-脑轴,记忆,衰老,松果体,胃肠功能紊乱,便秘,IBS,补充剂,饮食干预
2020-10-07
新冠患者为何"复阳"?朱书等警示病毒或潜伏于肠道
本期话题:新冠,IBD,疫苗,胃肠道并发症,肠屏障,社交距离,长链脂肪酸,果糖,免疫治疗
2020-10-06
肠镜查癌,40岁应该做?AJG发出坚实数据
本期话题:大肠癌,筛查,饮食,预后预测,癌症转移,基因型,治疗靶点,致癌蛋白磷酸酶,食管癌,皮肤癌
2020-10-05