港大团队等:利用肠道菌群的组成与功能预测患者肿瘤治疗的应答

Microbiome [IF:11.607]
① 26名不同类型的肿瘤患者,15名接受化疗或靶向治疗,11名接受化疗或靶向治疗+免疫疗法;② 对肿瘤治疗应答的患者的肠道菌群多样性更高,与不应答患者相比,肠道菌群组成显著不同;③ 应答患者的合成代谢通路富集,不应答患者的分解代谢通路富集;④ 综合治疗前的肠道菌群组成与功能,可较准确地预测患者的应答(AUC=0.895);⑤ 卵形拟杆菌及解木聚糖拟杆菌与肿瘤治疗的结果呈正相关,口服灌胃这两种细菌可在肺癌小鼠模型中提高厄洛替尼的疗效。
【主编推荐语】多项研究表明肠道菌群可能影响肿瘤治疗的疗效。Microbiome上发表的一项由香港大学徐爱民和Gianni Panagiotou团队参与主导的最新研究,在26名患有不同类型的肿瘤患者中发现,对治疗产生应答的患者的肠道菌群多样性、组成及功能均显著不同于不应答的患者。同时,在应答患者中显著富集的2个菌种可显著提升靶向治疗药物——厄洛替尼在肺癌小鼠模型中的疗效。另外,结合治疗前的肠道菌群组成与功能,并基于机器学习算法的模型,可较准确地预测患者对于肿瘤治疗的应答情况。(@szx)
Predictable modulation of cancer treatment outcomes by the gut microbiota
2020-03-05, doi:10.1186/s40168-020-00811-2

Nature子刊:致癌突变重组大肠癌细胞信号网络

Nature Communications [IF:12.121]
① 分析结直肠癌(CRC)细胞中KRAS常见致癌突变(KRASG13D)如何影响蛋白-蛋白互作网络(PPIN)结构和表皮生长因子受体功能;② 分析6000多组PPIs发现,该互做网络在表达转化水平KRASG13D的细胞中广泛重组;③ 蛋白表达和磷酸化变化等多因素驱动PPIN重组,高/低亲和力KRAS互作体的结合动力学有助于重组;④ PPIN重组改变蛋白复合物的组成、信号流、转录调控和细胞表型;⑤ 广泛重组PPIN节点上的遗传改变常发生在CRC中,是患者不良预后的指标。
【主编推荐语】蛋白-蛋白相互作用网络(PPINs)组织基本的生物学过程,但是致癌突变如何影响这些相互作用以及它们在网络水平的功能尚待研究。最新发表在Nature Communications的研究分析了结直肠癌(CRC)细胞中KRAS常见致癌突变(KRASG13D)如何影响蛋白-蛋白互作网络(PPIN)结构,以及如何影响表皮生长因子受体功能。该研究发现在KRASG13D突变CRC细胞中,PPIN发生广泛重组,改变了蛋白复合物的组成、信号流、转录调控和细胞表型。值得注意的是,广泛重组PPIN节点上的遗传改变在CRC中频繁发生,是患者预后不良的指标。(@Lexi)
Extensive rewiring of the EGFR network in colorectal cancer cells expressing transforming levels of KRASG13D
2020-01-24, doi:10.1038/s41467-019-14224-9
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复旦团队:大肠杆菌黏附蛋白或能辅助癌症免疫治疗

Nature Communications [IF:12.121]
① 大肠杆菌黏附部分FimH蛋白在小鼠体内可诱导Toll样受体4依赖的、髓样分化蛋白2不依赖的树突状细胞(DCs)成熟;② FimH与抗原(鸡卵清白蛋白,OVA)联合治疗可促进抗原特异性免疫激活,促进T细胞增殖、IFN-γ和TNF-α产生、效应T细胞的肿瘤浸润,并抑制小鼠体内黑色素瘤生长;③ 抗PD-L1抗体联合FimH治疗能有效抑制BALB/c小鼠CT26移植瘤生长;④ FimH可促进人外周血中DC的活化,以及同系T细胞的增殖和活化。
【主编推荐语】利用树突状细胞(DCs)的成熟诱导抗原特异性免疫激活是癌症免疫治疗的一种策略。来自上海复旦大学和韩国岭南大学的Jun-O Jin研究团队最新发表在Nature Communications的研究发现,大肠杆菌黏附部分FimH蛋白可诱导树突状细胞(DCs)成熟,因此导致T细胞增殖分化。FimH与抗原(鸡卵清白蛋白,OVA)联合治疗可促进抗原特异性免疫激活,并抑制小鼠体内黑色素瘤生长,FimH也可与抗PD-L1抗体联用抑制BALB/c小鼠CT26移植瘤生长。此外,FimH可促进人外周血中DC的活化以及同系T细胞的活化和增殖。该研究表明FimH是一种有潜力的癌症免疫治疗辅助剂。(@Lexi)
Escherichia coli adhesion portion FimH functions as an adjuvant for cancer immunotherapy
2020-03-04, doi:10.1038/s41467-020-15030-4
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武大人民医院团队:计算机辅助结肠镜检,提高腺瘤检出率

Lancet Gastroenterology & Hepatology [IF:14.789]
① 704名患者随机分为2组,355名接受ENDOANGEL系统辅助的结肠镜检查,349名接受普通结肠镜检查;② 在意向治疗分析中,ENDOANGEL组患者的腺瘤检出率显著高于对照组;③ ENDOANGEL组的患者中有16%检测到了一个或多个腺瘤,而对照组的患者中的这一比例仅有8%;④ 按试验方案分析的结果类似,ENDOANGEL组的患者中有17%检测到了一个或多个腺瘤,而对照组的患者仅有8%;⑤ 试验期间未发生不良事件。
【主编推荐语】来自武汉大学人民医院的于洪刚团队在Lancet Gastroenterology & Hepatology上发表的一项随机对照研究结果,利用一种基于深度神经网络及感知哈希算法开发的实时计算机辅助系统——ENDOANGEL以辅助结肠镜检查,在700多名接受结肠镜检的患者中,相对于普通的结肠镜检查,ENDOANGEL系统辅助下的结肠镜检查可显著提升腺瘤检出率,且安全性良好。(@szx)
Detection of colorectal adenomas with a real-time computer-aided system (ENDOANGEL): a randomised controlled study
2020-02-22, doi:10.1016/S2468-1253(19)30413-3

天津总医院团队:高脂饮食如何促进大肠癌发生?

Journal of Cellular and Molecular Medicine [IF:4.486]
① 临床研究发现高脂饮食(HFD)增加进展期结直肠肿瘤发生率;② HFD患者单核细胞趋化蛋白1 (MCP‐1)、CC趋化因子受体2 (CCR2)、CD163表达明显高于正常饮食患者;③ HFD诱导Apcmin/+小鼠肠道菌群失调,激活MCP‐1/CCR2轴,招募并极化M2肿瘤相关巨噬细胞,促进肠道癌变;④ 移植HFD小鼠粪菌可诱导正常饮食Apcmin/+小鼠MCP‐1/CCR2轴激活,增强致癌作用而不增加体重;⑤ 抗生素可抑制HFD的致癌作用;⑥ 调节肠道菌群或可通过MCP‐1/CCR2轴防治结直肠癌。
【主编推荐语】高脂饮食(HFD)是一个众所周知的肠道菌群失调和结直肠癌(CRC)危险因素。然而,有关HFD、肠道菌群和致癌作用的证据较为有限。来自天津医科大学总医院的曹海龙和王邦茂研究团队最新发表在Journal of Cellular and Molecular Medicine的研究揭示了HFD增加进展期结直肠癌(CRC)的发生率,并探索了其详细机理。该研究表明,HFD诱导的生态失调通过激活MCP‐1/CCR2轴加速了肠腺瘤‐腺癌顺序发生,为更好地理解HFD相关CRC的机制和预防提供新的见解。(@Lexi)
High‐fat diet‐induced dysbiosis mediates MCP‐1/CCR2 axis‐dependent M2 macrophage polarization and promotes intestinal adenoma‐adenocarcinoma sequence
2020-01-19, doi:10.1111/jcmm.14984

2020年美国大肠癌综合统计

CA - A Cancer Journal for Clinicians [IF:292.278]
① 2020年结直肠癌(CRC)确诊病例将达~147950例,死亡人数将达~53200;② 2012-16年发病率(人/100000人)亚太裔最低(30),阿拉斯加州原住民最高(89);③ 2011-16年,>50岁人群发病率年降1-3.3%(与年龄段相关),<50岁人群年增加2.2% ,非拉丁裔白人增幅最大;④ 2008-17年,>50岁人群死亡率年降0.6-3%(与年龄段相关),<50岁人群年上升1.3%,黑人各年龄段降幅最大;⑤ 通过增加指南推荐的筛查和高质量治疗,可加速CRC的防控进展。
【主编推荐语】最新发表在200分的“神刊”CA - A Cancer Journal for Clinicians的文章,提供了当前美国结直肠癌(CRC)统计的全面概述。根据2016年发病率数据和2017年死亡率数据,预估出2020年按年龄划分的新增病例和死亡人数、按年龄和种族/民族划分的发病率、存活率和死亡率及其趋势。CRC发病率和死亡率趋势在一定程度上反映了CRC筛查的实施情况。通过增加指南推荐的筛查和高质量治疗,可加速CRC的防控进展。该文章数据非常全面,由于篇幅限制,我们的短科普只摘取主要信息,强烈推荐感兴趣的读者阅读原文了解更多。(@Lexi)
Colorectal cancer statistics, 2020
2020-03-05, doi:10.3322/caac.21601

食管癌诊断:人工智能vs内镜专家

Gastroenterology [IF:17.373]
① 数集4中,深度学习计算机辅助检测(CAD)系统将图像分为包含肿瘤或非结构异常的巴雷特食管(BE),准确率89%,敏感性90%,特异性88%;② 数集5中,CAD系统vs普通内窥镜师:准确率88% vs 73%,敏感性93% vs 72% ,特异性83% vs 74%;③ CAD比所有参与的53位非专业内窥镜医师精度更高,并具有相似的描绘性能;④ 数集4、5中,CAD与BE专家对所有病变区域的描述重叠率为88%;⑤ 数集4、5中,CAD分别确定97%和92%的病例中活检最佳位置。
【主编推荐语】最新发表在Gastroenterology的一项研究,开发并验证了一个混合的ResNet-UNet模型深度学习计算机辅助检测(CAD)系统,使用了5个独立的内窥镜数据集,并使用从所有肠段收集的494364张标记内镜图像进行训练。其目的在于优化内镜对巴雷特食管(BE)患者早期肿瘤的检测。该CAD系统的准确率、敏感性、特异性均比普通内窥镜师高,且与BE专家对病变区域的描述高度重叠。此外,CAD还能确定病例中活检的最佳位置。(@Lexi)
Deep-Learning System Detects Neoplasia in Patients With Barrett’s Esophagus With Higher Accuracy Than Endoscopists in a Multistep Training and Validation Study With Benchmarking
2019-11-21, doi:10.1053/j.gastro.2019.11.030
延伸阅读: 【Medical Xpress】
鸡蛋、鱼油、n-3脂肪酸,与心血管疾病
本期话题:鸡蛋,鱼油,n-3脂肪酸,全谷物,土豆,碳水化合物,亚油酸,人工甜味剂,海参肽
2020-03-08
多个角度看肥胖
肥胖与衰老,双胞胎研究,谷氨酰胺,肠道菌群,青少年肥胖,TMAO与冠心病, T2D药物,厌食
2020-03-07
促心血管疾病的新型肠菌代谢物,再登Cell
本期话题:心血管,菌群代谢物,NAD,工程益生菌,甜味剂,牛奶,VB12,乳糜泻,肠道类器官,肥胖
2020-03-06
膳食纤维保护心血管,肠道菌群来助力
本期话题:膳食纤维,心血管,菌群代谢物,素食,生热,血糖,药物代谢,茶多酚,PCOS,黑精,橙汁
2020-03-05
囤积脂质还是消耗掉?且看肠道菌如何与肠细胞沟通交流
本期话题:菌群代谢物,帕金森,PPI,功能性胃肠病,胃食道反流,谷蛋白敏感,胃肠上皮化生,肠衰竭
2020-03-04
《自然·综述》聚焦:菌群与免疫的对话,如何调控肠道健康
本期话题:菌群-免疫互作,TLR,菌群代谢产物,IBD,次级胆汁酸,免疫细胞,HIV,肠屏障,抗菌肽
2020-03-03
大肠癌微生物组,如何从宏组学走向机制研究?
本期话题:大肠癌,癌症基因突变,促癌细菌,类器官,放疗,胃癌,慢性炎症,肠道干细胞
2020-03-02
2月,最值得看的38篇菌群与肠道健康文献!
本期话题:2020年2月,根据“热心肠因子”计算的38篇必读文献。
2020-03-01
肠道菌群临床研究登上NEJM & 益生菌小专题
本期话题:骨髓移植,预后预测,益生菌,营养不良,急性胃肠炎,便秘,餐后血脂,帕金森,脂肪肝,抗肿瘤
2020-02-29
《科学》:孕期饮食和肠道菌群,如何影响后代长期代谢健康?
本期话题:孕期肠道菌群,代谢,热量限制,衰老,小RNA,钠盐,心血管,饮酒,阿尔茨海默,茶
2020-02-28