郑钜圣+陈裕明+王军:看似不同的疾病,却可能有相似的菌群特征

Microbiome [IF:11.607]
① 纳入1475名中国人进行微生物组GWAS分析,并在另199人中验证,鉴定出多个受遗传影响的菌群成员,以及相关基因位点;② 双向孟德尔随机化分析表明,肠道菌群与疾病之间有复杂的因果关系,比如Saccharibacteria或能通过影响肌酐水平和肾小球滤过率来改善肾功能,而房颤、慢性肾病和前列腺癌则可能影响特定细菌类群的丰度;③ 分析不同疾病的菌群特征发现,帕金森病与结直肠癌之间、系统性红斑狼疮和慢性粒细胞白血病之间,具有相似的菌群特征。
【主编推荐语】疾病与菌群之间的因果关系是菌群研究的一大焦点。Microbiome最新发表了西湖大学郑钜圣、中山大学陈裕明和中科院微生物所王军与团队的研究,在中国人群中分析了遗传对肠道菌群的影响,然后通过双向孟德尔随机化分析,研究了人肠道菌群与复杂疾病之间的因果关系,并根据菌群特征的共性和特性对不同疾病进行了聚类,发现一些看似不同的疾病,可能有着相似的菌群特征,提示这些疾病之间可能在病因机制上存在关联。(@mildbreeze)
The interplay between host genetics and the gut microbiome reveals common and distinct microbiome features for complex human diseases
2020-10-08, doi:10.1186/s40168-020-00923-9

赖信志等:从肠道菌群角度解析中药功效(综述)

Protein & Cell [IF:10.164]
① 中草药成分被肠道菌群转化代谢而赋予新的功能活性、生物利用度,也可生成有毒代谢物;② 中药成分影响菌群的丰度和多样性,菌群组成改变与宿主免疫和代谢活动密切相关;③ 草药多糖被肠道菌群降解/发酵产生低聚糖和SCFA等,能促进有益菌生长并调节宿主生理;④ 中药可影响参与氨基酸和脂质代谢的肠道细菌及其代谢物,发挥治疗作用;⑤ 一些中药小化学分子经菌群转化后生物活性增强;⑥ 使用基于菌群的多组学研究平台,可鉴定新型中药活性代谢物。
【主编推荐语】近年研究表明,肠道菌群与中药活性成分的互作,在发挥中药疗效中有重要作用。Protein & Cell近期发表了来自台湾长庚大学赖信志团队的综述,从中药多糖、氨基酸代谢、脂质代谢以及小分子化合物等角度,总结了菌群与中药活性成分的相互作用,并提出了使用基于菌群的多组学平台研究中药衍生的活性代谢物的路线图,推荐专业人士参考。(@mildbreeze)
Role of gut microbiota in identification of novel TCM-derived active metabolites
2020-09-15, doi:10.1007/s13238-020-00784-w

Nature子刊:鉴定能减少致病菌定植的肠道共生菌

Nature Communications [IF:12.121]
① 使用单细胞稳定同位素探测、拉曼激活细胞分选和宏基因组学方法,从小鼠菌群中鉴定能利用黏蛋白单糖的肠道共生菌;② Muribaculaceae菌科成员是黏蛋白单糖的主要利用者,毛螺菌科、理研菌科和拟杆菌科中也有能利用黏蛋白单糖的成员;③ 构建能利用唾液酸和N-乙酰氨基葡萄糖的共生菌群落(含5个菌株),能在体外有效抑制同样利用黏蛋白单糖的艰难梭菌生长,并阻碍艰难梭菌在抗生素处理的小鼠中定植。
【主编推荐语】包括艰难梭菌在内的很多肠道致病菌,能用肠道黏液中的糖作为养料来生长。因此,使用占据同样生态位(利用黏蛋白单糖)的共生菌去挤占致病菌的生存空间,是潜在的微生态治疗策略。Nature Communications发表的一项最新研究报道了一种方法,在小鼠中鉴定出能利用黏蛋白单糖的多种共生菌,并从中挑选构建了混合菌株群落,能有效抑制艰难梭菌的生长和定植。该研究中使用的一些思路和方法,或能为研发新型益生菌/活菌疗法提供参考。(@mildbreeze)
Rational design of a microbial consortium of mucosal sugar utilizers reduces Clostridiodes difficile colonization
2020-10-09, doi:10.1038/s41467-020-18928-1
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