蔺蓉等GUT：新型内镜胶囊突破肠道无创采样难题

蔺蓉团队：可无创获取肠道生物信息的新型胶囊内镜

① 开发一种新型磁控采样胶囊内窥镜（MSCE），用其采集模型猪的肠内容物，分析微生物组和代谢组，并与手术采样的分析结果比对验证；② MSCE能通过可视化方式，方便、无创、准确地获取不同区域（空肠、回肠）和不同疾病状态下（健康vs抗生素腹泻）的肠内容物，成功率很高，且取样后密封良好无污染；③ 与手术采样对比表明，使用MSCE取样可以准确得到疾病相关的肠道菌群和代谢物丰度数据；④ MSCE或能在疾病的预防、诊断和治疗中发挥重要作用。

Novel scheme for non-invasive gut bioinformation acquisition with a magnetically controlled sampling capsule endoscope

2021-01-15, doi:10.1136/gutjnl-2020-322465

胶囊内镜取样肠道菌群代谢组 Rong Lin Zhen Ding Weijun Wang Kun Zhang

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Nature 子刊：拟杆菌对复杂多糖的独特降解方式

Nature Communications [IF:12.121]

① 阿拉伯木聚糖是一种常见的膳食纤维类多糖，可被一些拟杆菌或其他人结肠细菌降解；② 拟杆菌对复杂阿拉伯木聚糖的降解，依赖于可编码多种酯酶的基因簇多糖利用位点（PULs）；③ PUL在复杂阿拉伯木聚糖存在时可特异性上调；④ 一些酯酶可从复杂阿拉伯木聚糖中释放阿魏酸；⑤ 包括肠道拟杆菌在内的四种拟杆菌成员在复杂阿拉伯木聚糖上生长时，可诱导具有抗氧化和免疫调节活性的阿魏酸的积累，对宿主产生有益作用。

Degradation of complex arabinoxylans by human colonic Bacteroidetes

2021-01-19, doi:10.1038/s41467-020-20737-5

多糖降解拟杆菌研究论文基础研究细胞系实验细胞 Isaac Cann Gabriel V Pereira

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膳食-菌群的复杂性及互作（综述）

Genome Medicine [IF:10.675]

① 该综述总结了目前关于菌群-饮食互作的研究，并讨论了这些研究方法的前景及缺点；② 研究方法缺乏标准化，以及极端异质性的研究结果接踵而至，这可能与在准确捕捉饮食-菌群特征时的混杂因素有关；③ 新的研究方向应从改进饮食数据的收集、表征机制互作，及增加对组学技术手段（如代谢组学）方面的关注；④ 为了更深入的理解饮食-菌群互作的复杂性，应对研究方法进行重新评价，改进并在保持一致性方面做出努力。

The complexities of the diet-microbiome relationship: advances and perspectives

2021-01-20, doi:10.1186/s13073-020-00813-7

膳食-菌群研究方法综述基础研究 Emily R Leeming Panayiotis Louca Tim D Spector Caroline I Le Roy

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张和平团队：益生菌增强肠道菌群的神经刺激活性以缓解压力与焦虑

Neurobiology of Stress [IF:7.197]

① 受试者口服植物乳杆菌P-8（n=43）或安慰剂（n=36）12周；② 干预后，安慰剂组的粪便菌群多样性降低，而益生菌组无显著变化，且安慰剂组粪便菌群的Aitchison距离变化显著高于益生菌组；③ 益生菌组的粪便菌群中青春双歧杆菌、长双歧杆菌和柔嫩梭菌显著增加，而粪便罗斯氏菌等显著减少；④ 益生菌可富集神经递质合成/消耗相关通路，以及某些预测的神经活性菌群代谢产物（如短链脂肪酸、γ-氨基丁酸、花生四烯酸和神经磷脂）。

Probiotic consumption relieved human stress and anxiety symptoms possibly via modulating the neuroactive potential of the gut microbiota

2021-01-12, doi:10.1016/j.ynstr.2021.100294

益生菌压力焦虑研究论文随机双盲对照实验（RCT）植物乳杆菌P-8 肠-脑轴 Heping Zhang Teng Ma Hao Jin

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益生菌调节色氨酸-犬尿素代谢通路

Neuroscience and Biobehavioral Reviews [IF:8.33]

① 纳入13项研究进行荟萃分析，总结益生菌及益生元对色氨酸-犬尿素代谢通路的影响；② 这些研究共涉及690名受试者，其中有10项RCT及3项单臂试验，共包含12个益生菌研究臂及2个益生元研究臂；③ 报告的指标为色氨酸-犬尿素代谢通路中的代谢产物，包括色氨酸、犬尿素、犬尿酸等；④ 4项RCT（共涉及253名受试者）的研究表明，益生菌对色氨酸浓度无显著影响，但可显著降低犬尿素浓度及犬尿素/色氨酸比例。

Prebiotic and probiotic supplementation and the tryptophan-kynurenine pathway: A systematic review and meta analysis

2021-01-19, doi:10.1016/j.neubiorev.2020.12.026

益生菌/益生元荟萃分析色氨酸代谢犬尿素 Terry Purton

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eLife：肠道菌群“可传染” ，影响骨质发育！

eLife [IF:7.08]

① 无论遗传品系如何，在出生时获得的母亲菌群会影响后代出生后骨骼的发育；② 分段丝状菌（SFB）是一种诱导肠道Th17细胞增生的肠道菌，小鼠与SFB阳性菌小鼠同居后骨质丢失，骨髓Th17细胞增多，破骨细胞因子水平升高；③ 治疗性FMT过程中，如果移植了SFB菌，导致粪菌移植接受者显著骨质丢失；④ 肠道菌群是一种可以在个体之间传播并对骨骼发育产生显著影响的因素。

The gut microbiota is a transmissible determinant of skeletal maturation

2021-01-12, doi:10.7554/eLife.64237

延伸阅读：【ScienceDaily】【生物通】

骨质疏松症母婴菌群传递研究论文基础研究医学研究动物实验 Roberto Pacifici Abdul Malik Tyagi

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Nature子刊：微生物组中的《社交网络》（观点）

Nature Ecology & Evolution [IF:12.541]

① 将生态学集合群落理论和生物地理学中‘岛’的概念放之于微生物组研究，微生物通过宿主‘生物岛’的社交网络进行传播；② 此种传播方式存在于自然界动物群体、人类社会和实验室可控环境中；③ ‘社群微生物组’则反映社交群体中所有个体的微生物集合群落，与‘泛微生物组’概念异曲同工；④ 社会环境因素在五个层级影响社群微生物组的结构，包括个体、组内、组间、种内和种间；⑤ 微生物自身的特性（如丰度和耐氧性）也影响其集群的传播。

Microbial transmission in animal social networks and the social microbiome

2020-06-22, doi:10.1038/s41559-020-1220-8

社群微生物组微生物集合群落观点 Amar Sarkar Siobhán Harty Katerina V-A Johnson Andrew H Moeller

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新冠病毒会不会通过内镜传播？

Gut [IF:19.819]

① 对12名危重症COVID-19阳性病人进行内镜检查，包括上/下内镜检查、内镜超声、内镜逆行胰胆管造影和支气管镜等，对使用过的13个内镜进行SARS-CoV-2病毒分析；② 检查进行前，对内窥镜进行取样，结果呈阴性；③ 有趣的是，内窥镜检查结束后立即对其进行取样，SARS-CoV-2 RNA的检测依然呈阴性；④ 过氧乙酸PAA高度消毒后的内窥镜，其检测结果也是阴性；⑤ 该结论仍需要更大规模的研究进行证实，或将有助于全面了解病毒。

Endoscopes used in positive and critically ill patients are SARS-CoV-2 negative at virological assessment

2021-01-06, doi:10.1136/gutjnl-2020-323577

SARS-CoV-2 内窥镜 Ivo Boškoski

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IBD患者应该接种新冠疫苗吗？

Gut [IF:19.819]

① IBD患者感染SARS-CoV-2的风险与正常人群相同，也应尽早接种SARS-CoV-2疫苗，疾病活动度、使用的治疗药物种类、所处的治疗周期等因素不应影响接种时间；② 不含有活病毒的SARS-CoV-2疫苗（包括mRNA疫苗、复制无能载体疫苗、灭活疫苗和重组疫苗）对IBD患者是安全的，且可有效预防COVID-19，IBD患者应接种与其它人群相同的剂量；③ IBD患者不应接种SARS-CoV-2减毒活疫苗；④ IBD患者接受全身皮质类固醇治疗时，疫苗的效果可能会降低。

SARS-CoV-2 vaccination for patients with inflammatory bowel diseases: recommendations from an international consensus meeting

2021-01-20, doi:10.1136/gutjnl-2020-324000

新冠疫苗其他 IBD Corey A Siegel

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