Cell子刊:靶向清除特定肠道菌的新方法

Cell Host and Microbe [IF:15.923]
① 纳米抗体(Nb)修饰的阴沟肠杆菌作为可编程抑制细胞(PIC),在流体状态下可有效清除表面抗原修饰的T6S敏感菌株;② 表达BamA和Intimin的大肠杆菌,可被表达识别这些表面抗原的Nb的PIC靶向性清除,杀菌效果与抗原结构相关;③ PEG8000等高聚物增加粘度,可增强菌聚集效应,促进杀菌,但粘度过高易增加非特异性杀伤;④ PIC可有效靶向清除小鼠肠道菌群中的致病大肠杆菌,而不影响菌群组成,效果优于抗生素;⑤ PIC不易使靶标菌产生耐受性。
【主编推荐语】目前治疗肠道感染以及肠道菌群研究中,通常使用抗生素来达到目的,然而抗生素杀菌不具有特异性,因此易导致不确定结果。建立特异性清除细菌的技术对于临床应用和科学研究有重要的意义。近期一篇发表在Cell Host and Microbe的一篇论文通过应用纳米抗体-抗原特异性结合的技术和具有T6S细胞毒性的阴沟肠杆菌构建了可编程抑制细胞(PIC),PIC可以靶向清除表达特定表面抗原的细菌,而不影响肠道菌群整体的其它组成,效果显著优于抗生素,且PIC不易导致细菌耐药性的产生。该技术具有广泛的应用前景和临床应用价值。(@Zhonghua)
Targeted Depletion of Bacteria from Mixed Populations by Programmable Adhesion with Antagonistic Competitor Cells
2020-05-28, doi:10.1016/j.chom.2020.05.006

洗涤菌群移植方法学南京共识

Chinese Medical Journal [IF:1.585]
① 28名专家就洗涤菌群移植(WMT)方法学的供体筛选,洗涤菌群方案、存储和运输,患者准备,途径决策及安全管理五个方面提出31条共识;② 共识明确供体筛选包括候选供体教育、初筛、面试、监筛、血液和粪便检验等流程性要求;③ 共识指出WMT的实验室设施要求及操作流程,明确从儿童到成人的移植途径选择和剂量变化范围;④ 共识强调WMT存储、转运、降低移植途径相关不良事件的考量,样本安全溯源以及管理运行WMT中心的要求。
【主编推荐语】该共识以FMT-standardization Study Group名义发表。共识专家小组由中国两岸三地15座城市28名专家组成。专家委员会有5个专题小组,按照专题顺序,小组主席分别为香港中文大学威尔士亲王医院Siew Ng(黄秀娟)教授、广东药科大学第一附属医院何兴祥教授、高雄医学大学附设医院吴登强教授、西京消化病医院吴开春教授和林口长庚医院邱正堂教授,总牵头人为南京医科大学第二附属医院张发明教授。共识初稿历经2轮匿名投票和匿名评论,并于2019年12月12日在南京举行了第3轮面对面讨论和匿名投票,最终确立31条关于洗涤菌群移植方法学及相关管理问题的专家共识,每一条共识意见均有证据支持的相关评论。该共识的发布对于推动和指导全球传统粪菌移植向更加标准化、安全、可控的洗涤菌群移植发展,具有重要意义。(@mildbreeze)
Nanjing consensus on methodology of washed microbiota transplantation
2020-07-21, doi:10.1097/CM9.0000000000000954

Elobixibat或通过增加脱氧胆酸水平以治疗慢性便秘

Alimentary Pharmacology and Therapeutics [IF:7.515]
① 30名慢性便秘患者每日服用10mg elobixibat,持续2周;② Elobixibat治疗可显著增加患者的每两周排便次数(7次 vs. 10次),并显著提升粪便胆汁酸浓度(10.9µg/g vs 15.0µg/g);③ 对于特定的胆汁酸,elobixibat治疗可显著增加粪便中的脱氧胆酸、甘氨酸偶联脱氧胆酸、甘氨酸偶联鹅脱氧胆酸;④ 治疗后,患者的粪便菌群α-多样性(Shannon指数)降低,但在属及门水平上无显著变化。
【主编推荐语】Elobixibat是一种新型的顶端钠依赖性胆汁酸转运蛋白抑制剂,可增加结肠胆汁酸浓度并刺激肠功能,因此被用于治疗慢性便秘。Alimentary Pharmacology and Therapeutics上发表的一项前瞻性研究,对30名接受短期elobixibat治疗的慢性便秘患者的粪便胆汁酸及菌群进行分析后发现,elobixibat可增加总胆汁酸及脱氧胆酸浓度,并降低粪便菌群多样性。该研究提示,elobixibat对便秘的治疗效果与其对次级胆汁酸的作用(而非对菌群结构的影响)相关。(@szx)
The benefit of elobixibat in chronic constipation is associated with faecal deoxycholic acid but not effects of altered microbiota
2020-07-20, doi:10.1111/apt.15950

浙大团队:杀虫剂不管用?可能是虫子的肠道细菌解毒了

Environment International [IF:7.577]
① 家蚕幼虫经多粘菌素处理后,寡养单胞菌丰度降低,肠球菌属和葡萄球菌属丰度升高,同时暴露于毒死蜱的存活率明显降低;② 无菌家蚕幼虫经嗜麦芽寡养单胞菌(S.maltophilia)单一喂养后,对毒死蜱的抗性增强,但蒙氏肠球菌(E.mundtii)的单一喂养无效果;③ S.maltophilia和E.mundtii不能在肠道中直接降解毒死蜱;④ S.maltophilia单一喂养无菌家蚕幼虫后显著影响宿主代谢,使肠道中产生更高水平的必需氨基酸,可能是宿主抗性增强的原因。
【主编推荐语】在农业中大量用于害虫控制的有机磷酸盐杀虫剂已经在世界范围内引起了越来越多的环境问题和公共健康问题。与此同时,主要鳞翅目害虫也快速发展出了对杀虫剂的抗性,其部分原因在于它们的共生微生物。来自浙江大学的邵勇奇团队在Environment International上发表的一项研究中,以家蚕(鳞翅目:蚕蛾科)为模式生物,研究了微生物群促进鳞翅目昆虫产生抗药性的可能机制,表明特定的肠道细菌通过改变宿主代谢、增加关键营养供应显著提高了宿主的适应性,从而使幼虫能够更有效地规避这些有毒化学物质的有害影响。这种新的抗药性机制为研究复杂环境系统中宿主和肠道细菌之间的相互作用提供了有用的模板。(@EADGBE)
Gut bacteria of the silkworm Bombyx mori facilitate host resistance against the toxic effects of organophosphate insecticides
2020-07-02, doi:10.1016/j.envint.2020.105886

基于环境菌群的绿色建筑设计原则(综述)

Trends in Biotechnology [IF:14.343]
① 环境微生物菌群遭遇了城市化的破坏,需要开发新的方法来增强人类与城市地区有益环境微生物群落的相互作用;② 提出基于微生物群的绿色基础设施(MIGI)方法,以减轻城市化对生物多样性和公共卫生的负面影响;③ 为了应对以上挑战,需明确并克服MIGI在概念上、操作上和技术上的主要障碍;④ 介绍了一种MIGI框架,指出对新的建设项目不同阶段的最佳干预时机和策略;⑤ MIGI的设计原则还可以融入到现有建筑中,增加其生态系统功能和提升公共健康。
【主编推荐语】整合环境微生物组研究和政策的最新进展是城市设计的一大挑战。现有的绿色基础设施并未充分考虑到环境微生物组的变化及对公共卫生的影响。发表在Trends in Biotechnology上的一篇综述文章,提出了一种基于微生物群的绿色基础设施(MIGI)设计方法及干预指南,以帮助满足现代城市环境的需求,,并帮助多学科的研究人员和从业人员在设计和建筑环境中明确考虑环境微生物群,从而提高生态系统功能和公共健康。(@EADGBE)
Microbiome-Inspired Green Infrastructure: A Toolkit for Multidisciplinary Landscape Design
2020-05-10, doi:10.1016/j.tibtech.2020.04.009
喝茶或有助于防癌,证据充足吗?
本期话题:茶,口腔癌,小肠癌,大肠癌,DNA损伤反应,血液检测,癌症复发预测,肠道炎症,胃间质瘤
2020-07-27
NEJM最新综述:喝咖啡真的能促进健康吗?
本期话题:咖啡,植物蛋白,补充剂,营养不良,糖尿病,维生素D,蘑菇,益生菌,硫辛酸,α-亚麻酸
2020-07-26
近期10篇高分论文,多角度揭秘皮肤菌群
本期话题:皮肤菌群,皮炎,皮肤损伤,葡萄球菌,皮肤真菌,伤口菌群,环境污染物,红斑痤疮
2020-07-25
NEJM罕见关注小肠菌群,Gordon团队如何独辟蹊径?
本期话题:发育不良,小肠菌群,饮食-菌群互作,肺气肿,蛋白纳米颗粒,多发性硬化,关节炎
2020-07-24
肠道菌群重磅里程碑:20.5万基因组+1.7亿基因被锁定
本期话题:微生物参考基因组,IBD,肝硬化,梭杆菌,梭菌,毛螺菌科,益生元,益生菌,艰难梭菌感染
2020-07-23
于君等GUT发文:高胆固醇让菌群变坏,如何一步步促肝癌?
本期话题:肝癌,胆固醇,肝性脑病,酒精性肝炎,病毒组,IgA,自身免疫病,淀粉样蛋白,阿尔茨海默病
2020-07-22
黄秀娟团队GUT再发文:新冠病毒在肠道悄悄活跃并与特定菌群相关
本期话题:新冠,肠道感染,饮食建议,自噬,肠道炎症,ILC3,Th17,Treg
2020-07-21
菌群+免疫疗法=更好抗癌?6位顶尖专家展望未来
本期话题:癌症免疫治疗,菌群干预,乳糜泻,免疫调节,抑癌基因,表观遗传,饮食与癌症,肝脏菌群
2020-07-20
经典+国人成果10篇:植物和土壤微生物组
本期话题:根系菌群,土壤菌群,拟南芥,适应性,植物免疫,农田古菌,退耕还林,空间,季节,稀有类群
2020-07-19
多组学:多角度链起营养与代谢健康
本期话题:营养组,代谢组,饮食代谢模型,饮食模式,肥胖,肝脂肪变性,多组学,蛋白质组学,类器官
2020-07-18