Nature子刊:血液代谢组可预测人肠道菌群多样性

Nature Biotechnology [IF:31.864]
① 分析399人的659种血浆代谢物,发现其中40种能解释Shannon指数差异的45%,可用来预测人肠道菌群α多样性,宿主-微生物的共代谢物是强预测因子;② 而77种血液临床化验和263种血液蛋白质不能预测肠道菌群α多样性;③ 在另一个540人的队列中验证了这些发现;④ 这40种代谢物中有13种是微生物来源,包括与心血管疾病、糖尿病和肾功能相关的TMAO、丙酸咪唑和硫酸对甲酚;⑤ 在极度肥胖个体中存在代谢扰动,宿主代谢物与α多样性的关联发生改变。
【主编推荐语】肠道菌群α多样性的降低与多种疾病相关,Nature Biotechnology发表的一项最新研究,在一个近400人的队列中分析了约1000种血液检测物(包括临床化验项目、蛋白质组和代谢组)与肠道菌群α多样性的关系,发现40种血液代谢物可预测肠道菌群的α多样性,且预测的多样性指数可反映与腹痛、便秘、腹泻和抗生素使用等宿主健康相关的菌群多样性变化。这些发现不仅揭示出肠道菌群组成与宿主代谢组之间密切的内部关联,也提示可以用血液检测来监控肠道菌群健康。(@mildbreeze)
Blood metabolome predicts gut microbiome α-diversity in humans
2019-09-02, doi:10.1038/s41587-019-0233-9
延伸阅读: 【BioArt】

Nature子刊:人体肠道菌群研究再添重要资源

Nature Medicine [IF:30.641]
① BIO-ML是一个人肠道细菌生物库,可用于研究肠道菌群的动态变化和机制;② 包含7758个人肠道细菌分离株,3632个菌株有全基因组序列,覆盖大部分人肠道菌多样性;③ 还包括>80名个体的16S、宏基因组和代谢组的多个时间点纵向数据;④ 使用多天样本的平均值可提高组学方法数据的可靠性;⑤ 肠道菌群代谢物在个体内随时间的变化与氨基酸相关,粪便代谢组的个体间差异与胆汁酸谱相关;⑥ 个体内的细菌基因组变化可用于推断生态进化动态和选择压力。
【主编推荐语】肠道菌群研究的下个阶段,将在菌株水平分析肠道菌对宿主健康的作用机制。Nature Medicine发表的最新研究,介绍了一个大型的人肠道菌群资源库BIO-ML,不仅包含近8000个肠道菌分离株和3600多个菌株的基因组序列,还包括80多人的多组学纵向数据,为研究肠道菌群动态和机制再添有力资源。(@mildbreeze)
A library of human gut bacterial isolates paired with longitudinal multiomics data enables mechanistic microbiome research
2019-09-02, doi:10.1038/s41591-019-0559-3
延伸阅读: 【ScienceDaily】

Nature子刊:噬菌体疗法治疗耐药细菌感染

Nature Medicine [IF:30.641]
① 一位15岁的囊性纤维化(CF)患者,伴有脓肿分枝杆菌及铜绿假单胞菌感染,同时患有胰腺功能不足、CF相关肝病多种并发症;② 患者在进行双侧肺移植后,接受含有三种噬菌体的“鸡尾酒”治疗;③ 经过基因工程改造的三种裂解性噬菌体的组合在体外可有效地杀死感染性脓肿分枝杆菌;④ 静脉给药的噬菌体治疗有良好的耐受性,可有效改善病人的临床症状,促进胸骨伤口闭合、肝功能改善、促进感染皮肤结节的消退。
【主编推荐语】分枝杆菌具有抗生素耐药性,是全球性健康问题。脓肿分枝杆菌感染影响囊性纤维化患者的肺移植治疗,增加移植后的死亡率。Nature Medicine上发表的一项案例研究中,使用含有三种裂解性噬菌体的“鸡尾酒”疗法,安全且有效地改善了一位脓肿分枝杆菌感染的囊性纤维化患者在接受肺移植后的各项症状。(@szx)
Engineered bacteriophages for treatment of a patient with a disseminated drug-resistant Mycobacterium abscessus
2019-05-08, doi:10.1038/s41591-019-0437-z
改善大肠癌患者生存,多运动有帮助
话题:结直肠癌,运动,筛查,肝癌,胰腺癌,生姜,饮食,鳞状细胞癌,乳酸菌,胃癌。
2019-09-02
8月,最值得看的40+篇菌群与肠道健康文献!
话题:2019年8月,根据“热心肠因子”计算的43篇必读文献。
2019-09-01
植物性饮食:未来健康饮食新风向?
话题:植物性饮食,死亡率,地中海饮食,心血管健康,正念饮食,可食用植物,肥胖,大酱发酵。
2019-08-31
《细胞》:二甲双胍促长寿?又和肠道菌有关
话题:二甲双胍,MAIT,慢性阻塞性肺病,可移动基因元件,膳食多糖,儿童肥胖,NASH,
2019-08-30
代谢炎症:肠道菌群如何推波助澜?
话题:代谢炎症,肠道屏障,土壤微生态,黏膜菌群,抑郁症,定植抗性,喘鸣,骨密度,IBS。
2019-08-29
隔日禁个食?减肥、保护心血管,或许还能抗衰老
话题:隔日禁食,膳食干预,脑病,人工智能,内镜,慢性腹泻,环境菌群,血流感染。
2019-08-28
《Immunity》纵论“菌群-免疫互作”热点问题
话题:菌群-免疫互作,细菌淀粉样蛋白,IgA,肠道芯片,皮肤菌群,室内菌群,哮喘,IBD
2019-08-27
口服抗生素影响大肠癌风险吗?
话题:结直肠癌,抗生素,肝癌,药物基因组学,胰腺癌,筛查,营养,维生素A。
2019-08-26
脂肪肝越来越普遍,该怎么防治呢?
话题:代谢,NAFLD,肝脏疾病,支链氨基酸,脂肪生热,胃饥饿素,认知功能,瘦素,胆汁酸
2019-08-25
甜食吃太多,当心促进自身免疫病
话题:自身免疫,糖摄入,腹胀,心血管预防,抗生素,小檗碱,社会关系,肠道准备,NAD+。
2019-08-24