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食品添加剂膳食乳化剂炎症性肠病

Annual Review of Microbiology上发表的一篇综述文章。人类肠道菌群是由众多原核和真核、以及病毒颗粒等组成的复杂群体，其与机体的健康、疾病密切相关。但是，目前的厌氧培养技术并不能实现所有人体肠道菌群的体外培养。本文就针对此问题，讨论了在实验室分离及短暂培养这些人类肠道菌群的平台、技术以及可能性。

人类肠道菌体外培养类器官综述

粪菌移植

Nature Reviews：粪菌移植中的受体因素（观点）

粪菌移植（FMT）可治愈约90%复发艰难梭菌感染，但对其他与肠道菌群改变相关的疾病，FMT的疗效存在着比较大的变数。如何提高FMT的成功率、增加供体菌群的植入绿，是目前临床上需要解决的问题。Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology近期发表的长篇观点文章，重点探讨了影响FMT成功率的潜在受体因素，为未来该领域的研究方向提出了若干建议。推荐专业人士仔细参阅。

粪菌移植

血脂异常

Nature Reviews：血脂异常的全球流行病学（综述）

Nature Reviews Cardiology近期发表综述，详细总结了血脂异常的流行病学研究进展，值得专业人士参考。

血脂异常流行病学

呼吸道微生物组

Nature子刊：支气管扩张的整合微生物组学研究

支气管扩张是一种进行性慢性气道疾病，以微生物定植和感染为特征。此前的相关研究多将细菌、真菌、病毒等不同种类的微生物分开考虑，而缺乏对其整体的综合性分析。Nature Medicine近期发表的研究填补了这一空白，采用整合微生物组学（integrative microbiomics）方法，揭示了支气管扩张患者的气道微生物组特征，表明靶向微生物互作网络而非单个微生物的抗生素治疗策略是值得探索的研究方向。

呼吸道微生物组整合微生物组支气管扩张

新冠肺炎

Lancet子刊：国内团队报道新冠患者的胃肠道后遗症

中山大学附属第六医院兰平与研究团队近期在Lancet Gastroenterology & Hepatology发表文章，报道了新冠患者出院后3个月的胃肠道后遗症及其相关临床因素。

新冠肺炎后遗症胃肠道症状

营养流行病学

前沿观点：大数据和机器学习推动营养流行病学研究

营养流行病学领域的研究，面临着多种由复杂数据信息带来的挑战。Advances in Nutrition近期发表观点类文章，指出大数据分析和机器学习有望解决营养流行病学领域的挑战，并列举了一系列具有可操作性的大数据分析和机器学习发展方向，值得统计学、流行病学、营养学等多领域相关人士参考。

营养流行病学大数据分析机器学习前沿观点

微生态研究进展

Eran Elinav等详解微生物组研究的突破与瓶颈

在过去15年中，共生微生物组学蓬勃发展，空前繁荣，领域内取得了很多重大的突破。但是同样在新技术不断涌现之时，无论从理论研究还是临床开发应用，微生物组学也面临着很多新的限制和挑战。近期发表在Trands in Molecular Medicine的一篇小综述，简要从宏基因组分析、饮食-微生物-宿主相互关系、宏基因组在临床诊断应用、噬菌体疗法、粪菌移植和宏基因组背景下的益生菌研究等几个方面概括了微生物组研究进展、方向和迫切需要解决的问题。

微生态研究进展微生态研究瓶颈综述

益生菌

预见•遇见益生菌和益生元的未来（综述）

新的益生菌种的发现会来自何处，人源、动物、植物或是食物？我们如何超越现有的二元分类法去重新理解微生物相关的生态系统，其成分、功能与互作？在决定益生菌、益生元应答的过程中，什么是最关键的宿主相关因素，什么又是最关键的菌群相关因素？活体生物治疗、工程菌等是否可以走入大众视野，改变人们的健康观念？益生元大佬Glenn R. Gibson 等在Trends in Microbiology发表关于益生菌、益生元的观点综述，面向科学家、政策实践制定者、医生以及大众，提出许多至关重要的问题供读者思考。

益生菌益生元综述学科发展

微生物组创新

Nature子刊：微生物组创新助力可持续发展（评论）

联合国可持续发展目标以生物经济战略为主要策略，实现可持续发展和减缓气候变化。Nature Microbiology发文，阐述联合国采用‘可持续发展目标’中关于微生物组创新的部分。值得借鉴和响应。

微生物组创新可持续发展目标评论政策建议

粪便微生物群移植（FMT）

粪菌移植调控肠道菌群失调的风险和收益（综述）

粪菌移植（FMT）对艰难梭菌感染（CDI）治疗的安全有效性现已在多数国家得到认可，并鲜有不良反应事件报道。但FMT对于其他疾病治疗的风险收益率仍存在争议。Allergy: European Journal of Allergy and Clinical Immunology近期发表文章，探讨在免疫介导性疾病中支持和反对FMT的论点。文章指出，FMT确实是一种很有前途的治疗方法，在可通过调节肠道菌群为靶点改善病理生理的疾病中贡献显著，但是在部分慢性疾病中由于造成失调的驱动因素、时间及其因果关系尚不明确，使用FMT的合理性因此降低，且风险与收益的比率并不理想。除此之外，文章指出在关于免疫介导性疾病中使用FMT的研究中目前仍存在的空白，并就如何在未来的研究中填补这些研究空白提出了建议，值得相关研究人员关注。

粪便微生物群移植（FMT）肠道菌群综述移植治疗

肺炎

Science子刊：详解菌群在肺炎中的作用（综述）

Science Translational Medicine上发表的一篇综述文章，详细介绍了健康状态下的肺部菌群及肠道菌群抑制肺炎发生的机制，以及个体的菌群差异如何影响肺炎的易感性，最后讨论了通过靶向调控菌群防治肺炎的可能。

肺炎综述肺部菌群菌群-免疫互作

菌群移位

肠道菌群移位如何影响癌症和自身免疫病？（综述）

近年研究表明，肠道菌群移位在许多肠外疾病中可能具有重要作用。Trends in Immunology近期发表的综述文章，对相关研究进展进行了总结，重点聚焦在肠道菌群移位在癌症和自身免疫病中的免疫调节作用和机制，推荐专业人士仔细学习。

菌群移位癌症自身免疫病免疫调控

胃食管反流病

JAMA：一文读懂胃食管反流病临床管理（综述）

胃食管反流病（GERD）是全球最常见的慢性疾病之一，不仅导致患者生活质量下降，而且消耗大量医疗保健资源，造成社会负担。JAMA发表综述文章，归纳总结了113篇相关文献，重点概述了成人GERD的临床管理，包括流行病学、病理机制、病因、临床表现、诊断评估手段、治疗方法、疾病预后、并发症和药物治疗相关不良反应的评估。除此之外，还总结了消融内镜、经口无切口折叠术、磁性括约肌增强器这些新的治疗方法的最新治疗证据，并谨慎提出在长期安全性和有效性尚未明确前暂不推荐使用新兴疗法，值得临床医生及相关研究人员仔细阅读。

胃食管反流病综述消化系统疾病

肠易激综合征

Lancet子刊：重视IBS与器质性胃肠病的潜在重叠，精准诊治（综述）

肠易激综合症（IBS）是一种常见的功能性胃肠病，特征为反复腹痛及排便习惯改变，具有特征性症状并排除可以解释这些症状的器质性胃肠病即可诊断IBS。目前越来越多的临床证据表明，部分器质性胃肠病容易误诊为IBS，而且IBS存在于明确诊断为器质性胃肠病的患者中，即使这些患者本身的疾病正在缓解，也会因为IBS症状影响临床治疗中对用药及剂量调整的判断。Lancet Gastroenterology & Hepatology近期发表综述，系统总结了IBS的症状特征、类似IBS症状的器质性胃肠病，IBS的诊断策略以及器质性胃肠病患者伴发IBS症状的情况，帮助从事胃肠病学的临床医生认识到IBS与器质性胃肠病之间的潜在重叠，并提出需要进一步研究和明确的领域，值得研究人员和临床医生共同关注。

肠易激综合征器质性胃肠病

益生元益生菌微胶囊

国内团队：益生元包封的益生菌微胶囊，或能改善代谢疾病

深圳大学第一附属医院阎德文、Hui Tan和复旦大学商珞然与团队共同研究成果。文章采用微流技术，利用益生元海藻酸盐将乳酸菌和枯草芽孢杆菌进行独立双核微胶囊。该微胶囊可以保持益生菌的活性，协同作用且又不互相干扰，可以最大程度发挥有益效力，在干预代谢性相关疾病方面具有很大潜力。

益生元益生菌微胶囊 Microfluidics probiotics microcapsule Intestinal barrier

慢性便秘

慢性便秘的新分类方法

慢性便秘目前被划分为两种主要的综合征——便秘型肠易激综合征（IBS-C）和功能性便秘（FC），这主要是基于这两种综合征有不同的临床和病生理特征，但也有研究认为这两种综合征并不是完全不同的，而是属于同一种谱系疾病。American Journal of Gastroenterology近期发表的一项研究表明，IBS-C和FC仅在腹痛这一个症状上存在区别，因此二者更像是属于同一个谱系疾病，而不是两种综合征。该研究还提出了一种新的对慢性便秘的分类模型，或对临床诊疗带来新思路。

慢性便秘便秘型肠易激综合征功能性便秘机器学习诊断模型

食品添加剂

二氧化钛纳米颗粒对小鼠菌群、免疫及代谢的影响

近期，法国开始禁止在食品中添加二氧化钛（TiO2，编号E171）。来自Small上发表的一项最新研究，对比了TiO2 E171与粒径更小的TiO2纳米颗粒（TiO2 NP）对小鼠的影响，发现2种TiO2均无明显的毒性，但可改变肠道菌群组成，并可诱导结肠炎症应答，而TiO2 NP的促炎作用更强。而在肥胖小鼠中，TiO2的促炎作用更加显著。

食品添加剂 Gut microbiota high‐fat diet Inflammation oral exposure

流感病毒-细菌共感染

Nature子刊：甲流病毒如何影响上呼吸道微生物组

细菌共感染加重流感病毒感染，常导致疾病恶化，但流感感染对上呼吸道微生物群的影响尚不清楚。Nature Communications最新发表的文章，揭示出甲型流感病毒感染后个体的上呼吸道菌群经历紊乱向平衡稳态恢复的过程，其与病毒清除和机体恢复同步，提示维持微生物组稳态或是预防甲型流感病毒-细菌共感染的潜在治疗靶点。

流感病毒-细菌共感染上呼吸道菌群动态变化甲型流感病毒

研究方法与技术

Nature Reviews：原位研究宿主-共生菌相互作用的新技术（评述）

对宿主-微生物相互作用的充分理解有助于对有益和有害相互作用的区分，以及它们对进化和致病机制的理解。但多数共生微生物具有不可体外培养的特性，因此迫切需要使用新的技术来研究宿主和微生物的原位相互作用。发表在《Nature Reviews Microbiology》上的一项“聚焦”文章评述了空间代谢组学和光学显微镜在宿主-微生物相互作用的生物地理学成像方面的最新进展，介绍了大气压基质辅助激光解析电离质谱成像（AP-MALDI-MSI）、荧光原位杂交（FISH）技术和3D光片荧光显微镜（3D-LSFM）技术在宿主-微生物原位相互作用中的成功应用，并指出三种技术的优势结合可为检测微生物感染和生长状态、区分宿主和微生物代谢及相互作用提供更有效途径。

研究方法与技术微生物-宿主互作荧光原位杂交内共生空间代谢组学

新冠病毒

Nature子刊：新冠病毒感染可能起始于鼻腔

新冠病毒感染细胞的过程依赖于受体ACE2及蛋白酶TMPRSS2。Nature Medicine上发表的一项最新研究，发现鼻上皮细胞中高表达ACE2及TMPRSS2，同时高表达先天性免疫基因，提示鼻腔可能是新冠病毒感染人体的起始地点，并可作为人与人之间传播的病毒储存库。

新冠病毒 IMMUNOLOGY Transcriptomics Virology 鼻上皮细胞

新冠肺炎

新冠肺炎与IBD中的免疫调节（综述）

来自Gut上发表的一篇综述文章，介绍了新冠肺炎的发病机制及新冠肺炎相关的胃肠道症状，并着重关注了新冠肺炎与IBD之间的关联。文章讨论了IBD患者的新冠肺炎易感性是否因其肠道ACE2的表达升高而增加，以及在新冠肺炎流行期间，应如何对正在接受免疫抑制剂或免疫调节剂治疗的IBD患者进行管理。

新冠肺炎新冠肺炎 IBD Kin Man Au Kin Man Au

宿主-菌群相互作用

葡萄球菌间及与宿主间的相互作用机制（综述）

葡萄球菌是人类上皮表面常见的共生菌，其中金黄色葡萄球菌具有相当大的致病潜力，可导致严重的甚至致命的感染。尽管葡萄球菌感染始于致病菌株定殖，但对葡萄球菌定殖的研究，尤其是与其他定殖微生物的相互作用研究依然有限。发表在《Current Opinion in Microbiology》上的一项综述，概述了关于葡萄球菌干扰其他定殖微生物群成员的机制，其中一些研究为开发新的抗感染药物或防止致病菌株定殖提供了新的途径。

宿主-菌群相互作用共生微生态葡萄球菌群体感应系统细菌素

乳糜泻

Science：谷蛋白摄入如何引发乳糜泻中的自身免疫反应

乳糜泻是一种常见的胃肠道疾病，与谷蛋白摄入有关，其诊断标志物为血清中高浓度的2型转谷氨酰胺酶（TG2）的自身抗体。Science上发表的一篇Perspective文章，探讨了饮食摄入的外源性谷蛋白如何通过驱动T-B细胞的互作，以诱导自身免疫反应，从而引发乳糜泻的机制。同时，作者认为，与谷蛋白在乳糜泻中的作用类似，其它环境因素也可能促进其它自身免疫疾病的发生发展。

乳糜泻乳糜泻 Anna Kaisanlahti Terhi Tapiainen # Justus Reunanen #

肠内营养配方

治疗克罗恩病的肠内营养配方都含啥？

文章对61种能有效缓解儿童克罗恩病的全营养素（EEN）配方进行了详细分析。分析结果显示，EEN的能量供比为：碳水化合物22.8%‐89.3%、蛋白质7.8%‐30.1%、脂质0%‐52.5%。其中，主要宏量营养素来源于麦芽糖糊精、牛奶蛋白和蔬菜/植物油。 n‐6:n‐3 不饱和脂肪酸比例为0.25- 46.5。同时，研究结果表明，配方中加入的食品添加剂并没有影响配方疗效，这也是对传统观念的一种颠覆和质疑。

肠内营养配方食品添加剂克罗恩病 Yan Yan Simin He

哮喘

Cell子刊：肺部菌群和肠道菌群在哮喘中的作用（综述）

来自Immunity上发表的一篇综述文章，详细介绍了在不同发病机制的哮喘类型中，肺部菌群及肠道菌群的组成及功能变化，以及菌群的变化对哮喘的发病、临床特征、治疗响应的影响；同时重点讨论了菌群（包括细菌、真菌、古菌、病毒）介导下的肠-肺轴互作机制，以及这些互作在哮喘中的作用。

哮喘肠-肺轴肺部菌群哮喘 Sicong Wang

巨型噬菌体

Nature新发现：巨型噬菌体！

噬菌体基因组通常较小。但Nature近期发表的文章发现了不同样本，如人类、动物和环境微生物组中均存在巨型噬菌体，其中最大噬菌体的基因组拥有73.5万对碱基，比许多细菌宿主的基因组还要大的多，甚至具备CRISPR/Cas系统，颠覆了传统认知。

巨型噬菌体 CRISPR基因编辑系统 Bacteriophages environmental microbiology metagenomics

胃肠道疼痛

Nature Reviews：一文+一图读懂胃肠疼痛的机理和治疗

胃肠疼痛是一种常见的内脏疼痛症状，Nature Reviews Disease Primers近期发表的长综述，对胃肠疼痛的流行病学研究、潜在的病生理机制、治疗方法等进行了深入介绍，并对未来的研究和治疗方向作出展望。我们特别将该文配套的PrimeView图片编译为一图读懂，希望能帮你涨知识。

胃肠道疼痛功能性胃肠疾病 Arvind Dasari Arvind Dasari Sara Lonardi

移植物抗宿主病

Nature子刊：移植物抗宿主病与哪些宿主和菌群的代谢物变化有关？

Nature Communications发表的一项研究，重点分析了接受造血干细胞移植（HSCT）的患者的血液代谢组，鉴定出与移植物抗宿主病（GvHD）相关的宿主和菌群代谢物的变化，包括芳香烃受体配体、胆汁酸、缩醛磷脂等。这些发现提示，菌群失调以及HSCT相关的血液代谢物变化，可能影响患者的同种异体免疫反应，或是防治GvHD的新靶点。

移植物抗宿主病血液代谢组学移植免疫学菌群代谢物与衍生物胆汁酸

肠道病毒组

Nature子刊：肠道病毒感染与儿童胰岛自身免疫和1型糖尿病

破坏胰岛β细胞的自身免疫反应，可导致胰岛素分泌不足和1型糖尿病（T1D）。有研究显示，这种胰岛自身免疫的发生可能与病毒感染有关，比如某些能感染β细胞的肠道病毒。Nature Medicine近期发表了一项来自TEDDY队列的报告，对有T1D风险的儿童进行前瞻性分析，鉴定出与胰岛自身免疫和/或T1D风险相关的肠道病毒和参与抗病毒应答的遗传突变，为进一步设计实验来检验特定肠道病毒在胰岛自身免疫和T1D中的作用和机制，以及开发潜在的抗病毒预防方法，打下基础。

肠道病毒组胰岛自身免疫 1型糖尿病前瞻性队列研究肠病毒B