一只赵崽儿呀

肠道菌群代谢胆固醇

适量的胆固醇可帮助机体在肝脏中产生胆汁、维生素D和激素，而过量摄入饱和脂肪和反式脂肪会导致肝脏过度产生胆固醇沉积在血管壁上，增加心脑血管疾病的风险。先前研究发现，肠道菌群与宿主胆固醇代谢有关，但负责与膳食胆固醇互作的肠道细菌有哪些，仍需要深入探究。近日，康奈尔大学研究人员在Nature Microbiology发表最新研究，借助生物正交标记排序序列光谱法和流式细胞荧光分选，首次鉴定出与胆固醇互作并产生重要分子的肠道细菌（如拟杆菌属、双歧杆菌属、肠球菌属和副拟杆菌属的特定物种），也鉴定到BT_0416是多形拟杆菌中负责将胆固醇转化为胆固醇-3-硫酸盐的重要酶。总之，研究为使用特定物种调节胆固醇或其他相关脂质的水平提供了新指导。

胆固醇代谢肠道细菌研究论文基础研究动物实验

宿主-菌群互作

Cell子刊：肠菌如何调控小肠上皮稳态？新机制被揭示

肠上皮在感知、整合饮食和微生物信号方面发挥着关键作用，然而肠道菌群和肠上皮细胞（IECs）间的相互作用如何调节近端小肠（尤其是十二指肠）的宿主生理机能，目前的研究尚不清楚。近日发表在Cell Host & Microbe的这篇文章，通过对无菌 (GF) 和不同常规菌群组成的小鼠十二指肠IECs进行单细胞 RNA 测序和菌群分析，发现Faecalibaculum rodentium通过重塑视黄酸-嗜酸性粒细胞-INFγ依赖性回路，从而调节十二指的肠上皮稳态。

宿主-菌群互作小肠肠道菌群肠上皮视黄酸

肠道TLR4

国内团队：肠道TLR4缺失通过肠道菌群失调和潘氏细胞缺乏加重急性胰腺炎

目前TLR4在急性胰腺炎中的作用存在争议，并且前期研究使用的方法都集中在系统性而非局部性敲除该受体。在健康状态下，上皮细胞中的TLR4通过塑造宿主肠道菌群和维持肠道屏障完整性，从而维持肠道稳态。然而，肠道TLR4的表达改变对AP的影响仍未可知。上海市第一人民医院消化科黄春兰老师和曾悦老师团队研究成果揭示肠道TLR4缺失加剧急性胰腺炎所致胰腺和肠道损伤，并提示补充罗伊氏乳杆菌和调节潘氏细胞或可是急性胰腺炎潜在的治疗方向。

肠道TLR4 急性胰腺炎研究论文基础研究肠道菌群

菌群脂肪酸调控肠道SUMO化，抑制宿主炎症反应

肠道菌群产生的多种代谢物可与肠道细胞相互作用并有助于宿主生理，然而目前其对宿主蛋白SUMO化的影响未知。近日发表在Gut Microbes上的这篇文章表明，肠道共生菌产生的脂肪酸通过调节宿主蛋白SUMO化以调节肠道生理功能，并抑制肠道菌群引发的宿主炎症反应。

国内团队：菌群定量性状位点的泛癌分析

微生物的种类和丰度会影响癌症的发生、进展和治疗，宿主遗传学与肠道菌群的丰度有关，而遗传变异与癌症菌群间的关系仍待系统研究。其中，跨癌症类型鉴定癌症菌群数量性状基因座 (mbQTL) 可能有助于阐明遗传变异对肿瘤发展的影响。近日武汉大学田剑波团队在Cancer Research发表文章，利用来自癌症基因组图谱的基因型数据和来自Kraken衍生的菌群丰度数据，开发了一个计算流程来识别32种癌症类型中的 mbQTL，并构建了一个用户友好的数据库Cancer-mbQTL，供用户浏览、搜索和下载感兴趣的数据。该系统有助于有效评估种系SNP对癌症菌群表型的影响，并为基于菌群的癌症靶标提供了新思路。

膀胱菌群

卷曲乳酸杆菌或可治疗膀胱尿路感染

膀胱菌群是否影响尿路上皮细胞功能至今未知。近日PNAS发表的这项研究中，证明乳酸杆菌是人类膀胱中最丰富的共生细菌，可促进膀胱上皮细胞中I型干扰素的产生，导致成熟的吞噬溶酶体具有增强的组织蛋白酶D并酸化，从而保护宿主免受尿路致病性大肠杆菌的感染。综上，乳酸杆菌可通过调节膀胱的先天免疫，对尿路感染发挥治疗作用。

膀胱菌群 Lactobacilli commensal bacteria type I interferon urinary tract infection

P-糖蛋白

肠菌代谢物如何调节肠上皮细胞p-糖蛋白的表达？

p -糖蛋白(P-gp)是肠道上皮细胞的关键组成部分，在内源性大麻素排出毒素、防止过度炎症和维持内稳态方面发挥着关键作用。尽管P-糖蛋白（P-gp）在肠道中的表达对于保护肠道上皮细胞免受毒素和中性粒细胞浸润的损害至关重要，但人们对其在肠道中的调控却了解甚少。mBio近期发表的研究，发现了一个复杂的、迄今未被重视的细胞内信号网络，该网络由肠道微生物代谢物丁酸和次级胆汁酸诱导来调节P-gp的表达。该发现确定了微生物群和保护结肠炎的新联系，利用肠道菌代谢物和P-gp诱导在肠道局部的有益作用，或可为溃疡性结肠炎和其他肠道炎症提供一个潜在治疗机会。

P-糖蛋白丁酸次级胆汁酸

抗生素

饲粮添加抗生素对鸡肠道菌群组成及功能有何影响？

养殖业常使用抗生素预防或治疗细菌感染性疾病、以及作为饲料添加剂促进动物生长。但抗生素耐药性问题日渐突出，严重威胁着人类健康。目前，围绕抗生素对家禽肠道菌群的相关研究主要局限于采样位点单一、时间跨度短、测序手段不一致，进而造成研究结果差异较大。近日，加拿大多伦多大学研究人员在Microbiome发表最新研究，利用多组学系统探究了抗生素对鸡肠道菌群（涉及多采样点、长时间跨度）组成和功能的影响，发现饲粮添加抗生素改变了多种微生物通路的表达，但对菌群结构的影响较小。总之，该研究对开发针对肠道健康和家禽生产的下一代饲料添加剂提供了新参考。

抗生素鸡肠道菌群研究论文基础研究动物实验

肠上皮内淋巴细胞

肠道中的免疫细胞群也喜欢吃“甜食”？

许多细胞的代谢能力是灵活的，能够根据环境的变化适应代谢资源的变化（如肠道的饮食摄入）。近日，里斯本大学研究人员在PNAS发表最新研究，发现肠组织中驻留的淋巴细胞（即肠上皮内淋巴细胞）比循环淋巴细胞能更快地产生能量，其激活依赖于环境中葡萄糖的可用性。通过动物实验发现，葡萄糖可调节这些免疫细胞的活性，以帮助宿主更快速清除肠道内的感染。总之，该研究进一步了解了肠道组织免疫细胞的激活要求，为对抗炎症性肠病等疾病提供了治疗潜力。

肠上皮内淋巴细胞研究论文基础研究肠免疫细胞炎症性肠病

早发性结直肠癌

马延磊团队：早发性大肠癌患者的肠道菌群、代谢组和细菌酶基因特征

大肠癌（CRC）在年轻人中的发病率正在逐渐升高。常规的CRC筛查策略主要针对≥50岁的晚发性（LO）CRC，如何对早发性（EO）CRC进行有效的早期筛查，是目前面临的一大挑战。复旦大学附属肿瘤医院马延磊团队近期在Gut发表一项最新研究，通过对总共549例的EO-CRC患者、LO-CRC患者和健康对照进行粪便宏基因组和代谢组学分析，揭示了EO-CRC和LO-CRC在菌群组成、代谢物和细菌酶基因方面的相似和差异，并通过机器学习建立了基于多组学标志物的预测模型，在EO-CRC的检测筛查方面具有强大潜力。

早发性结直肠癌肠道菌群代谢组预测模型结直肠癌筛查

肠道菌群

国内团队：肠道菌群干预或可用于改善阿尔茨海默病

阿尔茨海默病（AD）是一种渐进性神经退行性疾病，发病原因非常复杂。现在随着人们对肠道菌群与人类健康关系的深入塔索，越来越多的证据显示肠道菌群的变化以及随之带来的肠道菌群代谢的异常与AD的发生和进展有这密切的关系。特别是肠道菌群参与的色氨酸代谢的吲哚通路在AD小鼠模型中有较大的变化，提示吲哚通路与AD的发生和进展有关，但目前对其参与的具体机制尚不明确。近期国内温州医科大学刘佳明团队和中国医药大学（台湾）苏冠宾团队合作在Brain, Behavior, and Immunity上发表了其最新的研究成果，他们发现肠道菌群吲哚代谢通路的吲哚及其衍生物可以通过激活芳香烃受体（AhR）而抑制AD模型鼠中NF-κB炎症通路的激活以及NLRP3炎性小体的形成，降低其炎症的水平。这些研究成果揭示了肠道菌群参与调控AD进展的分子机制，为临床治疗AD提供了新的思路。

肠道菌群色氨酸代谢产物吲哚通路吲哚及其衍生物 NF-κB通路

类风湿关节炎

生物制剂可改善类风湿关节炎患者的肠道通透性及细菌易位

类风湿关节炎研究论文肠道通透性细菌易位基础研究

妊娠期糖尿病

袁慧娟+张晨虹等：肠道菌群调控代际遗传预防糖尿病新机制

大量高热量、高碳酸饮料以及高碳水化合物摄入，是导致糖尿病年轻化的主要原因，如何阻断不良生活方式造成的糖代谢异常“遗传”给子代成为预防早发糖尿病的关键。近日，河南省人民医院袁慧娟及团队联合上海交通大学张晨虹在Microbiome发表最新研究，通过高脂饮食建立妊娠期高血糖模型，发现母亲孕期糖代谢异常会影响子代糖代谢表型，且糖代谢异常引起的肠道菌群变化也会通过垂直传递影响子代的肠道菌群，通过剖腹产和交叉喂养可阻断这种垂直传递，改善后代糖代谢。总之，该研究揭示了肠道菌群调控代际遗传预防糖尿病的新机制，为通过靶向肠道微生态干预早发糖尿病提供了新支撑。

妊娠期糖尿病菌群垂直传递研究论文基础研究啮齿动物（小鼠）

群体感应

乔建军等：系统解析基于群体感应的药物-微生物-疾病互作关系

药物分子可能与肠道微生物的群体感应（QS）受体结合，影响微生物的QS调控，从而影响菌群的组成和功能。天津大学乔建军、李艳妮和中南大学郭菲与团队近期在Science China Life Sciences发表文章，建立了基于QS的药物-微生物-疾病（QS-DMD）数据库（http://www.qsdmd.lbci.net），系统性分析了微生物与药物间的相互作用，并构建了药物-QS受体-微生物-疾病的系统框架和互作网络。该研究为揭示药物-菌群互作以及研发靶向肠道微生物QS系统的药物提供了新资源。

群体感应药物-菌群-宿主互作肠道菌群微生物-疾病关联

病毒组

Nature子刊：绘制哺乳动物肠道和实质器官的病毒生物地理图谱

哺乳动物病毒组与健康和疾病有关，但目前关于其沿哺乳动物胃肠道和其他器官的横纵轴结构如何分布，这方面的研究知之甚少。近日发表在Nature Microbiology上的这篇文章，通过宏基因组对家猪和恒河猴这两种代表性哺乳动物的胃肠道、实质器官的病毒进行了全面的生物地理分析，绘制出详尽的哺乳动物肠道和实质器官的病毒生物地理图谱，并发现胃肠道病毒组具有高度的空间和物种特异性，为未来研究哺乳动物肠道病毒组提供了重要的资源。

病毒组

肠道免疫

Cell子刊：一种新型策略或能帮助预防并治疗过敏

肠道寄生虫能穿过机体上皮屏障，引发组织损伤并释放危险相关的分子模式，或许能促进宿主保护性2型免疫力产生。近日，美国罗格斯大学在Cell Reports发表最新研究，发现特异性阻断肠上皮细胞A2B腺苷受体会抑制宿主对肠道蠕虫的保护性记忆反应。与能产生强大免疫反应抵御寄生虫的普通小鼠相比，将肠道蠕虫注射到上皮细胞缺失腺苷受体的小鼠中，其免疫反应水平显著降低。总之，该研究进一步支持胞外ATP代谢合成腺苷可激活上皮A2BAR信号，促进2型免疫应答，未来研究人员或许有望利用阻断腺苷受体的药物来帮助治疗过敏反应，值得关注。

肠道免疫腺苷过敏研究论文基础研究

乳糜泻

IMGX003可缓解乳糜泻患者摄入谷蛋白后的症状

摄入谷蛋白可导致乳糜泻患者的胃肠道症状及小肠粘膜损伤。IMGX003中包含两种可降解谷蛋白的酶。Gastroenterology上发表的一项2期临床试验结果，在每日摄入2g谷蛋白的乳糜泻患者中，每日口服1200mg的IMGX003的安全性良好，可非显著地改善肠道粘膜损伤，显著缓解腹痛、腹胀及疲劳等症状，并显著减少上皮内淋巴细胞。

乳糜泻研究论文医学研究 2期临床试验 IMGX003

摄食行为

肠道如何控制你对食物的选择？

肠内分泌细胞（EECs）是胃肠道中主要的化学感受器，但由于难以在体内选择性地靶向这些细胞，限制了它们对摄食行为的影响的研究。近期eLife发表的一项研究发现，多种EECs亚型能够抑制食物摄入，但不同的EECs亚型能够产生对特定食物的习得性厌恶或偏爱。这些发现为研究肠道内的化学感应器如何驱动对食物的学习性选择建立了细胞基础，并为进一步研究体内EEC的功能提供了新的方法。

摄食行为肠内分泌细胞 5-羟色胺

结肠炎

国内团队：凝结芽孢杆菌联合壳寡糖或可改善小鼠结肠炎

溃疡性结肠炎（UC）是结肠炎的一种类型，其疾病发生是由免疫因素、遗传因素、环境因素和感染因素共同作用的结果。最近研究发现，益生菌和益生元联合使用可有效缓解UC炎症。近日，成都大学/华中农业大学的彭楠及团队在Microbiology spectrum发表最新研究，利用DSS诱导构建小鼠结肠炎模型，发现凝结芽孢杆菌FCYS01孢子与壳寡糖联用可显著缓解DSS诱导的UC，且治疗效果优于二者单独使用。总之，该研究为未来联合使用益生菌和益生元干预结肠炎提供了新思路。

结肠炎肠道菌群研究论文基础研究益生菌

膳食纤维

同为膳食纤维的果胶和菊粉的代谢差异

膳食纤维是一组不能被人类的胃肠道中消化酶所消化的，且不被人体吸收利用的多糖。它主要存在于坚果、豆类、谷类、水果和蔬菜中，大致分为可溶性和不溶性纤维。可溶性纤维可被肠道菌群发酵，产生短链脂肪酸（SCFA）作为代谢副产物，在肠道稳态中发挥重要作用，并影响肠道以外的组织和器官。膳食纤维在预防心血管相关死亡率、2型糖尿病和结直肠癌中具有重要作用。发表在Food Chemistry上的一项工作研究了果胶、菊粉及其组合对人体肠道微生物生态系统模拟器模型的近端和远端结肠室中肠道菌群的组成以及SCFA和吲哚衍生物产生的影响，表明果胶和菊粉对肠道菌群的组成和代谢活性有不同的影响，导致不同的SCFAs和吲哚衍生物的产生，对健康促进食品的设计具有一定意义。

膳食纤维肠道菌群及代谢产物胃肠道模拟器

肠道菌群代谢产物

丁酸如何促进芳香烃受体通路活化？

在肠道菌群与宿主之间的对话中，芳香烃受体（AhR）发挥重要作用，然而肠道AhR的调控机制还有很多未知。Gut Microbes发表的这项研究聚焦肠道菌群衍生代谢物对AhR信号的调控作用，通过一系列体外实验发现，丁酸作为HDAC抑制剂，可促进被AhR配体激活的AhR对靶基因启动子的结合，从而增强AhR信号。

肠道菌群代谢产物芳香烃受体短链脂肪酸丁酸染色质重塑

肠易激综合征

Sceince子刊：肠道菌群产生的组胺，或是IBS慢性腹痛的重要诱因

组胺是一种已知的神经免疫调节因子，Science Translational Medicine发表的一项研究表明，在部分肠易激综合征（IBS）患者中，肠道菌群是组胺的重要来源，特定的产气克雷伯菌则是主要“嫌犯”。机制上，组胺通过作用于组胺4受体，吸引肥大细胞向结肠迁移和积累，从而引起模型小鼠腹痛。这些发现说明，肠道菌群产生的组胺或可作为治疗IBS腹痛的新靶点。

肠易激综合征内脏敏感性腹痛肠道菌群产气克雷伯菌

mTORC1信号通路

国内团队Cell子刊：过氧化物酶体迁移的肠脑轴调节动物发育

mTORC1通路机体感应环境营养因子和生长信号，进而调控细胞的发育的最为重要和核心的信号通路。当通路中重要基因敲除后会表现为类似营养匮乏或饥饿导致的发育停滞和死亡。然而奇怪的是，mTORC1通路中感应氨基酸的相关蛋白缺失并不一定导致严重的发育缺陷，亦或者在不同的物种间这些感应蛋白并不保守，因此人们对于mTORC1通路如何整合环境中氨基酸信号进而调控生长发育的机制仍不清楚。在2013年上海科技大学朱焕乎课题组发现一类集氨基酸、脂肪酸和糖类为一体的特殊鞘脂，葡萄糖神经酰胺可以激活mTORC1通路可调控线虫个体发育，但其具体的分子机制尚不明确。近期，其课题组在Cell子刊Cell Reports上发表了其最新的研究成果，他们利用线虫模型，经正向遗传筛选的方法惊喜的发现，肠道细胞中过氧化物酶体相关蛋白的突变会显著抑制mTORC1突变或葡萄糖神经酰胺缺失导致的发育缺陷表型，从而揭示了过氧化物酶体定位与鞘脂跨组织调控发育的机制。

mTORC1信号通路葡萄糖神经酰胺发育停滞或死亡过氧化物酶体 prx-11

肠上皮细胞

Science子刊：肠上皮细胞如何将信息传递到巡逻的T细胞？

肠上皮细胞是肠道内外环境的媒介，也是机体免疫屏障的重要组成部分，T细胞会在上皮细胞周围巡逻移动。但关于肠上皮细胞如何将信息传递到巡逻的T细胞，仍需深入探究。近日，美国拉霍亚过敏和免疫学研究所在Science Immunology发表最新研究，发现T细胞通过表达疱疹病毒侵入介导因子（HVEM）的蛋白进行交流，该蛋白促使T细胞存活更长的时间，并更多的移动以阻止潜在的感染，值得相关人员关注。

肠上皮细胞疱疹病毒侵入介导因子研究论文基础研究免疫屏障

牙周炎

南京大学医学院：牙周炎通过肠道菌群影响骨稳态

牙周病是最常见的疾病之一，影响全球高达90%的个体。严重的牙周炎可对许多全身性疾病产生不利影响，包括代谢综合征、糖尿病、胃肠疾病、偶发心脏瓣膜病、类风湿性关节炎和骨质疏松症。口腔微生物可能在这一过程中起着关键作用。然而，目前缺乏牙周炎对全身骨健康的影响的研究。南京大学医学院附属口腔医院闫福华教授和陈斌副主任医师等人发表在Journal of Clinical Periodontology上的一项基于小鼠模型的研究发现，牙周炎通过改变肠道菌群的组成而影响小鼠骨稳态，强调了肠道菌群在牙周炎和骨稳态之间的作用。

牙周炎骨稳态肠道菌群小鼠模型

肠胶质A2BR信号加剧DSS结肠炎，并导致上皮屏障功能障碍。

肠胶质细胞腺苷2B受体(A2BR)很有可能通过调节细胞外嘌呤的成分，导致炎症后肠道屏障功能障碍，但其具体作用机制尚不清楚。近日发表在Mucosal Immunology上的文章，通过构建肠胶质细胞特异性Adora2b敲除小鼠模型并研究其对DSS结肠炎引起的炎症和屏障功能障碍的影响，发现肠胶质细胞A2BR信号会加剧DSS结肠炎的免疫反应，并导致持续的肠道上皮屏障功能障碍。

沙门氏菌感染

Nature子刊：ILC3焦亡是宿主对沙门氏菌感染的一种防御机制

ILC3产生IL-22，与肠道中其他细胞协同作用，增强宿主对细菌感染的免疫抵抗。鼠伤寒沙门菌（S.typhurium）感染可引起人类食源性肠炎，ILC3s在其中的作用尚不明确。Nature Microbiology近期发表的文章，发现鼠伤寒沙门菌可利用ILC3产生的IL-22促进其在小鼠中的感染，同时鼠伤寒沙门菌直接感染ILC3导致细胞焦亡，也是宿主对沙门氏菌感染的一种防御机制。

沙门氏菌感染 ILC3 细胞焦亡

自身免疫性肝炎

Cell子刊：肝脏菌群失调引发Tet2缺陷小鼠的自身免疫性肝炎

产IFNγ的CD8 T细胞（Tc1）在自身免疫性肝炎（AIH）中起重要介导作用，但什么因素导致了Tc1的过度活化尚不清楚。Cell Host and Microbe近期发表的一项研究发现，在由缺乏Tet2（Tet甲基胞嘧啶双加氧酶2）引起的自身免疫性肝炎（AIH）小鼠模型中，肝脏内的产芳香烃受体（AhR）配体的细菌增多（如某些乳杆菌物种），这促进了AhR配体介导的Tc1细胞分化和活化，从而驱动了AIH的发生。

自身免疫性肝炎肝脏菌群罗伊氏乳杆菌芳香烃受体配体小鼠

群体感应

乔建军+郭菲+杨爱东：构建人类肠道菌群群体感应网络

群体感应（QS）是微生物之间交流的一种主要方式。Nature Communications近期发表了来自天津大学乔建军团队、中南大学郭菲团队、牛津大学杨爱东团队的合作研究，建立了人类肠道菌群的QS数据库（http://www.qshgm.lbci.net/）和QS通讯网络，为进一步解析肠道菌群互作、构建合成菌群和开发微生态疗法具有重要参考意义。

群体感应肠道菌群数据库