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文章数:189篇
抗肿瘤免疫
Nature子刊:肠道菌如何影响甲硫氨酸限制引起的抗肿瘤免疫?
一些临床前研究发现,限制甲硫氨酸(MR)这种含硫必需氨基酸可抑制癌症生长并改善治疗反应。然而,在免疫系统完整的情况下,MR 如何影响癌症的进展尚不清楚。Nature Metabolism近期发表的研究,揭示了MR、硫缺乏和抗肿瘤免疫之间的负向相互作用,并发现肠道微生物群在介导这种相互作用中具有重要作用,提示MR 可能带来的任何抗癌益处都需要同时仔细考虑微生物群和免疫系统。
抗肿瘤免疫
甲硫氨酸
肠道菌群
耐药组
肠道抗性基因组的增加与哪些疾病有关?有什么关系?
抗药性基因组是微生物组中抗生素抗药性基因(ARGs)的集合,与临床相关抗生素抗药性的产生有关。然而,耐药性组与抗生素治疗和非抗生素治疗疾病之间的一致性尚未确定。Microbiome发表的研究中,重新分析了来自 26 项病例对照研究的人类肠道微生物组数据,以评估疾病与抗药性组之间的联系。结果发现,使用抗生素治疗的疾病与肠道抗性基因组的增加有关,这表明历史上抗生素的暴露对疾病相关菌株的 ARG 获取产生了相当大的选择性压力。
耐药组
抗生素
成纤维细胞
单细胞测序探究克罗恩病肠道狭窄的发病机制
成纤维细胞在克罗恩病(CD)狭窄形成中起着关键作用,但要了解其发病机制,需要进行系统研究,以发现新的治疗靶点。Gastroenterology发表的研究通过生成首个肠道狭窄的单细胞RNA测序(scRNAseq)图谱来描述成纤维细胞的异质性和功能,并提示CDH11 是一个潜在的治疗靶点,本研究或为更好地了解 CD狭窄的形成提供了新的思路。
成纤维细胞
克罗恩病(CD)
肠道狭窄
单细胞测序
肠癌
大肠癌的表观遗传和转录亚型的转录因子表达基础是什么?
结直肠癌(CRC)是一个异质群体,可分为表观遗传亚型和转录亚型。表观遗传亚型的基础(以不同程度的启动子 DNA 高甲基化为例)及其与转录亚型的关系尚不十分清楚。PNAS发表的研究,将癌症特异性转录因子(TF)表达变化与 CRC 及其恶性前病变中启动子和增强子区域 TF 结合位点附近的甲基化变化联系起来,从机理上揭示了 CRC 分子亚型的起源和演变。
肠癌
表观遗传
转录因子
抗生素暴露
抗生素暴露或可增加食管癌风险
接触抗生素会导致肠道菌群的变化。Clinical Gastroenterology and Hepatology发表的研究,目的是评估抗生素暴露与食管腺癌(EAC)风险之间的关系。结果发现,抗生素暴露与EAC风险增加有关, 并在一定程度上解释了过去几十年美国EAC发病率的显著上升,同时为并探索新的EAC治疗提供新的靶点。
抗生素暴露
食管癌
结直肠癌
房静远+洪洁+陈豪燕Cell子刊:菌群失调相关的尿素积累或促大肠癌
宿主-微生物群代谢相互作用失调在结直肠癌的发生中起着关键作用。Cell Metabolism发表的来自上海交通大学房静远、洪洁、陈豪燕与团队的研究成果,发现宿主的尿素循环在结直肠肿瘤发生过程中被显著激活,伴随以缺乏尿素分解能力为特征的肠道菌群变化。尿素的积累可使巨噬细胞偏向以多胺积累为特征的促肿瘤表型。在小鼠模型中,使用尿素循环抑制剂或基于双歧杆菌的补充剂治疗,可以缓解尿素介导的肿瘤发生。总之,这项研究强调了尿素循环抑制剂或使用益生菌调节微生物组成以预防结肠直肠癌的潜在作用。
结直肠癌
多胺
巨噬细胞
肠道菌群
尿素循环
个性化医疗
Nature子刊:基于BMI的多组学特征分析预测健康表型
多组学分析可以揭示健康和疾病状态的人群异质性。肥胖症导致了无数的代谢紊乱,并且是多种慢性病的风险因素。Nature Medicine发表的研究,纳入1277人的队列表型数据,利用包括人类基因组和代谢组学、蛋白质组学、临床实验室测试、肠道微生物组等,采用机器学习来预测BMI,并报告了肥胖症的异质性分子特征。总之,这项研究强调了血液代谢物分析对预测和预防医学的作用。
个性化医疗
多组学
肥胖
IBD
Lancet 子刊:如何减少IBD护理成本?
近年来,几乎所有的高收入国家都报告了IBD对卫生保健系统日益增加的财政负担。Lancet Gastroenterology & Hepatology近期发表文章,讨论了目前IBD护理的成本、成本增加的驱动因素以及未来如何为IBD提供可负担的护理。
IBD
护理费用
免疫调节
农大团队:鸡回肠中有免疫调节作用的微生物
在生命早期,肠道微生物群对宿主免疫系统的发育和抵抗病原体感染做出了重要贡献。ISME Journal发表的来自中国农业大学动物科学技术学院刘丹团队的研究中,探讨了回肠微生物群对鸡的免疫细胞发育和功能的影响,并确定了参与免疫系统调节的微生物群成员,从而为有针对性的家禽免疫干预,防治感染性疾病,促进家禽健康和生产奠定了基础。
免疫调节
回肠微生物
肉鸡
蓝色食品
Nature:通过4种方式,蓝色食品帮助各国实现食品系统目标
来源于水生环境的蓝色食品对许多国家的经济、生计、营养安全和文化都很重要。蓝色食品通常营养丰富,与许多陆地肉类相比,会产生更少的排放,对土地和水的危害也较小,并有助于许多农村社区的健康、福利和生计。Nature近期发表的研究中,Blue Food Assessment最近评估了全球蓝色食品的对营养、环境、经济等方面的影响,并提出了四个政策目标,以促进蓝色食品对世界各地国家食品系统的贡献。
蓝色食品
人工肠道组织
开发人工肠道组织,用于混合、分解肠道内食物
肠道肌肉层执行各种肠壁运动,以达到控制推进和混合肠道内容物的目的。设计具有复杂收缩功能的肠道肌肉层对于开发生物人工肠道组织以治疗短肠综合征患者至关重要。Advanced Materials发表的研究,制造了一个电纺正交双层支架,其纤维排列整齐,模仿了肠道肌肉层的自然几何形状,能够产生三种不同的运动模式。我们的发现突出了结合生物分子和生物材料方法进行组织工程的重要性,为研究消化道运动和临床前药物发现提供了一个更加生理化的模型。
人工肠道组织
肠道组织工程
肠道平滑肌再生
表观遗传学
Nature 子刊:细胞间交流的表观遗传学决定胃肠道器官的命运
胃肠系统中的上皮-间质信号在器官发育过程中建立区域特征和维持成人干细胞的平衡方面至关重要。研究发现在胃肠道发育和干细胞稳态过程中需要间质细胞表达的Wnt配体,但细胞交流驱动的时空控制的表观遗传机制仍然是未知的。Nature Communications发表的研究证明,胃肠间质细胞通过Polycomb Repressive Complex 2介导的染色质二重性来控制上皮细胞的命运和功能。
表观遗传学
胃肠道发育
器官发育
间质PRC2(Polycomb repressive complexes)
肿瘤细菌
国内团队:大肠癌患者的全身性炎症与肿瘤细菌有关
在结直肠癌(CRC)中,全身性炎症和肿瘤相关细菌之间的关系尚不清楚。Cell Death and Disease发表的来自华中科技大学Tian Shan+ 蔡开琳团队的研究成果,探讨了(1)全身炎症反应指数(SIRI)对经历过手术治疗的CRC患者生存结果的预后影响,(2)SIRI水平与CRC中肿瘤相关细菌之间的潜在联系。结果发现,高水平的基线SIRI是一个强有力的生物标志物,可以预测更差的生存结果。此外,低SIRI组和高SIRI组之间肿瘤相关细菌组成的显著差异表明,低SIRI组的微生物群的多样性明显比高SIRI组丰富。
肿瘤细菌
全身炎症水平
结直肠癌
非T细胞依赖反应
Science子刊:非T细胞依赖反应,可调动针对肠道细菌抗原的边缘区B细胞分化
边缘区(MZ)B细胞是小鼠中非T细胞依赖(TI)反应的主要参与者之一。Science Immunology发表的研究成果,为了确定负责在免疫反应中产生抗肺炎球菌capPS IgM、IgG和IgA的B细胞亚群,用Pneumovax(一种TI疫苗模型)为健康人接种疫苗。肺炎球菌疫苗产生了大量的浆细胞(PC)反应,系统地动员了预先多样化和预先扩增的克隆,其中主要包括IgM。肺炎球菌特异性克隆显示出对肠道菌群中多种细菌的识别,表明人类的TI反应主要是调动MZ和转换的B细胞。
非T细胞依赖反应
B细胞分化
肠道细菌抗原
急性阑尾炎
急性阑尾炎或表现两种不同的微生物组特征
越来越多的证据表明,急性阑尾炎(AA)不是一种疾病,而是两种疾病:复杂的阑尾炎,它与导致穿孔或阑尾周围脓肿的坏死有关;非复杂的阑尾炎,它不一定导致穿孔。Gut Microbes发表的研究,前瞻性地招募了60名AA患者,根据术后病理结果对他们进行分组,并分析阑尾以及腹膜和直肠(拭子)中的微生物组成。结果发现无并发症的AA的特点是典型的胃肠道微生物的相对丰度增加,而有并发症的AA则与易位的口腔微生物有关。本研究提示,AA存在两种疾病类型,先进的微生物组诊断可以改善无并发症的AA的非手术治疗。
急性阑尾炎
口腔病原菌
肠易激综合征
快速结肠转运对IBS患者粪便菌群和短链脂肪酸的影响
Gut近期发表的研究,在先前研究(https://www.mr-gut.cn/papers/read/1060834547)的基础上,进一步比较了有和没有快速结肠转运(CT)的同一队列IBS-D患者(共181人)在调整胆汁酸代谢改变前后的微生物组组成和SCFA。结果表明,在IBS-D患者中,微生物群的改变与胆汁酸代谢的改变有关,而不是与快速CT或SCFA的改变有关。
肠易激综合征
胆汁酸代谢
短链脂肪酸
粪便菌群
电针灸
国内团队:电针灸治疗帕金森病患者的运动功能障碍和便秘
运动障碍和非运动障碍(如便秘)是影响帕金森病(PD)患者生活质量的主要因素。EClinicalMedicine近期发表的来自上海中医药大学吴焕淦团队的研究成果,探讨了电针结合常规药物治疗对帕金森病患者运动功能障碍和便秘的疗效和安全性。结果表明,与常规药物治疗相比,常规药物治疗联合电针治疗能明显增强PD患者的运动功能,增加肠道运动,提示电针灸或可作为一种安全有效的辅助治疗手段用于改善PD患者的运动功能障碍和便秘症状。
电针灸
帕金森病(PD)
运动障碍
便秘
溶解病毒
Nature Reviews:溶瘤病毒治疗癌症的进展与挑战(综述)
肿瘤溶解病毒(OVs)是一类新兴的癌症治疗方法,具有在肿瘤细胞中选择性复制、传递多种真核转基因有效载荷、诱导免疫原性细胞死亡和促进抗肿瘤免疫的优点。Nature Reviews Clinical Oncology发表的综述文章中,概述了目前正在进行临床开发的一些新型OVs,这些OVs可以作为单药治疗,也可以作为联合治疗的一部分,同时讨论了目前限制OVs发展的一些临床和监管方面的障碍,为优化OVs,尤其是T-VEC在临床实践中的应用提供了指导。
溶解病毒
癌症治疗
Talimogene laherparepvec(T-VEC)
Piezo2通道
Cell子刊:Piezo2通道或是改善腹痛的新靶点
炎症性和功能性胃肠道疾病,如肠易激综合征(IBS)和梗阻性肠病(OBD)是最普遍的内脏疼痛形式的基础。尽管内脏疼痛一般可由机械性膨胀/拉伸引起,但在结肠传入的内脏机械敏感性的基础上,其机制仍然难以确定。Neuron近期发表的研究表明,TRPV1系的痛觉感受器所表达的Piezo2通道在生理条件下有力地促进了小鼠的内脏机械敏感性和痛觉,以及在病理条件下的内脏超敏性,提示Piezo2或可作为治疗内脏疼痛的潜在治疗靶标。
Piezo2通道
TRPV1系神经元
梗阻性肠病
肠易激综合征(IBS)
微生物组
Cell 子刊:微生物组可以用来预测生态系统特征(观点)
微生物组可以反应生态系统的特征,同时也直接参与生态系统的过程。因此,可以利用微生物组来预测生态系统的过程和状态。Trends in Microbiology发表的综述文章,讨论了利用微生物组来预测生态系统的方法,以(1)帮助农民、林务人员、医生和兽医决定最佳的管理方法来优化生态系统服务,以及(2)指导微生物组的操作工作,从而帮助解决人类最紧迫的问题,如环境退化、抗生素抗性或食物短缺等。
微生物组
预测模型
生物传感器
用于诊断和治疗的生物传感器
工程菌可以感知疾病生物标志物并做出反应,用于检测和治疗疾病。ACS Synthetic Biology发表的研究,针对不同的肠道生理特征分别构建了8个质粒载体,并在线虫模型中进行体内的验证。本研究中提出的载体或可提供更多的质粒工具用于多种信号的检测,并利用益生菌EcN作为细菌治疗和诊断工具的底盘。
生物传感器
工程菌
EcN
检测
色氨酸代谢
改变色氨酸代谢,或可改善IBD
色氨酸(Trp)代谢的改变如何影响炎症性肠病(IBD)尚不清楚。Gut发表的研究发现了一个将色氨酸代谢与肠道炎症和IBD联系起来的新机制。给结肠炎小鼠补充XANA和KYNA后,能缓解结肠炎。通过用AADAT(犬尿氨酸转氨酶2,可以将犬尿氨酸和3H-犬尿氨酸分别转化为KYNA和XANA)干预结肠炎小鼠,操纵内源性代谢途径,可降低小鼠结肠炎症程度。本研究或可为治疗IBD提供新的思路。
色氨酸代谢
IBD
黄嘌呤
犬尿酸
肠易激综合征
Nature Reviews:靶向内源性大麻素系统,治疗IBS腹痛(综述)
肠易激综合征患者的内脏疼痛管理在临床上颇具挑战,可用的治疗方案很少。病人越来越多地使用大麻和大麻素来控制腹痛。Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology发表的综述文章,介绍了关于大麻素系统(ECS)的知识,讨论了大麻素在疼痛管理中的应用,并将其与其他治疗方式进行比较,包括阿片类药物和神经调节剂。最后还探讨了新出现的以内源性大麻素系统为目标的治疗方法。
肠易激综合征
腹痛
内源性大麻素系统
口腔细菌
Nature子刊:口腔中的小韦荣球菌如何在发炎的肠道中定植?
口腔微生物在肠道的定植与多种疾病有关,如炎症性肠病(IBD)和结肠癌,但其中异位定制的机制尚不清楚。小韦荣球菌(Veillonella parvula)是一种从有机酸中获取能量的口腔细菌,在炎症性肠病患者的肠道中丰度显著升高。Nature Microbiology最新发表的研究成果,证明韦荣球菌菌株可利用炎症的标志性代谢物硝酸盐,作为终端电子受体进行厌氧呼吸,并通过扩展自身代谢途径,以利用氨基酸等碳源进行生长。本研究结果提供了一个研究框架,帮助理解IBD和其他炎症患者中韦荣球菌属物种的丰度增加的机制。
口腔细菌
异位定植
硝酸盐
小韦荣球菌
炎症性肠病
IBD
基于活检和血液的IBD炎症分子生物标志物
IBD的分子病理检测可以增强IBD的防控,其中包括潜在的较少的侵入性评估。Gut发表的研究,通过使用基于粘膜活检或循环血液RNA中测量的特定基因表达水平的炎症分子评分,为肠道炎症提供了另一种客观和更深入的量化评估标准,这套评分标准可以加强目前用于疾病监测的临床评估,并有可能预测治疗反应和疾病复发风险较高的患者。
IBD
标记物
活检
合成菌群
Cell:复杂且明确的合成人类肠道菌群模型
在小鼠中建立人类肠道微生物组模型有助于探究宿主-微生物相互作用。然而,目前的模型群落仍有较大缺陷:或是种类组成明确但结构相对简单,或是结构相对复杂但种类组成不明确,这极大的限制了人肠道微生物群模型的应用。Cell最新发表了斯坦福大学Michael Fischbach和Kerwyn Huang团队的研究论文,成功构建了一个人肠道微生物来源的、物种组成明确、结构复杂的群落hCom2。hCom2能反应人肠道微生物组的大部分生物学特性,并且该群落组成稳定,对病原体定植有很强的抵抗力,该模型或有助于对影响宿主健康的基因、微生物种类进行机制研究。未来需进一步完善该群落,包括增加细菌菌株以占据空的生态位,以及古细菌、真菌和病毒等肠道中的其它重要物种。
合成菌群
肠道微生物组
肠道代谢物
肠道衍生代谢物如何影响斑马鱼的神经发育和Wnt信号?
肠道菌群产生的小分子代谢物具有神经活性,能直接影响大脑和中枢神经系统,但关于这些代谢物在神经发育和神经基因表达的最早阶段的研究相对缺乏。Microbiome发表的文章,发现斑马鱼肠道菌代谢物能影响斑马鱼胚胎早期神经发育,并且Wnt信号通路这一过程中起了主导作用。本研究提示,对新陈代谢-Wnt-神经发育轴的进一步研究,或可有助于对无数Wnt-相关精神疾病提供更好的治疗思路。
肠道代谢物
神经发育
纳米载体
Nature 子刊:如何构建基于细菌膜材料的肿瘤疫苗纳米载体?
Nature Protocols近期发表的来自国家纳米科学中心聂广军团队的研究成果,提出了一种基于细菌膜材料的两类纳米载体的构建和使用方案,可用于癌症疫苗的递送。癌症疫苗通过触发针对肿瘤抗原的特异性T细胞反应来抑制肿瘤,这一过程可以通过纳米载体来加强。受人体对细菌入侵的自然免疫防御的启发,研究团队开发了两种不同类型的基于细菌膜材料的纳米载体,分别采用基因工程的外膜囊泡(OMVs)或含有细菌细胞质膜的混合膜囊泡(HM-NPs)。基于OMVs的纳米载体可以通过表面修饰的即插即用系统快速显示不同的肿瘤抗原,在可以确定肿瘤抗原的情况下,适用于定制癌症疫苗。HM-NPs是通过手术切除的肿瘤组织中的细菌细胞质膜和原生肿瘤细胞膜融合而制备的,在肿瘤抗原不容易获得的情况下,作为个性化的癌症疫苗具有独特的优势。
纳米载体
肿瘤疫苗
药物递送
胞外囊泡
CRISPR
PNAS:双歧杆菌的基因组和表观遗传学,共同影响CRISPR的基因组编辑结果
双歧杆菌是人肠道中普遍存在的一种共生细菌属,与人体健康密切相关。PNAS发表的文章,利用内源性I-G型CRISPR-Cas系统,并采用外源性CRISPR碱基编辑器进行乳双歧杆菌的基因组工程,证明基因组和外源性背景都会驱动不同菌株的编辑结果。本研究结果提示,菌株间的变异会影响基因组编辑的部署,强调了为不同的细菌菌株开发个性化的基于CRISPR的基因组工程方法的必要性。
CRISPR
双歧杆菌
表观遗传学
B. animalis subsp. lactis
Bifidobacterium longum subsp. Infantis
工程菌
Science 子刊:可磁化的细菌微机器人,可响应刺激实现按需给药
细菌生物混合体由携带微型/纳米级材料的细菌组成,可以在磁力控制下将负载的药物递送到特定区域。然而,目前的细菌生物杂交设计缺乏高通量和方便的构造与有效的货物,因此在推进力、有效载荷效率、组织渗透和时空操作方面表现不佳。Science Advances最近发表的研究,报告了在三维(3D)生物基质中定向定位和多刺激反应药物释放的磁控细菌机器人,允许通过外部施加的磁场进行动态导航控制,使其定位到肿瘤组织中。同时,通过近红外光和pH值激活生物膜上的光敏和pH敏感的脂质体载体,控制化疗分子在肿瘤部位释放。本研究介绍的设计方法展示了一个高效的微观机器人平台,能实现多功能和响应刺激的药物递送。
工程菌
药物递送
细菌机器人
磁控细菌