American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine

急性呼吸窘迫综合征肺部菌群 ARDS Microbiome Omer H Yilmaz

这是American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine[IF：13.204]发表的关于在ICU的危重创伤患者的肺部菌群的研究和简要介绍，提示可以通过对肺部菌群的了解，促进对危重病人的有效治疗。很值得看看，特别推荐。

肺部菌群急性呼吸窘迫综合征吸烟 ARDS Michael A Fischbach

重症监护室

AJRCCM：ICU中肺炎患者的多重耐药性病原体感染风险

这是一篇篇幅不长，但值得特别关注的临床微生物研究，通过对316名ICU获得性肺炎患者的分析，鉴定出最常见的ICU内感染病原体及多重耐药基因的分布。值得关注，特别推荐。

重症监护室医院获得性肺炎呼吸机相关肺炎多重耐药性 guidelines

呼吸道感染

AJRCCM：鼻咽菌群是呼吸道感染的预言家？

这是介绍我们之前分享的一项呼吸道菌群研究（http://www.xunludkp.com/papers/read/1083264260）的小文章，没有图，但老规矩，值得特别推荐读一读！

呼吸道感染鼻咽菌群 airway Microbiome Respiratory disease

造血细胞移植

AJRCCM：利用宏基因组测序“揪出”隐藏的病原体

这篇短文介绍了通过宏基因组测序，在造血细胞移植患者的呼吸道中鉴定出一般临床诊断方法无法检测出的病原体，很值得一读，特别推荐。

造血细胞移植急性呼吸道疾病人冠状病毒人轮状病毒 bone marrow transplant

医院获得性肺炎

AJRCCM：Nanopore新技术，有突破但也还需改善！

这是对之前同一杂志发表的文章（http://www.xunludkp.com/papers/read/1096109452）的评论，肯定了Nanopore公司开发的MinION在快速鉴定肺炎病原菌中的突破性表现，也提出了一些希望和改进建议。特别推荐。

医院获得性肺炎临床宏基因组学 Hospital-acquired pneumonia bio-informatics metagenomics

呼吸道菌群

AJRCCM：婴儿呼吸道菌群的成熟受何因素影响？

American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine[IF：13.204]上关于婴儿呼吸道菌群发育和成熟的重要研究，特别推荐。

呼吸道菌群风险因素呼吸道感染 development Nasopharynx

婴儿支气管炎

AJRCCM：整合菌群及代谢组学，更好理解呼吸道感染！

介绍一项我们之前介绍过的研究（http://www.xunludkp.com/papers/read/1041289612），今天这篇小文章，没有图，不过仍然因为短小精湛却内容可读，特别推荐。

婴儿支气管炎代谢组学传染性呼吸道疾病 Microbiome infant bronchiolitis

毛细支气管炎

AJRCCM：鼻咽菌群及代谢产物与婴儿毛细支气管炎的严重性相关

这项研究发现，婴儿毛细支气管炎严重不严重，与鼻咽的菌群和其代谢产物有关，值得认真读一读。

毛细支气管炎婴儿代谢组学鞘脂鼻咽菌群

Nanopore测序仪

AJRCCM：Nanopore新技术，快速鉴定肺炎病原菌！

在临床实践中，快速检测并明确感染性疾病的病原体，对治疗意义重大。但传统的方法仍然主要依赖于19世纪末就有的培养技术，效率很低。临床上一直迫切需要能快速、准确且低成本的病原体检测技术，之前二代测序被寄予厚望，但一些固有短板还是阻碍了它的应用。现在，测序技术突飞猛进，其中英国的Nanopore公司势头很猛，所开发的测序仪甚至只比U盘大一点。这项研究正是介绍了利用这样的掌上测序仪，如何推动病原体的快速准确检测。虽然这离临床应用的距离还较远，但总归是个很重要的进步，特别推荐给大家！

Nanopore测序仪肺炎病原菌宏基因组临床宏基因组 pneumonia

IPF

AJRCCM：特发性纤维化肺病中的宿主-菌群相互作用

一篇关于特发性纤维化肺病中呼吸道菌群的研究，IF高达13分多，有好的设计的研究，还是可以发高分文章的。

IPF acute lung injury expression Microbiome usual interstitial pneumonia

呼吸道合胞体病毒细支气管炎

AJRCCM：利用菌群应对呼吸道合胞体病毒感染？

呼吸道菌群可能在呼吸道合胞体病毒感染中调节呼吸道炎症及疾病严重程度，未来或许可以利用菌群对疾病进行评估以后来有针对性应对病毒感染。推荐阅读这篇相关文献。

呼吸道合胞体病毒细支气管炎菌群 Bart O Roep Bart O Roep

disease severity

AJRCCM：鼻咽菌群、宿主转录组与RSV感染严重程度有关

① 呼吸道合胞病毒（RSV）是急性下呼吸道感染的主因；② 16S rRNA测序评估2岁以下RSV轻微和严重感染，及健康儿童的鼻咽菌群，并分析全血转录组探究菌群结构，RSV诱导的宿主转录组和临床疾病严重程度之间的关系；③ 结果区分出5个鼻咽菌群OTUs，RSV感染与流感嗜血杆菌和链球菌正相关，与金葡菌丰度呈负相关，IFN相关基因过度表达；④ 转录组和流感嗜血杆菌，金葡菌主导的菌群与Toll样受体相关基因的超表达和中性粒细胞及巨噬细胞活化信号相关。

disease severity microbiota Nasopharynx respiratory syncytial virus transcriptome profiling

Microbiome

AJRCCM：菌群是怎样促进肺部炎症的？

Microbiome COPD Autoimmunity IL-17 Jan-Hendrik Hehemann