Trends in Microbiology

病毒组土壤 Benjamin J Solomon Benjamin J Solomon

衣原体

TM：生殖道及胃肠道中的沙眼衣原体共同促进输卵管纤维化（综述）

这是Trends in Microbiology[IF：11.020]发表的关注同时可定殖于生殖道和胃肠道并促进女性输卵管纤维化的沙眼衣原体的综述，值得专业人士特别关注。

衣原体生殖道输卵管纤维化 Sophie C Payne Sophie C Payne

混合培养

TM：微生物混合培养前景可期（综述）

这是Trends in Microbiology[IF：11.020]近期发出的关于微生物混合培养的必读综述，一个字，专业人士肯定要好好看看的！

混合培养

组学

TM：了解肠道菌群的功能更重要（必读观点文）

这是Trends in Microbiology[IF：11.020]发表的重要观点文献，提出宏转录组、宏蛋白质组、代谢组等功能组学在促进人类对肠道菌群认知上的重要作用，并介绍相关研究方法的细节，其中的观点、图标都很有指导意义，值得精读。

组学菌群功能 Alba Rodríguez-Nogales Francesca Algieri Julio Gálvez

革兰氏阳性菌

TM：革兰氏阳性菌中的抗菌性分泌系统

这是Trends in Microbiology[IF：11.020]发表的系统性介绍革兰氏阳性菌中的7型分泌系统（T7SS）可能分泌具有抗菌效应的毒素蛋白的观点文章，值得专业人士细读。

革兰氏阳性菌革兰氏阴性菌 7型分泌系统 Carel W le Roux Piriyah Sinclair

诺如病毒

TM：干扰素在持续性鼠诺如病毒感染中的作用（综述）

这是Trends in Microbiology[IF：11.020]发表的关于干扰素在持续性病毒感染中的作用的综述，干货不少，推荐临床专业人士阅读。

诺如病毒 IFN-λ 干扰素 Mathias L Richard Harry Sokol

化疗

TM：化疗引发的耐药性

这是Trends in Microbiology[IF：11.020]刚刚online的一篇重要观点文章，认为化疗是促进细菌耐药性产生的重要因素。最近关于肿瘤治疗与菌群、细菌耐药的研究非常多，水平都很高，这个领域值得重点关注。

化疗耐药性 Cecilia Galbete Matthias B Schulze

群体感应系统

TM：靶向群体感应系统的新药机会（综述）

这是一篇非常重要的关于靶向“群体感应”的药物开发策略的综述，系统性总结了现有对群体感应的理解和药物研发的进展，很值得认真一看！

群体感应系统抗毒力疗法 Nadim J Ajami Nadim J Ajami

生物膜

TM：一文读懂口腔生物被膜（综述）

这是Trends in Microbiology[IF：11.020]发表的关于口腔生物被膜（Biofilm）的重要综述，不仅关注口腔菌群的人应该看，所有关注人体共生物生物的人都可以好好看看。

生物膜龋齿基质口腔菌群 Timothy J Hibberd

双歧杆菌

TM：双歧杆菌如何利用多糖和喂养其他细菌？（综述）

这是一篇针对双歧杆菌的重要综述，系统性总结了双歧杆菌如何利用多糖的机制，以及其如何通过代谢多糖为其他细菌提供食物。很精彩的综述，特别推荐。

双歧杆菌多糖利用互养 Bifidobacterium genomics

糖基转移酶

TM：宿主多糖如何影响细菌与病毒感染（综述）

这是Trends in Microbiology[IF：11.020]近期发表的系统性阐述宿主多糖在感染性疾病发生中的重要作用的综述，内容很干，值得精读。

糖基转移酶病毒感染糖基转移酶基因FUT2 FUT2 Glycosyltransferase

废水

TM：一文读懂废水中的耐药基因（综述）

这是刚刚在Trends in Microbiology[IF：11.020]上online的重要综述，系统性阐述了废水中抗生素、抗生素耐药基因、耐药细菌汇聚所带来的风险和挑战，如何鉴定和研究耐药基因以及如何应对和处理。非常值得好好读一读的综述，特别推荐。

废水耐药基因 horizontal gene transfer selection pressure Scott L Friedman

吞噬细胞

TM：抗生素有效无效，吞噬细胞的吞噬效率很关键（重要观点）

这是Trends in Microbiology[IF：11.020]新发表的关于吞噬细胞的吞噬效率如何影响在自限性感染中抗生素效力的重要观点文章，很精彩，很涨知识，值得认真读一读。

吞噬细胞抗生素

生殖菌群

TM：微生物对女性太重要！（必读综述）

生殖菌群泌尿生殖健康阴道菌群女性益生菌菌脉

古细菌

TM：一文读懂菌群里充满未知的古细菌（综述）

我们每每介绍菌群的时候都会说，目前看来，菌群里的微生物以细菌为主，但包括古细菌、真菌、病毒等等。其中古细菌受关注得相对很少，但其可能在菌群中有重要作用。这篇来自Trends in Microbiology[IF：11.020]的综述系统总结了关于古细菌的相关知识，值得通读精读。强烈推荐！

古细菌 Archaea archaeome microbial interaction Microbiome

拟杆菌属

TM：拟杆菌如何利用多糖？（综述）

这是一篇重要的关于拟杆菌如何利用多糖的综述，系统性总结了相关研究，深入到了拟杆菌的基因组进行相关研究，这很值得一读！

拟杆菌属多糖利用位点

癌症治疗

癌症患者感染，菌群是潜在治疗靶点（综述）

① 接受癌症治疗的患者具有高感染性并发症风险，因上皮屏障破坏而导致菌群迁移至无菌部位；② 多样性的菌群促进对致病菌的定殖抗性，癌症及治疗导致的免疫失调及黏膜炎可造成致病菌易位；③ 粘膜免疫系统的维持依赖于共生菌群的产物（LPS、鞭毛蛋白等）被TLR及NOD受体识别，菌群产生的丁酸盐、多糖A等对免疫系统起调节作用；④ 案例报道提示粪菌移植或可用于治疗癌症患者的感染，临床试验结果表明益生菌/益生元对癌症患者感染的疗效仍需验证。

癌症治疗细菌感染 Đorđe Miljković Suzana Stanisavljević

癌症治疗

TM：癌症治后易感染，或须重构强菌群！（综述）

这是迄今为止专门关注并系统性阐述：菌群在癌症患者治疗期间如何影响细菌感染的重量级综述，有很大的临床转化意义，必须强烈推荐！

癌症治疗细菌感染

珊瑚礁

TM：真核微生物组对珊瑚礁的重大意义（综述）

珊瑚礁真核微生物真菌微藻原生生物

生物膜

TM：一文读懂在生物膜内天然产生的抗生素（综述）

在充满各式各样细菌的生物膜中，细菌之间协作也有竞争，很多细菌会释放一些天然代谢产物——天然产生抗生素。这篇综述系统介绍相关概念、机制及研究进展，想在细菌里探宝寻宝的人，应该好好看看。

生物膜天然产物抗生素

肠道器官培养系统

TM：体外研究鸟枪换炮——直接培养肠道！

这是对之前我们介绍的Cell上的重要研究（http://www.xunludkp.com/papers/read/1049963276）的介绍，除了老规矩，这样的文章看看图就有收获，今天这篇值得特别介绍，就是简要介绍了肠道芯片、肠道类器官、原代上皮细胞2D培养等类器官方法并与新方法进行了一些比较。非常值得深读的小文章，特别推荐。

肠道器官培养系统 Helge Lyder Waldum Helge Lyder Waldum

大肠杆菌素

TM：不同大肠杆菌菌株之间你死我活的竞争

生态系统中，充满了共生共栖，但也充满了竞争和你死我活，甚至在“兄弟”之间。这两篇文章关注的就是不同大肠杆菌之间围绕着大肠杆菌素的竞争，Trends in Microbiology文章的英文题目叫“What Does Not Kill You Makes You Stronger（不能毁灭你的，会让你更加强大）”，讲的就是微生物世界里的生存规则。文章涉及生态学，有点深，但看懂会大涨知识，特别推荐。

大肠杆菌素 colicin landscape ecology percolation theory range expansion

植物生物量

TM：一文读懂植物生物质降解菌群

植物的生物质要被降解，特定的菌群功不可没，这些菌群都有什么菌？是如何协作来降解生物质的？如何改进和利用它们？这篇文章系统性阐述，很值得精读。

植物生物量植物生物量降解菌群 Puneet Puri Puneet Puri

微量营养素

TM：微量营养素影响肠道菌群的组成和功能

微量营养素 Gut microbiota micronutrient deficiency bacterial fitness

金黄色葡萄球菌

TM：金黄色葡萄球菌中抗生素耐药性的传播（综述）

① 金黄色葡萄球菌可其它菌株甚至其他属的细菌中获得抗生素耐药性基因，从而快速获得耐药性；② 耐药性基因的传播是由一系列互补的可移动遗传元件介导的，主要在细菌接合或噬菌体转导时发生；③ 近期研究发现，相比于从前的认知，细菌之间可通过接合传播更大范围的质粒，或进行更有效率的噬菌体转导；④ 本综述介绍了在金黄色葡萄球菌中的抗生素耐药性基因的传播途径。

金黄色葡萄球菌抗生素耐药性噬菌体转导接合转移

断奶仔猪

TM：断奶仔猪的肠道菌群失调（综述）

系统性介绍断奶仔猪肠道菌群的综述，必读！

断奶仔猪

微生物芯片

TM：利用芯片微生物组进行植物-菌群研究

文章介绍了一种可以在个体或者细胞水平观测植物-菌群动态的新技术——微流体技术。① 这种微流体装置是由弹性聚合材料（PDMS）做成的，内部结构以及流体特性均可知且可人为操控；② 这种微流体技术有四个主要优点：能精确控制环境条件、可用于高分辨动态成像研究、可获得大量数据信息、可模拟复杂的环境体系；③ 下一步的开发利用重点在：植物菌群动力学、根部菌群组成、根部菌群对植物N/P营养素利用以及固碳能力的影响。

微生物芯片植物菌群微流体技术

脂多糖检测

TM：哺乳动物与植物的LPS应答系统

① TLR、GPCR、整合素、受体样激酶、caspase等都是重要的脂多糖（LPS）结合蛋白；② 本综述描述了哺乳动物的LPS受体；③ 并重点介绍了：虽然没有宿主蛋白与所有的LPS应答相关，但有一种单一的脂质（磷脂酰肌醇-4.5-二磷酸，PIP2）可调节多种LPS应答，包括内吞、吞噬、炎症及细胞焦亡；④ 另外，描述了植物中的特殊LPS应答系统，并讨论了潜在的新型LPS应答系统。

脂多糖检测

尿路致病性大肠杆菌

TM：利用组学分析尿路致病性大肠杆菌的毒性（综述）

这篇综述的研究对象是尿路中的致病性大肠杆菌，不过研究方法值得所有关注菌群中细菌毒性的人认真学一学。

尿路致病性大肠杆菌

调节基因丢失

TM：细菌为何难培养？这个解释很靠谱（必读）

刚刚Online的Trends in Microbiology，发出了一篇很重要的文献，看看标题，你会知道应该读一读。

调节基因丢失代谢交叉喂养细菌培养代谢平衡