NPJ Biofilms and Microbiomes

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文章数：14篇

NPJBM：对肠道中艰难梭菌进行定量分析的新方法

这是NPJ Biofilms and Microbiomes发表的可以在种的水平精确量化正常人和感染者的肠道艰难梭菌比例的方法学研究，这个具有研究和临床应用价值，推荐阅读。

艰难梭菌 Patrick P Lowe Gyongyi Szabo

NPJBM：在瘤胃菌群中鉴定出的新型抗菌肽

这是NPJ Biofilms and Microbiomes发表的关于在瘤胃菌群寻找到新的具有抗菌活性的抗菌肽的研究，这很有应用启发价值，特别推荐。

抗菌肽瘤胃菌群

NPJBM：结直肠癌组织中的生物被膜及菌群特征

最近关于大肠癌组织中的微生物相关研究非常多，这篇Nature旗下杂志的文章，再次关注于此，并有一些创新——特别关注了生物被膜的特征。值得专业人士好好看看。

结直肠癌 Diogo Pratas Diogo Pratas

β-葡萄糖醛酸酶

NPJBM：与抗结直肠癌药物代谢相关的肠道菌群特征

关于肠道菌群可代谢抗癌药的代谢产物重新恢复药物活性的研究，是菌群与肿瘤相关领域的重点关注点，这项研究再次聚焦于此，分析是什么样的菌群类型会有更多代谢药物所用的酶。值得专业人士关注，特别推荐。

β-葡萄糖醛酸酶伊立替康药物代谢 Elena F Verdu Alberto Caminero

NPJBM：研究牛皮癣相关皮肤菌群，分析到菌株水平很必要！

一项关于牛皮癣（银屑病）相关皮肤菌群的研究，结果值得关注，作者的观点也值得思考。在菌群研究的时候，是否要把分辨率精确到菌株水平，一直有各种争议，那么你的观点呢？

银屑病皮肤菌群菌株水平 Morten O A Sommer Dan I Andersson

NPJBM：海水淡化反渗透膜中的菌群长啥样

这篇文章介绍了淡化海水时使用的反渗透膜中的菌群组成，有趣的研究，值得一读。

反渗透膜海水淡化 Matthew T Sorbara Matthew T Sorbara Eric G Pamer

NPJBM：粪菌移植后，供体菌群可在个别受体肠道留存2年！

一项分析在粪菌移植中，同一供体的菌群在不同个体中留存情况的研究，发现移植后3-6个月，受体体内都会留存供体菌群，甚至有2个供体体内在2年后还可见供体菌群，很有趣，也很重要的发现！特别推荐！

粪菌移植 Andreas Peschel Bernhard Krismer Christopher Weidenmaier Alexander Zipperer

NPJBM：冰川与冰盖中的微生物组（综述）

关于冰川与冰盖中微生物组的综述，感兴趣的人要认真读一读。

冰川冰盖

Coronary artery disease

NPJ BM：哪些口腔细菌与冠心病有关？

之前我们多次关注肠道菌群与冠心病的关系，这篇文章通过Meta整理和分析，确认口腔细菌也有冠心病有关，很有趣的文章，推荐给大家。

Coronary artery disease atherosclerotic plaque oral commensal bacteria META-ANALYSIS Helen T Ding

微生物生物膜

NPJ BM：微生物生物膜和人体皮肤菌群（综述）

NPJ Biofilms and Microbiomes上关于微生物生物膜和人体皮肤菌群的重要综述，非常值得一看，推荐给大家。

微生物生物膜皮肤菌群 Lauren E Hudson Anita H Corbett

NPJBM：芳香烃受体如何与菌群互作以调节代谢？

芳香烃受体在调节适应性免疫以影响炎症、异生物质代谢方面具有重要作用，最近很多文章关注肠道菌群如何代谢色氨酸以生成它的配体，这篇文章则系统介绍了芳香烃受体如何与菌群相互作用以调节宿主代谢，非常值得一看。

菌群代谢 Thomas Schwarz-Romond Thomas Schwarz-Romond

口腔生物膜模型

NPJBM：口腔菌群随时间到底会如何变化？

这篇文章介绍一种原位(in situ)模型，通过16s rRNA深度测序，对口腔中的细菌群落随时间的变化进行定量分析及综合鉴定。那么，口腔里的菌群，随着时间变化，到底会怎么变化呢？认真看文章吧。

口腔生物膜模型口腔菌群原位模型动态 Meng Li

利用序列相似性进行16S rRNA OTU聚类

① 16S扩增子分析的标准流程通常将序列相似百分比大于97%的序列聚类成OTU，在每个OTU中选择一条序列作为代表性序列，其被注释后，相应的注释应用于同个OTU中的剩余序列；② 用传统的PSD（成对比对序列相异性）方法聚类OTU，效果较差，影响下游分析；③ 通过用MSD（多序列比对序列相异性）和BLD（系统发育分支长度距离）两种方法聚类OTU，发现都超过OTU相异性阈值（通常为0.03）；④ 因此需转向更准确和基于系统发育的聚类方法来进行16S分析。

16S rRNA Alexandra Snyder Jedd Wolchok

npg生物膜与菌群：环境污染物有毒，菌群来解毒？

一篇很有意义的综述，推荐给大家。

肠道菌群环境污染物