遗传操作工具

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细菌基因组编辑

马延磊+晁彦杰等：详解肠道细菌的遗传操作工具（综述）

肠道菌群与健康和疾病密切相关，但人们对菌群基因-宿主相互作用的因果机制仍知之甚少。这在一定程度上是受限于肠道细菌的遗传操作工具。复旦大学附属肿瘤医院马延磊和中国科学院上海巴斯德研究所晁彦杰与团队在Trends in Microbiology发表重要综述，概述了开发肠道细菌遗传操作工具的挑战和进展，包括DNA递送、基于转座子和CRISPR的基因组编辑，以及它们在菌群相关人类疾病（如癌症和代谢性疾病）的医学研究中的应用。值得专业人士关注。

细菌基因组编辑肠道菌群工程菌遗传操作工具宿主-微生物互作

突变株构建

用于拟杆菌和副拟杆菌遗传操作的新工具

拟杆菌目细菌是人肠道菌群的重要成员，已发现超过55个菌种，包含非常多样化的菌株。为了进一步研究这些细菌的基因功能，研究者需要对细菌进行基因敲除等遗传操作，通常会使用特定抗生素对改造的细菌进行筛选，但随着人肠道细菌耐药性越来越严重，常用于筛选的抗生素也越来越不好用。mBio近期发表一项研究，开发了一类通用、高效的质粒载体，以让细菌获得新的多糖利用能力作为筛选策略，搭配诱导型毒素作为反筛标记，可用于在多重耐药的拟杆菌属和副拟杆菌属细菌中制造等位基因缺失和置换等基因突变，推荐专业人士参考。

突变株构建肠道拟杆菌遗传操作工具 Hamed Mohammadi Sepide Talebi

Nature子刊：通用的细菌遗传分析新工具Mobile-CRISPRi

绝大多数细菌缺乏将基因与表型系统关联的遗传工具，限制了理解基因和基因网络对细菌生理学和人类健康的影响。CRISPRi是一种使用无活性的Cas9蛋白（dCas9）和可编程的单个gRNA阻断基因表达的通用方法，它已成为从细菌到人类中的基因剖析基本和功能的强大遗传工具，但在细菌间缺少广泛有效的工具。本研究开发的Mobile-CRISPRi新方法有助于微生物组功能、抗生素抗性和敏感性的分析，以及用于宿主-微生物相互作用的全面筛选。

基因编辑 CRISPR 遗传操作工具