high-throughput sequencing

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文章数：10篇

陈廷涛+谭布珍：宫内菌群或影响不孕症治疗结局

体外受精是不孕症治疗的一个常见方式，但是其失败率仍然较高，其中的原因未被阐明。近期，南昌大学转化医学院陈廷涛团队与南昌大学第二附属医院谭布珍团队合作的研究结果发表在Frontiers in Cell and Developmental Biology上，本研究发现，宫内菌群结构和慢性子宫内膜炎或许是影响体外受精结局的一个关键因素，这给未来不孕症治疗提供了新的思路。

子宫菌群研究论文女性不孕症慢性子宫内膜炎

哪些因素影响了蚊子的肠道菌群

肠道细菌在蚊子传播疟疾的媒介效能中起了关键作用。Microbiome上发表的一项最新研究对蚊子肠道菌群组成的调控因素进行了分析，发现种类和饮食对菌群的影响较小，而不同的发育阶段及地理位置对菌群组成的影响较大，这些结果为蚊子等病媒生物的生物防除策略提供了理论基础。

蚊子菌群 Anopheles darlingi Anopheles nuneztovari Bacterial communities Colombia

北医三院姜薇：中重度寻常痤疮患者的肠道菌群变化

寻常痤疮是在85%的青少年中存在的一种慢性炎症性皮肤病。来自北京大学第三医院姜薇团队在Journal of Dermatology上发表的一项最新研究，对比了中重度寻常痤疮患者和健康个体的粪便菌群，鉴定出与痤疮相关的菌群特征。

痤疮 Acne vulgaris difference Gut microbiota high-throughput sequencing

JAM：饲料中添加中药可显著改善银鲫的肠道菌群

这是中科院水生所及江苏省渔业技术推广中心团队合作在Journal of Applied Microbiology[IF：2.099]发表的将中药添加到饲料对异育银鲫（中国常见的养殖鱼类）肠道菌群的影响的研究，结果值得关注。

中药异育银鲫 Gibel carp high-throughput sequencing Intestinal Microbiota

临床宏基因组学

BMCB：在临床诊断中快速鉴定病原体的新方法

这是中国疾控中心团队在BMC Bioinformatics[IF：2.448]发表16S测序数据分析新方法16SPIP的文章，推荐专业人士阅读。

临床宏基因组学 16s 16SPIP Comprehensive analysis pipeline high-throughput sequencing

微生物考古学

ARGHG：如何进行微生物考古学研究（综述）

① 在高通量测序时代，微生物考古学盛行，揭示毁灭性的历史瘟疫背后的病原体、鉴定史前病原体的神秘变化、重组人类祖先的菌群；② 本综述引入学科的基本概念和理论框架，讨论从考古学样本中进行病原学鉴定和菌群特征描述的方法学；③ 微生物考古学研究分为二大类：病原基因组学及微生物组研究；④ 特别关注采用高通量DNA测序数据进行鉴别、证实、鉴定的程序；⑤ 最后，概述指导该领域进一步研究的七个标准和预防措施。

微生物考古学古DNA ancient DNA metagenomics Microbiology

Oncotarget：黄芩汤通过调节肠道菌群改善小鼠结肠炎

一项中药（黄芩汤）与肠道菌群的研究，推荐阅读。

黄芩汤肠道菌群高通量测序溃疡性结肠炎 Huangqin decoction

ME：银鲫的肠道菌群发育规律

又一篇鱼类肠道菌群的研究论文，转需。

发育异育银鲫肠道菌群 16S rRNA gene Gibel carp Gut microbiota

Asiatic black bear

MGG：来自中国不同省份的黑熊肠道菌群特征

IF不高，但来自中国团队，我们在编辑日报的时候看到一般还是会特别推荐。

Asiatic black bear Gut microbiota high-throughput sequencing Microbial diversity Shruti Naik

mSystems：新软件能筛选未分类/罕见菌群序列OTU

新的方法学，值得一读。

16S rRNA high-throughput sequencing microbial dark matter Microbiome rare biosphere