Charles Y Chiu

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Charles Y Chiu

文章数：9篇

腺相关病毒

Nature：儿童不明原因肝炎，腺相关病毒2或是真凶

发表在《Nature》上的另一篇研究提示，最近发生的儿童不明原因重症肝炎的发生可能与腺相关病毒2的感染是存在关联的。这给进一步的公共卫生预防措施的制订指明了方向。

腺相关病毒研究论文儿童不明原因肝炎人腺病毒

Cell子刊：母婴肠道病毒组发育纵向研究

目前针对人类肠道病毒组及其早期生命发育的研究很少，尤其是婴儿病毒组的进化。近日，发表在Cell Host and Microbe上的这篇文章，利用宏基因组病毒测序研究了生命早期婴儿病毒组的纵向进展并对母婴对病毒组进行了纵向比较。

病原体检测

Nature子刊：mNGS实现对体液样本的快速病原体检测

Nature Medicine近期发表研究，介绍了一种两大测序平台（illumina和nanopore）通用的基于体液样本的快速病原体检测方法，或有临床应用价值。

病原体检测宏基因组学二代测序医学研究

Nature子刊：低成本的靶向富集病毒的宏基因组测序方法（MSSPE）提高病毒诊断效率

本文开发了带有靶向引物富集（MSSPE）的宏基因组测序，该方法可富集目标RNA病毒序列，同时保留对其他病原体的宏基因组敏感性。本文对14种不同病毒的进行了评估，结果显示，与仅用mNGS相比，其基因组含量增加了10倍，平均值覆盖度增加了47%(±16%)。值得注意的是，利用MSSPE成功富集了未被预先特异性靶向的重新出现和/或共感染病毒(包括Powassan和Usutu)的序列。MSSPE简单，低成本，快速并且可部署在台式或便携式纳米孔测序仪上，从而使该方法直接适用于诊断实验室和现场使用。

加标引物宏基因组测序病毒诊断 mNGS RNA病毒

Nature子刊：肠道病毒或引起急性无力脊髓炎

自2012年起，美国每两年经历一次急性无力脊髓炎（AFM）的爆发。有研究认为肠道病毒可能是引起AFM的原因，但尚无明确证据。Nature Medicine上发表的一项最新研究，通过检测脑脊液中的抗病毒抗体，发现相比于其它神经系统疾病的患儿，AFM患儿脑脊液中的抗肠道病毒多肽抗体显著富集，提示肠道病毒或是AFM的罪魁祸首。

肠-脑轴急性无力脊髓炎肠-脑轴肠道病毒噬菌体展示

宏基因组病原检测

NEJM：宏基因组测序助力脑膜炎和脑炎的临床诊断

New England Journal of Medicine近期发表的一项临床研究，显示出对脑脊液的宏基因组测序，有助于改善脑膜炎和脑炎的病原体诊断，并在部分病例中对医生的治疗方案有指导作用。

宏基因组病原检测脑膜炎脑炎 Enyuan Cao Enyuan Cao

宏基因组高通量测序

Nature Reviews ：宏基因组技术临床运用的前现状与挑战（综述）

宏基因组高通量测序（mNGS），正迅速从科研转向临床应用，会逐渐改变疾病诊断和治疗的方式。《Nature Reviews Genetics》近期发表综述，系统性总结了目前mNGS在疾病诊和治疗中可发挥的广泛作用，尤其强调了在病原检测上的巨大作用，并指出了该技术在临床运用上面临的挑战，值得参考。

宏基因组高通量测序临床应用综述

宏基因组病原检测

宏基因组测序技术运用于病原检测（综述）

高通量测序有望提高感染性疾病的病原检测和诊断效率。《Annual Review of Pathology-Mechanisms of Disease》近期发表综述，系统性介绍了宏基因组病原检测的平台、流程、优势与局限性以及代表性临床案例，对于详细了解该技术有重要参考价值。

宏基因组病原检测 clinical diagnostics infectious disease metagenomics nanopore sequencing

呼吸道菌群

综合呼吸道中的菌群、致病菌及宿主转录组的数据以诊断下呼吸道感染

在重症患者中，如何区分下呼吸道感染与非感染性炎症症状是一大难题。PNAS上发表的一项最新研究，结合患者呼吸道的菌群、致病菌及宿主基因表达数据构建算法模型，可以较高的准确率在重症患者中诊断下呼吸道感染。

呼吸道菌群 Lower respiratory tract infection Mechanical ventilation next-generation sequencing pneumonia