Daniel P Beiting

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Daniel P Beiting

文章数：7篇

从宏基因组数据中鉴定真核生物的工具CORRAL

微生物群落中，真菌和原生生物等真核生物经常与细菌和古菌共存。大多数环境中，由于原核信号占主导地位，因此很难用“鸟枪法”宏基因组测序来研究它们的存在。最近的真核生物检测方法是使用真核生物特异性标记基因，但它们没有包含处理参考标记基因集中没有代表的真核细胞存在的策略，并且它们与基于网络的用于下游分析的工具不兼容。Microbiome近期发表的文章，开发出从鸟枪宏基因组数据中鉴定真核生物的工具——CORRAL，并进行公开分享。

宏基因组真核生物

怀孕次数影响母婴肠道菌群

母体肠道菌群可影响母亲和后代的健康，同时，产次（之前怀孕的次数）也可影响早产等不良妊娠结局的风险。尽管二者均与母婴健康有关，但产次对母婴菌群的影响尚不清楚。Microbiome近期发表的一项研究以猪为模型，对这一空白进行了探索，表明产次可影响母体孕期菌群的变化和后代生命早期菌群的组成，这可能对母婴健康有潜在影响。这些发现提示，在研究人类母婴菌群时应纳入考虑产次这一因素。

母婴菌群产次猪

Cell子刊：肠道炎症中，多形拟杆菌将其它细菌的铁载体收为己用

炎症期间，我们的身体会限制微生物对铁的利用。Cell Host and Microbe近期发表的一项研究发现，不表达铁载体的肠道共生菌（比如多形拟杆菌）可将其它肠道菌（比如肠杆菌科细菌）生成的铁载体“收为己用”，从而增强自身在宿主肠道炎症环境中的生存能力。这些发现揭示出肠道菌群内部的一种互养机制，可帮助菌群抵抗环境扰动。

肠道炎症菌群内互作 GUT INFLAMMATION iron metabolism siderophore

饮食干预治疗IBD的机制

饮食干预是治疗小儿克罗恩病的一线疗法，但其作用机制尚未明确。来自Microbiome上发表的一项最新研究，利用IBD犬类模型发现，饮食干预诱导的疾病缓解与菌群结构及次级胆汁酸的变化相关，并在小鼠结肠炎模型中确认了特定细菌及次级胆汁酸在缓解肠道炎症中的关键作用。

肠道炎症 IBD 饮食干预次级胆汁酸 Amanda L Muehlbauer

Cell子刊：特定共生菌群诱导IgA帮小鼠抵抗败血症

免疫球蛋白A（IgA）分为分泌型和血清型，许多研究表明前者在黏膜免疫中有重要作用，而对血清型IgA的了解则相对缺乏。上周Cell Host and Microbe[IF：14.946]上线了美国宾州大学的研究，证实在小鼠肠道中定殖特定种类的细菌后，可大量诱导分泌IgA的骨髓浆细胞，使血清IgA水平明显提高，帮助小鼠抵御感染引发的败血症。这是肠道菌群参与抗系统性感染的一个例证，值得关注。

脓毒症免疫球蛋白A（IgA）变形菌门

皮肤利什曼病

Cell子刊：失调的皮肤菌群，可传播并促进感染和炎症

关于皮肤菌群和寄生虫（利什曼原虫）感染相互关系的研究，关注皮肤菌群的人一定要看一看。

皮肤利什曼病皮肤菌群 cutaneous inflammation Dysbiosis leishmania

SR：孕妇压力大，对自己和子女的菌群分别有何影响？

孕期的压力，会通过菌群影响到后代么？看看这个研究。

孕期压力母亲菌群后代菌群 Miaomiao Li Xin Wang