Jeff Gore

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文章数：6篇

微生物生态学

胡脊梁等Science：预测复杂微生物群落的动态变化

复杂群落的生物多样性和动力学变化，能否通过简单的群落参数来预测？这是生态学研究中的一个重要问题。Science最新发表来自麻省理工大学Jeff Gore团队、胡脊梁博士作为第一作者的研究，结合理论模型和合成微生物群落实验，对这一问题进行了回答，表明基于群落物种多样性和物种间互作强度这两个参数，足以预测复杂微生物群落的动力学变化。该研究提出的框架将理论生态学的2个主要观点整合在一起：生态网络的复杂性导致其失去稳定性，同时，生态系统随时间的震荡有助于维持其物种多样性。这些发现对于理解和研究肠道菌群和土壤菌群等微生态系统的稳定性、多样性和动力学具有重要参考价值。

微生物生态学生物多样性系统稳定性

细菌种间竞争

细菌种间竞争调节线虫肠道菌群组装

ISME Journal发表研究中，用确定的细菌种类组合饲喂线虫，以阐明物种间相互作用在宿主相关微生物群落组装中的作用。结果表明，在三种不同的条件下（具有p38免疫能力的秀丽隐杆线虫SS104、p38免疫抑制的AU37和体外液体培养基)，观察到所有菌株均表现出基于竞争能力的相似定殖排序。这说明线虫的肠道和免疫系统对环境的过滤只改变了细菌群落的一个子集。总体而言，我们的研究结果表明，细菌间的相互作用对接种2种、3种和8种微生物的组成有强烈的影响，而在组装过程中，单菌定殖、细菌分离来源、蠕虫肠道环境过滤和蠕虫免疫系统起次要作用。

细菌种间竞争线虫肠道菌

Nature子刊：一项对菌群如何响应温度变化的预测性研究

Nature Ecology & Evolution发表的文章，开发了一个可以预测生长速率不同的细菌种群间如何受到环境温度变化影响的模型，发现在任何给定的死亡率下，较高的温度通过增加生长较快的物种死亡率而有利于生长较慢的物种。

菌群-环境温度影响 microbial ecology 研究论文 Feng Lin

微生物生态学

Nature子刊：物种互作强度决定了微生物群落的多样性和稳定性

理论和实验研究表明，生态系统的物种间互作、生物多样性和稳定性之间存在联系，比如群落的稳定性经常随着生物多样性的增加而增加，然而这些关联背后的原因尚不清楚。Nature Ecology & Evolution近期发表的一项研究，通过分析不同营养浓度下土壤细菌群落的变化发现，在微生物生态系统中，较高的营养物质浓度会增强细菌之间的负相互作用，从而导致生物多样性和稳定性的下降。

微生物生态学物种间互作 Yan Xie Peilong Li Dong Sun

Nature子刊：环境变化，何种细菌获得生长优势？

外界环境变化时，细菌群落会发生结构变化。《Nature Communications》近期发表研究，结合理论和菌株共培养实验，发现两种细菌共培养条件下，相同的环境变化下菌群结构改变情况并不一致，受群落中细菌生长率和原始丰度的影响。该结果对于研究菌群对环境的适应性、菌群变化机制具有重要参考价值。

菌群稳态菌群互作菌群模型菌株共培养环境压力

研究菌群内相互作用的新策略

复杂菌群内微生物相互作用一直是菌群研究的瓶颈之一。本文回顾了Venturelli团队近期发表于Molecular Systems Biology的研究（http://www.mr-gut.cn/papers/read/1042183527），介绍了这种结合了人工合成菌群和数据建模的菌群研究策略，并与该领域内其他研究结果进行了对比，指出了该策略在菌群互作研究领域的优势和局限性，值得专业人士关注。

数据模型菌群相互作用菌群稳定性 Liming Nie Wenchao Huang