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Tim D Spector
文章数:28篇
心脏代谢疾病
Nature子刊:肠道菌、饮食与心脏代谢疾病的宏组学研究(综述)
心脏代谢性疾病(CMD)包括有糖尿病、胰岛素抵抗、心脏病、中风、非酒精性脂肪肝等。随着社会老龄化的较重,CMD已经成为全球引发人类死亡的主要原因之一。除吸烟、喝酒等已经明确的与CMD关联的诱因外,肠道菌群异常与CMD的关系也越来越受到关注。但是由于心脏代谢表型与个人饮食以及肠道菌群的关系表现多维度、多因素的复杂性,因此如何有效理解其潜在互作并进行整合利用仍是巨大的挑战。近期一篇发表在Nature子刊,Nature Medicine上的综述回顾了非靶向的高通量基因组以及应用于微生物群落的分子方法(宏组学方法),并讨论了其在解决CMD中微生物群落、宿主代谢和饮食之间错综复杂的相互作用问题的潜力。
心脏代谢疾病
饮食
肠道菌群
综述
医学研究
地中海饮食
JAMA子刊:地中海饮食或能提高肿瘤免疫治疗效果
免疫检查点阻断(ICB)治疗提高了晚期黑色素瘤患者的生存期,但一些患者对ICB治疗没有反应和/或发生免疫相关不良事件。肠道菌群可能是饮食和免疫治疗反应的桥梁,或可部分解释ICB疗效的变异性。此前的研究较少关注饮食模式或饮食成分与黑色素瘤ICB治疗反应间的关系。荷兰格罗宁根大学研究人员近日在JAMA Oncology发表文章,前瞻性的收集了英国和荷兰两个队列中接受ICB治疗的晚期黑色素瘤患者的饮食和临床数据,发现坚持地中海饮食模式有助于提高患者对ICB治疗的应答率和治疗效果。
地中海饮食
饮食模式
黑色素瘤
免疫检查点阻断疗法
晚期黑色素瘤
Nature子刊:肠道菌群与免疫检查点抑制剂的临床反应相关
肠道微生物组的组成与免疫检查点抑制剂(ICI)治疗的临床反应有关,但是与ICI临床益处相关的特定微生物组特征还缺乏认知。Nature Medicine近期发表的文章,通过对晚期黑色素瘤患者接受ICI治疗前的粪便样本进行测序分析,同时整合之前发表的数据集,发现肠道微生物组的组成与ICI的临床反应具有相关性,但是呈现队列之间的差异性,没有一个物种在所有队列中是完全一致的。
晚期黑色素瘤
肠道菌群
人群队列数据
居住环境
居住环境中的绿地空间,或影响肠道菌群
接触自然环境(绿地空间)可有益健康,但其机制尚不清楚,肠道菌群可是绿地空间和人体健康间的中介因素。Science of the Total Environment发表的这项研究对这一假说进行了探索。
居住环境
肠道菌群
膳食补充剂
部分膳食补充剂可能小幅降低女性的新冠风险
BMJ Nutrition, Prevention & Health上发表的一项最新研究,基于COVID-19症状研究app(COVID-19 Symptom Study app)中近50万名使用者的数据发现,女性补充益生菌、ω-3脂肪酸、多种维生素或维生素D,可能适度降低新冠病毒感染的风险。
膳食补充剂
研究论文
COVID-19
益生菌
ω-3脂肪酸
食欲调节
Nature子刊:为啥容易饿?餐后血糖降太多!
食欲调控受多种因素影响,有假说认为血糖的变化在其中有关键作用。Nature Metabolism近期发表了一项迄今最大规模的关于餐后血糖变化与食欲和热量摄入之间关系的真实世界研究,表明餐后2-3小时的血糖降低得越厉害(降到基线水平之下)的人,其饥饿感越高,之后的进食量也越大。该研究为餐后血糖变化对食欲调控的影响提供了有力证据。
食欲调节
餐后血糖
膳食-菌群
膳食-菌群的复杂性及互作(综述)
个性化的膳食调节对于疾病管理来说十分重要,然而膳食与菌群间复杂的相互作用关系仍不明确,因此这一方法存在诸多局限性。Genome Medicine发表的一篇综述,总结了现有的关于菌群-饮食互作的相关研究,研究方法的应用以及缺陷,并指出进一步加深对菌群-饮食互作的理解,应从研究技术方法,评价体系及采样手段等方面进行改进。
膳食-菌群
研究方法
综述
基础研究
肠道菌群
Nature子刊:分析1000+人,鉴定菌群、饮食和代谢的关系
肠道菌群受饮食调控,并能影响宿主的代谢健康,三者之间存在着非常复杂的关联。Nature Medicine近期发表的一项新研究,对英国和美国2个队列的1098人进行了分析,深入探究了肠道菌群特征与心血管代谢和习惯饮食之间关系,值得专业人士仔细研读。
肠道菌群
饮食-菌群互作
心血管代谢
ω-3脂肪酸
补充ω-3脂肪酸的潜在益生元作用
Gut Microbes上发表的一项随机干预研究,对比了每日补充ω-3脂肪酸或菊粉对于健康人的影响,发现与菊粉类似,ω-3脂肪酸可显著增加血清中的短链脂肪酸(异丁酸盐、异戊酸盐)水平。另外,ω-3脂肪酸可改变肠道菌群组成,增加与心血管疾病风险标志物相关的特定菌属。
ω-3脂肪酸
研究论文
干预性研究
益生元
肿瘤免疫治疗
改善癌症免疫治疗,菌群调节从何入手?(综述)
肠道菌群与癌症患者对免疫检查点抑制剂(ICI)治疗的应答密切相关。European Journal of Cancer上发表的一篇综述文章,详细讨论了如何通过直接方式(粪菌移植、抗生素、益生菌、合生制剂、特定菌群组合、噬菌体)及间接方式(饮食干预、膳食纤维、发酵食品等)调控癌症患者的肠道菌群,以提高患者对ICI治疗的应答,同时对于开始ICI治疗前的患者及医生给出了一些广泛的建议。
肿瘤免疫治疗
immunotherapy
gut microbiome
microbiota
Nutrition
营养学
BMJ:营养科学的挑战和机遇
2018年由BMJ期刊和瑞士再保险公司(Swiss Re)共同举办的Food for Thought会议汇聚了不同声音,讨论了营养科学研究面临的若干关键挑战和机会,试图找到营养科学前进的道路。BMJ期刊“Food for thought 2020”专题中的这篇文章对这次会议的主要讨论内容进行了介绍。
营养学
肠道菌群代谢物
血清菌群代谢物预测T2D
文章基于血浆中(1018名志愿者)检测到的6种菌群代谢物(该6种代谢物可以解释菌群α多样性中超过18%的差异),建模成菌群代谢物多样性(MMD)评分。并在另外一个群体(1522名志愿者)中应用MMD,结果发现,这6种代谢物可以解释菌群对二型糖尿病(T2D)影响的28%。因此,文章认为,肠道菌群对T2D的影响通过菌群代谢物实现,并且可能受膳食调节。
肠道菌群代谢物
二型糖尿病
microbial metabolites
incident diabetes
microbiome diversity
个性化营养
Nature子刊:多因素机器学习模型预测餐后代谢反应
对食物的代谢反应可影响心血管代谢疾病的风险,但目前仍缺少大规模高分辨率的相关研究。《Nature Medicine》发表的一项最新研究,纳入了英国PREDICT1研究中的1002名健康受试者(包括几百名双胞胎),分析了他们的餐后代谢反应情况(甘油三酯、血糖、胰岛素),及其与膳食成分、日常饮食、用餐背景(之前的饮食、进餐顺序/时间、睡眠、运动等)、人体和临床生化指标、遗传、肠道菌群等因素的关系,并在一个独立的美国队列中进行了验证。该研究发现,遗传因素(基于SNP分析)对于餐后的代谢反应(特别是甘油三酯)似乎并没有起到主导作用,而一些可变因素(如用餐背景)的作用则比预期的要大。研究者使用机器学习开发了一个预测个体餐后反应的模型,在血糖和甘油三酯预测方面有相对较好的表现。这些发现对于进一步开发个体化的饮食营养干预策略有参考意义。
个性化营养
Biomarkers
Diseases
Endocrinology
Health care
代谢组学
人体肠道菌群与宿主代谢之间的相互作用关系
本研究依托于twinsUK队列,对1004对双胞胎的粪便样本进行了宏基因组测序,得到菌群和代谢途径信息。并且,采集并测定了859例血液样本代谢物以及479例粪便样本代谢物信息。基于以上信息,分析了菌群、粪便和血液代谢物、代谢途径三者之间的相互关系,揭示了菌群与宿主之间的相互作用关系,以及可能的相互作用途径。
代谢组学
肠道菌群
红酒
适量喝红酒或能增加肠道菌群多样性
Gastroenterology发表的一项通讯研究,分析了英国TwinsUK队列中900多名双胞胎的喝酒情况与肠道菌群多样性的关系,发现喝红酒与菌群α多样性增加显著相关,可能介导了红酒对体重和脂代谢的潜在益处。研究者认为,红酒富含的膳食多酚可能在其中起主要作用。
红酒
Gut microbiota
Red wine
epidemiology
肠道菌群多样性
肥胖与健康
Cell子刊:真胖假胖?代谢组说了算
体质指数(BMI)是目前最常用的肥胖判定指标,但有些人BMI值不高却患有肥胖相关的代谢疾病,有些人人高马大BMI值不低却什么病都没有,说明BMI并不是一个准确的肥胖和健康测量指标。Cell Metabolism本周上线的一项队列研究,分析了约2400人的代谢组和基因组数据,发现代谢组与肥胖相关临床症状的关联极为密切,是比BMI和遗传风险更合适的健康预测指标。这些发现不仅为肥胖、代谢相关疾病的精准医疗提供了宝贵的数据参考,也有助于相关临床试验更有针对性地挑选合适的受试者。
肥胖与健康
肥胖
BMI
血液代谢组
遗传
菌群-疾病关联性
Nature子刊:肠道菌群与常见疾病和药物的大规模相关性研究
Nature Communications本周上线一项可能是迄今最大规模的肠道菌群与常见疾病和药物的关联性研究,不仅鉴定出许多新关联,还表明某些菌群标志物可用于反映整体健康情况,而非特定疾病。这些发现为未来肠道菌群与人体健康的研究提供了大量宝贵的数据参考,值得特别关注。
菌群-疾病关联性
菌群-药物关联性
肠道菌群
英国TwinsUK队列
Mustafa Raoof
肠道菌群
肠道菌群在营养和健康中的作用(综述)
British Medical Journal近期发表综述,在营养学和人体健康范畴内,总结了肠道菌群研究所取得的进展,并着重讨论了用膳食干预和益生菌/元调节菌群进而改善健康的策略。这篇文章可以作为入门综述,甚至是科普读物,推荐给感兴趣的读者。
肠道菌群
营养
膳食纤维
膳食干预
Sabita Roy
宿主-菌群互作
王军等:宿主基因组与菌群关系研究要有大动作!
Microbiome近期发表一项宣告,宣布大型研究计划MiBioGen的启动。该计划由中科院微生物所王军以及比利时和荷兰的多位科学家发起,旨在从全基因组的层面研究人体基因对肠道菌群的影响。目前MiBioGen已收集了全球18个不同人群,约19000人的肠道菌群和基因组数据,建立了完整、开源、标准化的分析流程,并邀请和号召更多研究者加入。
宿主-菌群互作
肠道菌群
全基因组关联研究(GWAS)
荟萃分析
gut microbiome
粪便代谢组
Nature子刊:利用粪便代谢组分析肠道菌群的组成与功能
Nature Genetics上发表的一项最新研究,发现粪便代谢组可很好地反映肠道菌群的组成,可用于分析菌群、宿主遗传、宿主表型之间的关联。
粪便代谢组
宿主表型
遗传性状
Geert R D'Haens
Christian Jobin
心血管
肠道菌群多样性越低,动脉硬化越厉害
心血管领域的高分刊物European Heart Journal[IF:19.651]近期发表研究,首次在人体中证实,肠道菌群多样性与动脉硬化程度相关,并鉴定出与动脉硬化负相关的7个菌群成员。此外,该研究还发现菌群对动脉硬化程度的影响,可能与包括氧化三甲胺在内的菌群代谢物、代谢综合征和炎症因素关系不大。以肠道菌群为靶点或是改善动脉老化的新策略。
心血管
动脉僵硬度
动脉硬化
动脉老化
肠道菌群多样性
数据处理
对肠道菌群研究中的饮食变量进行量化
如何将饮食差异进行量化,并作为可控变量运用于肠道菌群研究具有重要意义。本文比较了三套饮食指标与菌群差异的相关性,并发现健康饮食指标(HEI)与菌群的多样性变化的关联性最好,适合用于肠道菌群分析。该研究成果对于肠道菌群分析、饮食变量控制都极富参考价值,值得专业人士关注。
数据处理
饮食指数
菌群多样性分析
Microbiome
microbiota
Fecal microbiome
GB:通过3666名双胞胎确定的粪便菌群与肥胖的相关性
这是一群大佬合作在Genome Biology 发表的重要文章,对3666名双胞胎的粪便菌群及肥胖情况进行分析,再次确认粪便菌群的低多样性与肥胖相关,特别是内脏脂肪与细菌的相关性。这篇文章MC之前没有重点推荐,其实非常重要,强烈推荐阅读!
Fecal microbiome
Genetic association
Heritability
Obesity
Twins
食疗
JRSM:应对慢性疾病,怎样的食疗靠谱?(综述)
最少加工处理的基于植物的高纤维饮食可恢复受到以肉食为基础的饮食影响的肠道菌群,这或将成为慢性疾病饮食干预的基础,这篇综述值得好好看看。
食疗
饮食干预
饮食
肠道
菌群
双胞胎
CHM:1126对英国双胞胎,告诉你菌群的遗传特性
又一个值得珍藏的大样本研究。
双胞胎
肠道菌群
遗传因素
Marinos Pericleous
Martyn Caplin
老年人
肠道菌群中的早衰特征
① 纳入728名年龄42-86岁之间的女性双胞胎的粪便样本,进行16S rRNA测序分析,研究老年人身体虚弱与肠道菌群组成之间的关系;② 结果表明,虚弱指数(frailty index,FI)与肠道菌群的α-多样性呈显著负相关,其中637个OTUs与FI相关;③ 细长真杆菌及迟缓埃格特菌丰度增加与FI呈正相关,而柔嫩梭菌与其呈负相关;④ 60个OTUs相关在老年人队列中得到重现,OTU共现模组,虚弱性和多样性之间对比显著;⑤ FI与肠道菌群之间的因果关系尚待探究。
老年人
肠道菌群
虚弱
Silvia Guglietta
Maria Rescigno
胃酸
Gut:质子泵抑制剂,可能增加肠道等感染风险!
① 质子泵抑制剂(PPI)是一种常用的抑制胃酸分泌药,近期研究发现该药可能会增加肠道感染或其他感染的风险;② 通过分析1827对健康双胞胎的肠道菌群,结果表明PPI使用者的肠道菌群丰度和多样性都较低,但口腔和上消化道共生菌的丰度显著增加,其中肠道乳杆菌(特别是链球菌)明显增加;③ 这些关联在一项独立的干预研究和一项70对单卵双胞胎的配对研究中得到验证;④ 菌群的变化可能是由于去除了上消化道细菌和下消化道之间的低pH屏障引起的;
胃酸
肠道微生物
乳酸菌
质子泵抑制剂
Kei E Fujimura
双胞胎
Cell:人类免疫系统的遗传架构(资源)
① 分析669对女性双胞胎的免疫细胞频率和免疫细胞表面蛋白表达水平,揭示出近80000种细胞类型,78000种免疫性状;② 遗传力高达96%的前150个性状中,GWAS数据揭示出11个基因位点上具有297个相关SNP,可用于解释19个性状中高达36%的变异;③ 与所有主要免疫细胞亚群的典型特征均具有多种关联性,并揭示出调节型T细胞的遗传控制;④ 揭示出与自身免疫易感性相关的已知基因位点相关的免疫性状,提供了将免疫特征和疾病病因联系起来的机制假说。
双胞胎
免疫系统
遗传性状
自身免疫
基因座