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Qi Zheng
文章数:4篇
生物信息学工具
用于OTU提取和系统发育分析的超快生物信息学工具
从菌群16S rRNA测序数据中提取OTU和对这些OTU进行系统发育分析是宏基因组学研究中的常见任务,而现有的方法如QIIME事实上在准确性和效能等方面都有一些缺陷。Genome Biology发表的这篇文章介绍了一种新的、更快更准确的生物信息学工具,弥补了现有工具的不足。值得专业人士参考。
生物信息学工具
宏基因组分析方法
宏基因组算法
16S扩增子高通量测序
Amanda J Cross
皮肤菌群
Microbiome:共生菌群调节宿主皮肤的基因表达
这是上周Microbiome[IF:8.496]发表的关于菌群调控皮肤基因表达的研究,发现皮肤上大量与免疫反应和表皮分化有关的基因都受到菌群的调节,这意味着皮肤的健康状态在一定程度上受菌群的影响,推荐阅读~
皮肤菌群
基因表达调控
Cutaneous transcriptome
Germ-free mice
Host-microbe interactions
慢性伤口
JID:糖尿病足溃疡愈合不良,与伤口菌群有关
伤口好愈合还是不好愈合,与伤口上的菌群有关,这个道理貌似很浅显,但具体哪些细菌会影响伤口愈合呢?还是得仔细做研究,建议看看这篇文章哦。
慢性伤口
微生物群
时间稳定性
愈合不良
糖尿病足溃疡
皮肤菌群
JID:实验设计会显著影响皮肤菌群的研究
实验设计会显著影响皮肤菌群的研究,其实也会影响很多其他菌群研究。注意你的方法学,会少走很多弯路。 (小秘书注意,这篇文章与493一起发)
皮肤菌群
实验设计
Robert A Koeth
Stanley L Hazen