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Michael Snyder
文章数:7篇
细胞图谱
Nature:肠道组织结构的单细胞参考图谱
肠道是具有多种重要功能的“庞大”器官,这种功能多面性与肠道内多种多样的细胞和结构密不可分。Nature最新发表的来自HuBMAP计划的一项研究,对健康人的8个不同肠道区域组织样本进行单细胞水平的测序和成像分析,绘制了人类肠道的详细细胞图谱,描述了肠道在细胞组成、基因调控和组织结构方面的复杂性,为了解人类生物学和疾病提供了重要参考。
细胞图谱
糖尿病
人体中IL-17/IL-22与梭菌、胰岛素敏感性之间的联系
小鼠模型显示,肠道菌群与产生IL-17/IL-22的细胞互作,对代谢疾病进展具有重要作用。《Diabetes》发表文章,对103位前糖尿病患者进行分析,发现低水平的IL-17/IL-22个体呈现出更严重的代谢疾病表型(包括胰岛素敏感性)和肠道菌群多样性降低(包括梭菌的降低),建立起肠道菌群、IL-17/IL-22与代谢疾病早期发病在人体中的联系。该发现提供了或能有效缓解人类代谢疾病的微生物相关的治疗靶点。
糖尿病
IL-17/IL-22
梭菌
胰岛素敏感性
多组学研究
Nature:多组学纵向追踪,揭示糖尿病前期的宿主和菌群特征
大部分糖尿病前期者都会发展为糖尿病,但人们对其相关生理过程和背后的生物学机制,仍所知甚少。《Nature》发表的一项最新研究,对106个健康和血糖调控受损个体进行长达4年随访,对受试者的血液转录组、代谢组、细胞因子和蛋白质组以及肠道和鼻腔微生物组进行多组学的深度纵向分析,在群体和个体层面揭示了稳态和应激状态(如呼吸道病毒感染和接种流感疫苗)下,血糖调控受损和健康者的生理和菌群差异,为糖尿病的早期诊断,以及阐释糖尿病前期的生物学机制,带来启示。该研究中的大部分数据都是开放获取的,值得相关领域研究者特别关注。
多组学研究
糖尿病前期
pre-diabetes
Prognostic markers
Congjiao Sun
三代测序
三代测序该用在何处?(综述)
长读长测序有助于解读复杂DNA序列、全长RNA分子和基因组重头组装,近年来越来越流行于科研与临床检测。《Trends in Microbiology》近期发表综述,总结了长读长测序的优势与缺陷,强调了其在研究病毒基因组中的重要价值,值得参考。
三代测序
综述
病毒基因组
RNA测序
三代测序
血糖
健康人也应注意餐后血糖波动
PLoS Biology近期发表来自斯坦佛大学的研究,用可穿戴设备对受试者进行持续性血糖监测,发现血糖的波动在健康个体中也会进入“危险范围”,与个体和饮食都有关,并建立的模型和工具或需能帮助早期诊断糖尿病高危个体。此外该研究还发现,西方早餐中常见的脆玉米片(cornflakes)可引起80%受试者血糖攀升至前驱糖尿病水平,或许在易感个体中应限制这类食物。
血糖
持续性血糖监测
糖型
糖尿病
饮食
低碳水饮食
Cell子刊:低碳水饮食迅速改变菌群改善脂肪肝
过去几十年里,非酒精性脂肪肝(NAFLD)发病率迅速攀升,而低碳水饮食可快速改善NAFLD、帮助减肥。本月Cell Metabolism[IF:18.164]上线了瑞典哥德堡大学大牛Fredrik Bäckhed教授与Borén团队合作的人体研究,使用多组学方法,从菌群和代谢等角度,系统分析了低碳水饮食如何在短短14天内大幅改善NAFLD。他们发现,这种饮食干预可改变肠道菌群以增加叶酸生成,帮助患者改善肝脏脂肪代谢。菌群健康领域不容错过的好研究~ (啰嗦一句:任何以治疗为目的的饮食干预都请遵医嘱)
低碳水饮食
非酒精性脂肪肝病
脂代谢
叶酸
多组学分析
宏基因组
Nature子刊:利用合成长读长序列分析宏基因组数据
【经典文献分享】2015年发表在Nature Biotechnology[IF:41.667]上的利用合成长读长序列来分析宏基因组数据的重要文献,值得特别关注。
宏基因组
短读长序列
长读长序列