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Julia A Vorholt
文章数:6篇
植物菌群
Science:代谢互作模型再现叶片微生物群生态学
微生物组的组成与宿主健康和生态系统功能密切相关。然而,在环境背景下决定物种丰度的过程仍然不太清楚。近日,瑞士苏黎世联邦理工学院研究人员在Science发表最新研究,通过实验和计算引导下解析了拟南芥叶际微生物群落中细菌成员间代谢互作,发现碳源可用性和代谢互作在植物宿主的群落组装中起着重要作用。除在原位再现物种间互作外,开发的建模框架可从机制上了解这些细菌间资源利用和交换的具体模式,值得关注。
植物菌群
代谢互作
基础研究
微生物群生态学
研究论文
沙门氏菌定植
Cell子刊:揭示小鼠肠道内沙门氏菌厌氧呼吸的机制
小鼠伤寒沙门氏菌具有代谢适应性,可利用微生物衍生的H2作为电子供体,延胡索酸作为电子受体,通过厌氧呼吸获取能量,促进沙门氏菌在肠道中初始生长。但延胡索酸在肠道中浓度较低,所以沙门氏菌中延胡索酸的来源尚不清楚。Cell Host & Microbe发表的文章,利用无偏差的突变试验、基因缺失上位性实验和代谢物分析,确定了DcuABC依赖的苹果酸和天冬氨酸转运及其转化为延胡索酸是促进H2/延胡索酸厌氧呼吸的主要机制。此外,这种策略同样适用于共生菌大肠杆菌,或具有更广的适用范围。
沙门氏菌定植
C4-二羧酸盐反向转运蛋白DcuABC
H2/延胡索酸厌氧呼吸
苹果酸
天冬氨酸
优先效应
Nature子刊:拟南芥叶围菌群组装的规律和关键菌株
我们知道,“优先效应”在人体肠道菌群中发挥着重要的作用(http://www.mr-gut.cn/papers/read/1053244417)。Nature Ecology & Evolution 上面发表的这篇论文,证明了在植物表面菌群的组装过程中,“优先效应”同样发挥重要的作用。
优先效应
群落组装
合成菌群
植物菌群
植物共生菌
天然产物
Nature子刊:在拟南芥叶际菌群中寻找新型抗生素
Nature Microbiology上发表的一项最新研究,对拟南芥叶际菌群中分离出的菌株之间的互作进行了分析,鉴定出了抑菌效应最强的菌株,并从中分离出了一种新型抗生素。
天然产物
抗生素
拟南芥
叶际菌群
Michael G Constantinides
细菌基因组
Nature子刊:微生物如何适应植物的?
是什么使病原和共生菌都能与真核宿主保持密切联系呢? Nature Genetics于发表了美国北卡教堂山的Jeffery L. Dangl团队领衔,美国能源部JGI研究所的Tanja Woyke和Susannah G. Tringe共同通讯的文章"Genomic features of bacterial adaptation to plants",揭示了微生物是如何在与植物的共生、竞争、致病中与植物基因组共进化的历史。同期还配发了Ryan A. Melnyk和Cara H. Haney两位大佬的news & views对文章的导读和重要性评价。重镑成果,值得细读。
细菌基因组
植物
宏基因组
基因家族
同源序列
植物菌群
Nature:拟南芥的叶和根上的菌群
拟南芥,最重要的模式植物,自然成为研究植物菌群的重要模型,这是Nature上去年的一篇文章,关注植物叶和根上的菌群,很值得参考,特别是关注农业、土壤相关菌群的群友,没看过这篇文章的可以好好看看。
植物菌群
拟南芥