外显子组

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文章数：4篇

微卫星不稳定(MSI)

微卫星不稳定的肿瘤有啥分子特征

① 微卫星不稳定（MSI）指的是DNA错配修复缺陷导致的基因组内短重复序列的超突变性；② 分析23个肿瘤类型患者的∼8000个外显子组和∼1000个全基因组；③ 不同肿瘤类型及个体之间，MSI的发生频率不同，鉴定出易反复发生MSI的DNA修复和癌基因通路，揭示出常表现出MSI的非编码基因座，建立针对MSI基因型的准确的外显子组基础上的预测模型；④ 促进了解MSI的基因组驱动因子和结果，全面分类肿瘤类型特异性MSI基因座将使模块基础上的MSI检测成为可能。

微卫星不稳定(MSI) DNA错配修复超突变性外显子组全基因组

病人来源的移植瘤模型（PDX）用于乳腺癌：何去何从？

① 乳腺癌患者的经历与临床前模型之间缺乏联系，二代测序和患者来源异种移植瘤（PDX）有望克服；② 比较原发灶、脑转移灶和PDX，PDX的突变情况更接近于脑转移灶，PDX捕获到大多数转移亚克隆；③ 不同组织学亚型之间移植成功率不同，导管内注射技术有望解决，特异性突变与药物疗效表型之间关系复杂；④ 今后需提高PDX研究的严谨性，包括根据原发灶基因组审查每一个PDX，匹配患者和对应PDX的药物敏感性，蛋白基因组学，将每个PDX模型纳入数据库。

乳腺癌患者来源异种移植瘤二代测序(NGS) 基因突变蛋白基因组学

HER2富集型乳腺癌：新辅助治疗获益者

① 美国肿瘤外科协作组Z1041临床研究，评估化疗和曲妥珠单抗新辅助治疗的病理完全缓解率（pCR）；② 48例从治疗前肿瘤活检和血液中抽提基因组DNA，进行全基因组（WGS）和外显子组测序，42例肿瘤活检标本进行RNA-seq；③ 富含HER2的亚型更易于获得pCR，最常见ERBB2和 GRB7的融合，ERBB2扩增水平低者很少见pCR，获得pCR的肿瘤通常表达免疫特征；④ HER2阳性乳腺癌患者可在诊断时，预测哪些患者可从化疗和曲妥珠单抗治疗中获益。

乳腺癌新辅助治疗曲妥珠单抗全基因组(WGS) 外显子组

DNA修复机制恢复：PARP抑制剂耐药机制

① 3例PARP抑制剂olaparib治疗取得显著疗效的、无胚系BRCA1/2突变的高度恶性卵巢癌（HGSOC）患者，诊断时和铂类治疗后复发时，进行外显子组、低通量基因组、RNA测序分析；② 诊断时3例均存在BRCA1/2体细胞突变，2例进展时出现拷贝数增加和/或功能性等位基因的上调而恢复BRCA；③ Olaparib对不携带BRCA1/2胚系突变的OC有效；④ 肿瘤细胞中BRCA1/2复等位基因缺失可能是PARP抑制剂长期有效的标志物，DNA同源重组修复功能恢复可能是疾病耐药的机制。

BRCA1/2突变多聚（ADP-核糖）聚合酶（PARP）高度恶性卵巢癌(HGSOC) 外显子组低通量基因组