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Andre Franke
文章数:20篇
花青素
花青素或通过调节肠道菌群缓解腹部脂肪性肥胖
黄酮类化合物的摄入可以调节体内的肠道菌群。本文重点关注花青素的摄入与人体内脏脂肪以及皮下脂肪的相关性,以及在此过程中肠道菌群的作用。研究结果显示,较高的花青素摄入与人体VAT含量降低有关,且这种相关性的18.5%可由肠道菌群变化解释。肠道菌群的变化主要体现在,高摄入花青素的条件下,人体肠道菌群多样性以及梭菌目丰度增加。
花青素
flavonoids
anthocyanins
Gut microbiota
Microbial diversity
瘦素
Nature子刊:瘦素诱导促炎症免疫应答以促进肠道炎症
瘦素可调控小鼠的肠道炎症,但其在克罗恩病中的免疫调控作用尚未明确。Nature Communications上发表的一项最新研究,在一例罕见的获得性全身性脂肪营养不良合并克罗恩病(AGLCD)患者中,观察到患者的瘦素缺陷、肠道炎症及免疫细胞组成、功能及代谢的异常,经注射重组瘦素治疗后,免疫细胞产生的TNF-α增加以恶化克罗恩病,并可被抗TNF-α治疗逆转。
瘦素
TNF-α
瘦素
获得性全身性脂肪营养不良
克罗恩病
扩增子测序
“扩增子”VS“宏基因组”——到底谁可以描绘宿主和微生物共生体进化蓝图
高通量测序使微生物组的研究走上了快车道,与宿主相关的微生物往往更受研究者青睐。不仅仅作为人类的第二基因组,微生物其实与大量的动植物都有互作关系。这一宿主微生物共生体对于生态系统的稳定、发展和进化尤其重要。在微生物协同宿主进化研究中,基于扩增子和宏基因组都可以对微生物群落结构进行表征。为了比较它们表征微生物群落和功能的异同,同时为广大研究者提供方法上的优化和参考,基于两种不同方法,作者使用不同环境的宿主相关微生物进行了深入的讨论。并且在宿主和微生物互作方面提出了自己独特的见解。相信在今后可以为我们研究宿主微生物进化之路提供有力的技术参考和重要的认识。
扩增子测序
宏基因组
分析方法
系统综述
Animal microbiome
代谢疾病
Cell子刊:区分与肥胖和糖尿病相关的肠道菌群特征
Cell Host and Microbe发表的一项最新研究,在德国队列中通过对比健康瘦子与健康胖子、健康胖子与糖尿病胖子的肠道菌群,找出了与肥胖和糖尿病单独相关的菌群变化特征,发现肥胖与菌群变化显著相关,而2型糖尿病与菌群变化的关联则较弱,此外,用药和膳食补充剂也可在一定程度上解释菌群的变化。
代谢疾病
肥胖
2型糖尿病
肠道菌群
膳食补充剂
原发性硬化性胆管炎
原发性硬化性胆管炎患者的胆汁菌群变化
来自Gut上发表的一项最新研究,鉴定出了原发性硬化性胆管炎患者的胆汁菌群变化,并发现胆汁菌群与特定胆汁酸的水平显著相关。
原发性硬化性胆管炎
anti-bacterial mucosal immunity
bile acid metabolism
biliary endoscopy
ENTERIC BACTERIAL MICROFLORA
胰腺
胰腺外分泌功能与肠道菌群的组成及多样性相关
Gastroenterology上发表的一项最新研究,对近2000名健康志愿者的粪便菌群及胰腺外分泌功能进行了分析,发现在胰腺外分泌功能减退的受试者中,菌群的组成及多样性发生了显著改变,更倾向于具有2型肠型。
胰腺
bacteria
biomarker
Microbiome
pancreas
功能性腹痛和不适
功能性腹痛和不适或与菌群组成无关
来自Gut的一篇通讯文章,分析了约900人的一般人群的样本,表明在校正相关因素后,未发现功能性腹痛和不适与肠道菌群组成之间存在显著关联。
功能性腹痛和不适
肠道菌群
ABDOMINAL PAIN
COLONIC MICROFLORA
functional bowel disorder
宿主-菌群互作
王军等:宿主基因组与菌群关系研究要有大动作!
Microbiome近期发表一项宣告,宣布大型研究计划MiBioGen的启动。该计划由中科院微生物所王军以及比利时和荷兰的多位科学家发起,旨在从全基因组的层面研究人体基因对肠道菌群的影响。目前MiBioGen已收集了全球18个不同人群,约19000人的肠道菌群和基因组数据,建立了完整、开源、标准化的分析流程,并邀请和号召更多研究者加入。
宿主-菌群互作
肠道菌群
全基因组关联研究(GWAS)
荟萃分析
gut microbiome
妊娠期糖尿病
妊娠糖尿病患者在孕晚期和产后的肠道菌群特征
Microbiome近期上线的一项研究,用16S法分析了50例妊娠糖尿病(GDM)和161例对照孕妇的肠道菌群组成,鉴定出GDM相关的菌群特征,发现GDM患者在孕期和产后的肠道菌群均表现出异常,与2型糖尿病患者相似。
妊娠期糖尿病
怀孕
体质指数
血糖特征
妊娠期高血糖症
发育
肠上皮发育过程中,菌群如何影响转录组和DNA甲基化
肠道菌群在肠道发育中起重要作用,Genome Medicine[IF:7.071]近期发表研究,对有菌和无菌小鼠进行对比,表明肠道菌群在IEC发育过程中,对转录组的影响较大,而对DNA甲基化的影响则相对有限。
发育
DNA甲基化
转录组
肠道上皮细胞
epigenetics
特应性皮炎
JACI:特应性皮炎的皮肤菌群特征
Journal of Allergy and Clinical Immunology[IF:13.081]近期发表的研究,分析了皮肤脂质组分、屏障完整性和湿疹炎症对皮肤菌群的影响,表明特应性皮炎患者的多个身体部位的皮肤都显示出菌群结构改变,这种变化在病变处最为明显。
特应性皮炎
皮肤菌群
皮肤屏障
脂质
atopic dermatitis
蔗糖酶
Gut:与IBS风险增加相关的蔗糖酶-异麦芽糖酶基因突变
这是Gut[IF:16.658]发表的关于肠易激综合征(IBS)中的特定基因突变的研究,发现蔗糖酶-异麦芽糖酶基因突变或与IBS的风险增加有关。很值得专业人士特别关注。
蔗糖酶
异麦芽糖酶
肠易激综合征
Diarrhoea
Genetics
蔗糖酶
Gut:饮食淀粉或肠道菌群或都是IBS高风险人群病发的促因
这是 Gut[IF:16.658]在近期online的新研究(http://www.xunludkp.com/papers/read/1054691236)的基础上,再发表的在2个德国人群中所做的横断面研究结果,表明虽然存在肠易激综合征的风险基因,但是否发病,或许与食用淀粉和粪便菌群组成有关。Gut的Letter文,短小精湛,但也是很有料的,值得看看。
蔗糖酶
异麦芽糖酶
肠易激综合征
膳食淀粉
Jin Qu
烟酸
DC:烟酸缓释胶囊改善肠道菌群和胰岛素敏感性
这是Diabetes Care[IF:11.857]关于利用烟酸缓释胶囊的系统性研究,分析了胶囊在不同pH下的稳定性、对菌群的有益影响以及改善胰岛素敏感性的效果。很值得学习的研究,特别推荐。
烟酸
烟酰胺
缓释胶囊
2型糖尿病
二型糖尿病
烟酸缓释胶囊或许可成为二型糖尿病的治疗手段
① 该烟酸缓释胶囊针对回结肠区域,目的是增加此区域肠道菌群的烟酸以及烟酰胺的获取,从而避免由于系统性吸收而带来副作用;② 体外实验表明,该胶囊稳定存在于pH1.4,4.5和6.8,在pH达到7.4的时候会释放,刺激回结肠区域;③ 人体试验表明,这种缓释烟酸,而不是烟酰胺,可以显著增加拟杆菌群的丰度;④ 除了没有副作用,烟酸缓释胶囊带来的菌群的益向变化,还与改善全身胰岛素敏感性的生物标志物和代谢炎症有关。
二型糖尿病
烟酸
烟酰胺
肠道菌群
缓释胶囊
faser算法
NAR:性能更优的菌群数据分析新算法
这是Nucleic Acids Research[IF:10.162]发表的分析菌群数据的新算法,值得专业人士特别关注。
faser算法
饮食减肥干预
Obesity Facts:低热量饮食减肥改变菌群,但不持续
① 肥胖患者接受3个月的低卡路里饮食以减肥,随后3个月保持体重;② 接受3个月的低卡路里饮食后,肥胖患者的厚壁菌门/拟杆菌门的比值显著改变;③ 不动杆菌属是观察效应中的指示物种;④ 代谢分析发现了核黄素通路的显著变化;⑤ 菌群组成及代谢的变化在保持体重的3个月中消失。
饮食减肥干预
肠道菌群多样性
新陈代谢
Manuel T Velasquez
Dominic S Raj
维生素D受体
Nature Genetics:维生素D受体显著影响肠道菌群
今天早上online的Nature Genetics上关于维生素D受体等影响肠道菌群的重量级文章,来自比利时鲁汶大学的中国学者王军(Hi Microbes群友),这是今年迄今为止群友发表的IF最高的菌群论文,特别特别祝贺一下。强烈推荐!
GWAS
维生素D受体
肠道菌群
Sayeh Gorjifard
Romina S Goldszmid
原发性硬化性胆管炎
Gut:用肠道菌群来帮助诊断胆管炎?
关于肠-肝轴、原发性硬化性胆管炎与肠道菌群的Gut文章,值得一看。
原发性硬化性胆管炎
肠肝轴
诊断标记物
肠道菌群
溃疡性结肠炎
肠道菌群
排便次数与肠道菌群组成相关
① 纳入69名瑞典人的每日排便次数及布里斯托粪便量表(BSS)评分记录,研究排便频率与肠道菌群之间的关系;② 参与者的平均每日大便次数为1.38和BSS评分为3.91,且二者存在显著相关;③ 粪便稠度、排便次数与肠道菌群观察种类指数、Chao1指数、Faith系统发育多样性及香农指数成负相关,且与排便次数相关性更强;④ 拟杆菌/厚壁菌和拟杆菌/未分类瘤胃球菌与排便次数显著相关,与排便稠度无显著相关,与排便次数最强负相关的菌是未分类瘤胃球菌。
肠道菌群
排便频率
Hao Chung
Stephen Baker