参考基因组

搜索
登录

参考基因组

文章数：5篇

肖亮+邹远强等：人类口腔培养细菌参考基因组目录

口腔内有高度多样化的微生物群落。然而，分离物种和高质量基因组的数量有限。近日，华大基因的肖亮、邹远强及团队在NPJ Biofilms and Microbiomes发表最新研究。通过需氧和厌氧模式从志愿者的牙菌斑、舌头和唾液中分离口腔菌群，建立了口腔培养细菌基因组参考目录，含1089个高质量基因组，并识别到多种未分类注释物种，值得关注。

口腔菌群培养组学研究论文基础研究参考基因组

参考基因组

肖亮+邹远强等Nature子刊：新的可培养人类肠道细菌参考基因组景观图

独立于培养物的宏基因组研究彻底改变了人们对肠道菌群的理解。然而，缺乏来自培养物种的完整基因组仍然是阻碍深入研究肠道菌群的高墙。近日，深圳华大基因邹远强、肖亮及Karsten Kristiansen在Nature Communications发表最新研究，提出了一个扩展版的培养基因组参考CGR2，包含3324个高质量的分离株基因组草图，这些分离株是从大规模培养的健康中国个体的粪便样本中分离的。总之，该研究为更全面探索人类肠道菌群及相关代谢产物提供了宝贵的资源，值得关注。

参考基因组人类肠道研究论文基础研究培养组学

Milestones in human microbiota research

Nature人体菌群研究里程碑：测序识别人类菌群

测序技术的发展有助于人类探索和自身相关的微生态结构和功能。本文回顾了检测人体相关菌群的测序方法，介绍了从一代Sanger测序到三代长度长测序在研究菌群特征中的优缺点，以及近期在人类菌群参考基因组构建、新基因组组装上获得的进展。

Milestones in human microbiota research Sanger测序扩增子测序鸟枪法测序参考基因组

参考基因组

GB：不依赖于参考基因组的宏基因组分析算法——MetaGen

一篇宏基因组学方法学相关文献，推荐专业人士阅读。

参考基因组宏基因组分析 Binning metagenomics Mixture model

参考基因组

Nature子刊：迄今为止最大规模细菌及古细菌参考基因组数据

Nature Biotechnology[IF：41.667]在本月发布的迄今为止最大规模细菌及古细菌参考基因组数据，这是菌群数据库的一个重大进展，必须值得关注。

参考基因组