Akintunde Emiola

搜索
登录

Akintunde Emiola

文章数：2篇

细菌生长速率

Science子刊：基于宏基因组推断菌株原位的生长速率

细菌生长速率的计算是宏基因组研究中的热点问题，之前报导过2018年《Nature Communication》发表的GRiD方法（https://www.mr-gut.cn/papers/read/1096045434）和《Nature Methods》发表的DEMIC方法（https://www.mr-gut.cn/papers/read/1042256665），最近Science子刊提出的SMEG方法 https://github.com/ohlab/SMEG 可以更好的计算菌株的原位生长速度，软件提供Github源代码和Bioconda的安装方式，方便用户使用。

细菌生长速率宏基因组分析工具生物信息学分析流程 Yufeng Jane Tseng

宏基因组分析方法

基于宏基因组数据对菌群中低丰度细菌的生长速率进行原位测量

与现有的细菌生长速率测定软件相比，GRiD方法既不需要完整的基因组信息，也不需要微生物组成信息。由于其能够在极低测序覆盖度的条件下测量微生物生长速率，所以特别适合分析低丰度物种。点击查看另一个同类工具(http://www.mr-gut.cn/papers/read/1042256665)。

宏基因组分析方法生长速率生物信息学工具皮肤菌群牛皮癣