病原体检测

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病原体检测

文章数：5篇

人类宿主过滤

南方科技大学团队开发快速检测病原细菌及耐药基因的宏基因组流程

本文报道了一个对临床研究样本中的病原细菌及其携带耐药基因进行快速检测的宏基因组学工作流程，该流程整合了基于GPU运算的Nanopore适应性采样“人类宿主DNA过滤”测序模式和自主研发的实时物种鉴定/抗性基因预测的分析工具RUARGpore（https://github.com/sustc-xylab/RUARGpore.git），实现了上机4.5小时内病原及所携带耐药基因的精准检测。同时，该方法相比现有宏基因组学检测方法有效的降低了成本，有潜力应用于大规模临床推广。

人类宿主过滤宏基因组学流程病原体检测抗生素抗性基因 (ARGs) 纳米孔适应性采样

病原体检测

Nature子刊：mNGS实现对体液样本的快速病原体检测

Nature Medicine近期发表研究，介绍了一种两大测序平台（illumina和nanopore）通用的基于体液样本的快速病原体检测方法，或有临床应用价值。

病原体检测宏基因组学二代测序医学研究

JAMA：二代测序技术在感染性病原体检测中的优势及展望

随着测序技术和数据分析方法的发展，运用于科研领域的二代测序技术有望广泛应用于临床病原体检测。本文简要介绍了二代测序进行病原体检测的流程，指出了该技术的优势、局限性以及未来的发展方向，值得参考。

二代测序病原体检测 Genetics and Genomics infectious diseases Genomics and Precision Health

病原体检测

Nature子刊：快速鉴定体内病原体的生物芯片

Nature Biotechnology近期发表一项由美国InSilixa公司研发的重要技术成果，该公司设计并开发了一种生物芯片，可对临床样本中的病原体进行快速识别和量化，还能鉴定病原体中是否有已知的耐药性基因突变，有助于临床上及时找出病原体和准确用药，减少抗生素滥用，很有应用潜力。开个脑洞，或许类似的技术可在未来用于肠道菌群的快速分析，也未可知~

病原体检测生物芯片耐药性 Assay systems Biophysical methods

病原体检测

Genome Biology：新的交互式宏基因组分析工具

生物信息分析的新工具，转需！

病原体检测宏基因组分析交互式分析 Kyungsun Han Hojun Kim