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Alexander Loy
文章数:8篇
细菌代谢途径
肠道细菌“接力”代谢SQ糖产生硫化氢
硫化氢是一种重要的肠内代谢产物。ISME Journal近期发表研究,揭示了两种肠道细菌协同代谢存在于绿色蔬菜中的SQ糖进而产生硫化氢的代谢途径。
细菌代谢途径
硫化氢
饮食-菌群互作
微生物组
微生物组定义的重新审视:旧概念和新挑战
本文基于2019年3月6日在奥地利举行的研讨会框架中的讨论。其根据1988年Whipps等人提供的简短、清晰和全面的描述,提出了微生物组的定义,并根据最新的技术发展和研究成果,对其进行了一系列新颖的建议。明确区分了微生物组(microbiome)和微生物群(microbiota)的术语,并提供了一个全面的讨论,考虑微生物群的组成,微生物群的异质性和时间和空间动态,微生物网络的稳定性和弹性,核心微生物群的定义,以及功能相关的关键物种。
微生物组
微生物群
微生物网络
核心微生物群
关键物种
毛囊炎
Science子刊:微生物入侵毛囊,或加重EGFR靶向治疗引起的皮肤损伤
表皮生长因子受体(EGFR)靶向抗癌治疗会引起皮肤毒性反应,如干燥、瘙痒、细菌感染等,但背后的机制仍不清楚。Science Translational Medicine最近发表文章,探讨了EGFR信号通路缺失导致复杂皮肤炎症的原因、初始触发点和潜在的分子机制。研究表明,缺乏EGFR信号,会引发TH2为主的炎症反应,使细菌通过滤泡口入侵宿主,导致类似于特异性皮炎的免疫反应。利用成纤维表皮生长因(FGF7)治疗EGFR信号缺失的小鼠,能预防小鼠皮肤屏障损伤。本研究的发现或有助于癌症和特异性皮炎治疗。推荐阅读!
毛囊炎
皮肤微生物
抗-EGFR治疗
Th2应答
TH1/TH17应答
饮食-菌群互作
Nature子刊:缺乏膳食纤维,影响肠道菌群的精细空间结构
对于菌群在肠道中的空间结构,人们了解有限。Nature Communications近期发表的一项研究,用激光捕获显微切割技术,沿纵轴和横轴分析了小鼠的结肠菌群,揭示了菌群组成和多样性在两个轴向上的梯度性变化,并发现饮食中的纤维和多糖,可在整体和局部两个层面对肠道菌群产生影响,再次表明膳食纤维对塑造结肠菌群的重要性。
饮食-菌群互作
激光捕获显微切割
16S rRNA基因测序
宏基因组分析
荧光原位杂交
沙门氏菌感染
Cell子刊:抵御沙门氏菌感染的低丰度共生菌
《Cell Host and Microbe》近期发表一项研究,在一次结果异常的沙门氏菌感染实验中,发现小鼠携带的低丰度共生菌Mucispirillum schaedleri可以通过竞争营养物质,帮助宿主抵抗鼠伤寒沙门氏菌感染,从而干扰沙门氏菌感染模型的建立。该研究不仅发现共生菌协助抵御肠道感染的一种机制,还指出了共生菌群差异对动物实验结果的影响,值得参考。
沙门氏菌感染
肠道细菌Mucispirillum schaedleri
营养竞争
菌群功能分析
稳定同位素探测用于菌群功能研究(综述)
基于DNA/RNA测序的技术方法,在分析菌群组成时很好用,但用于预测菌群代谢和功能时则能力有限。Trends in Microbiology发表综述,详细介绍了一系列稳定同位素探测(SIP)技术用于菌群功能研究的原理、方法和案例,值得专业人士关注。
菌群功能分析
稳定同位素探测
系统生物学
菌群代谢物
Eldad A Hod
定殖抗性
Nature子刊:人工组合10几株菌,就能让小鼠抵抗沙门氏菌
这是最近较为令人震惊的研究,人工组合生成一个最小细菌群落,就可以提供对鼠伤寒沙门氏菌的定植抗性,优化以后,可以有更强的功能。人工设计和组合菌群,会成为未来可靠的感染性疾病应对方法么?
定殖抗性
基因组指导设计
最小细菌群落
Saba Noor
Iqbal Parwez
淋巴瘤
CR:对抗白血病,肠道菌群有何靠谱作为?
① 共济失调毛细血管扩张症是一种遗传性疾病,与B细胞淋巴瘤发病率高有关;② 比较多种共济失调毛细血管扩张症小鼠的淋巴瘤发病率,发现肠道菌群影响了小鼠的淋巴瘤发病率、潜伏期、寿命、分子氧化应激以及系统性白细胞遗传毒性;③ 约氏乳杆菌在更易患癌的小鼠中缺失,短期口服补充能降低系统性遗传毒性,减少基础白细胞和细胞因子介导的炎症状态;④ 肠道菌群或是干预B细胞淋巴瘤或其他由遗传毒性、氧化应激分子反应驱动的疾病的潜在靶点。
淋巴瘤
肠道细菌
系统性炎症
氧化应激