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Damian R Plichta
文章数:12篇
肠道病毒群
Nature子刊:百岁老人肠道病毒群或可助其抵抗病原体
独特的肠道微生物群可能与预防衰老相关进程有关,因为它影响全身免疫功能和对感染的抵抗力。然而,贯穿生命不同阶段的微生物组的病毒群仍未被探索。近日,麻省理工学院、哈佛大学研究人员在Nature Microbiology发表最新研究,评估了百岁老人肠道病毒群特征,发现肠道中多种病毒会增加细菌分解硫酸盐能力,可能有助于帮助百岁老人免受传染病的侵害,值得关注。
肠道病毒群
百岁老人
研究论文
基础研究
肠道菌群
ADP-核糖基转移酶
Cell子刊:ADP-核糖基转移酶作为适应性因子,如何促进细菌定植?
细菌ADP-核糖转移酶(ADPRTs)被认为是一种通过修饰宿主蛋白参与发病机制的毒素。Cell Host and Microbe发表的文章,发现ADPRTs广泛存在于人类肠道微生物群中,经常与噬菌体元件相关,并作为活性酶分泌。拟杆菌中丰富的ADP-核糖基转移酶Bxa是一个适应性因子,有助于细菌自身的定植。此外,Bxa可靶向上皮细胞中的非肌球蛋白II,重塑肌动蛋白细胞骨架,诱导肌苷分泌。本研究结果提示,深入了解ADPRTs以及这些酶在其他细菌中的作用,或对未来宿主-微生物相互作用的研究提供新思路。
ADP-核糖基转移酶
肠道微生物组
长寿
Nature聚焦百岁老人肠道菌群:一组特殊的胆汁酸或助长寿
Nature最新发表的一项研究,通过对比分析日本百岁老人、老年人和年轻人的肠道菌群和粪便代谢物,发现百岁老人有独特的肠道菌群特征,其菌群有助于富集一组特定的次级胆汁酸(包括isoalloLCA在内的石胆酸衍生物)。该研究进一步鉴定出参与这些胆汁酸代谢的细菌和代谢通路,并发现isoalloLCA能有效抑制革兰氏阳性致病菌。该研究还分析了胆汁酸谱与肠道菌群结构的关系。总之这些发现提示,特定的胆汁酸代谢物可能有助于抵抗致病菌感染,维持肠道稳态,从而促进健康长寿。这为阐释肠道菌群如何影响健康长寿带来了新启示。
长寿
肠道菌群
胆汁酸代谢
次级胆汁酸
抗菌机制
菌群-免疫互作
1型自身免疫性多内分泌腺综合征患者的肠道菌群变化
1型自身免疫性多内分泌腺综合征(APS-1)是一种罕见的多器官自身免疫疾病,因AIRE基因突变导致免疫耐受丢失而导致,通常可表现出胃肠道症状。Journal of Allergy and Clinical Immunology上发表的一项最新研究,对比鉴定了APS-1患者的肠道菌群变化,并发现部分APS-1相关OTU与胃肠道症状及抗细胞因子自身抗体水平相关。经益生菌干预后,部分与胃肠道症状相关的OTU减少。
菌群-免疫互作
自身免疫性多内分泌腺综合征
研究论文
基础研究
队列研究
菌群-免疫互作
一种罕见自身免疫病的菌群特征
IgG4相关疾病(IgG4-RD)和系统性硬化(SSc)是罕见的自身免疫疾病,以血液中存在CD4+ 细胞毒性T细胞、多器官炎症及纤维化为特征。Genome Medicine上发表的一项最新研究,对比鉴定了IgG4-RD患者与SSc患者的肠道菌群组成及功能的变化,发现与其它自身免疫疾病或炎症性疾病(如多发性硬化、类风湿关节炎、IBD)的患者不同,IgG4-RD患者与SSc患者有着独特且类似的菌群特征。
菌群-免疫互作
自身免疫疾病
系统性硬化
IgG4相关疾病
研究论文
胆固醇代谢
Cell子刊:你的胆固醇水平或由肠道细菌来决定
人类肠道微生物具有强大的代谢能力,但肠道微生物与人类代谢之间互作的机制仍不清楚。《Cell Host and Microbe》近期发表文章,鉴定出肠道细菌的胆固醇脱氢酶,并揭示出胆固醇代谢细菌的出现与宿主的粪便、血清总胆固醇降低相关,可直接影响人类健康。
胆固醇代谢
Microbiome
cholesterol
coprostanol
hydroxysteroid dehydrogenase
IBD
Cell:剖析宿主-菌群互作机制及治疗IBD(综述)
宿主-菌群互作在IBD的发病机制中起到重要作用。来自Cell上发表的一篇综述文章,详细介绍了宿主基因、宿主免疫、菌群及其代谢产物等因素的复杂互作机制对IBD发生发展的影响,并讨论了靶向宿主-菌群互作以治疗IBD的潜在策略。
IBD
宿主-菌群互作
IBD
Christopher R Shaler
Alexandra A Parco
菌群-宿主互作
Science:共生菌引起的肠道适应性免疫应答,具有个体差异
肠道菌群可调节适应性免疫,从而影响宿主健康,但对其背后的机制和规律人们仍所知甚少。《Science》发表的一项最新研究发现,嗜粘蛋白阿克曼氏菌(Akk菌)可诱导限菌小鼠的抗原特性的T细胞应答,促进生成IgG1抗体;但在菌群复杂的小鼠中,Akk菌引起的T细胞应答则存在个体差异,提示菌群内其它成员以及有个体差异的其它因素,可能影响针对Akk菌的T细胞反应。这些发现有助于解释特定共生菌对宿主免疫影响的个体间差异,也再次提示靶向菌群的干预方法,需建立在个体化的基础上。
菌群-宿主互作
适应性免疫
肠道T细胞
T细胞应答
Akkermansia muciniphila
炎症性肠病
Nature:炎症性肠病肠道微生态系统的多组学分析
《Nature》最新发表来自Curtis Huttenhower和Ramnik J. Xavier团队合作主导的研究,对132名受试者一年内多个时间点的粪便、活检和血液样本,进行纵向多组学分析,全面揭示了炎症性肠病(IBD)相关的肠道菌群及其功能失调,以及宿主和菌群的分子互作关联,对于阐释IBD机制、寻找防治IBD的新靶点有重要价值。
炎症性肠病
CROHN'S DISEASE
Microbiome
Systems analysis
ULCERATIVE COLITIS
肠道菌群-免疫系统互作
Nature:诱导CD8 T细胞的11株肠道菌,或能强化癌症治疗
肠道菌群与免疫息息相关,Nature发表的一项最新研究,从健康人粪便中分离出11株低丰度细菌(7个来自拟杆菌目),在小鼠肠道内共定植时,能有效诱导具有细胞杀伤功能的IFN-γ+ CD8 T细胞,增强对致病菌感染的抵抗力,并显著促进免疫检查点抑制剂的抗肿瘤效果,或许未来能用于辅助治疗癌症和感染等疾病。
肠道菌群-免疫系统互作
Microbiome
Mucosal immunology
肠道菌群
CD8+ T细胞
细菌适应性
Science:肠内生存不易,倒位子或是细菌适应肠道环境的利器
细菌如何适应变化的环境?Science发表的最新研究表明,一种称为倒位子(inverton)的遗传元件可能在肠道菌适应肠内环境中有重要作用。含有启动子的倒位子可翻转方向,使其调控的基因表达状态在“开”和“关”之间切换,从而在需要的时候让细菌表达有利于其生存的基因,比如与细菌表面结构分子和抗生素耐药性有关的基因,前者有助于细菌-环境(比如宿主免疫)互作,后者能帮细菌抵御抗生素的毁灭性打击,从而使细菌更好的在肠道等宿主环境中安居。
细菌适应性
倒位子
启动子
细菌-宿主互作
抗生素耐药基因
肠道菌群建立
Nature子刊:人类幼年的肠道菌群基因组和功能具有高度多样性
肠道菌群的早期建立对研究菌群结构和功能具有重要意义。本研究利用DIABIMMUNE研究中从芬兰、爱沙尼亚和俄罗斯收集到的儿童菌群数据数据,研究了微生物基因组多样性对肠道微生物组发育的影响,重点阐释了拟杆菌属、双歧杆菌属的多样性和差异性,在菌株水平拓展了对菌群早起建立的认识,值得参考。
肠道菌群建立
儿童肠道菌群
拟杆菌
双歧杆菌