David A Weitz

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文章数：3篇

高通量RNA测序

浙大Nature子刊：基于液滴的高通量单微生物RNA-seq测序方法—smRandom-seq

单细胞RNA-seq方法已广泛应用于生物领域。近日，浙江大学王永成及团队在Nature Communications发表最新研究，利用随机引物原位生成互补DNA，通过液滴微流控技术进行单微生物条形码编码，并基于CRISPR的rRNA去除法进行 mRNA 富集，在此基础上开发了一种高通量、高灵敏度的单微生物 RNA-seq方法（smRandom-seq），实测性能较好，值得关注。

高通量RNA测序 smRandom-seq 研究论文基础研究随机引物

微生物单细胞测序

Science：微生物高通量单细胞测序，助力在菌株水平上解析肠道菌群

肠道菌群是复杂的微生物群落，典型的人肠道菌群可包含数百个微生物物种，而每个物种中又可能包含多个有功能差异的菌株。然而，在菌株水平上开展大规模的肠道菌群研究，目前在方法学上仍存在挑战。为了克服这一困难，哈佛大学David Weitz团队与麻省理工学院Eric Alm团队合作，开发了一种新的微生物高通量单细胞测序方法Microbe-seq，无需培养即可从复杂群落中获得大量的单个微生物基因组信息，解析出菌株分辨率的高质量微生物基因组，并以人肠道菌群分析为例展示了该方法在菌群研究领域中的巨大潜力。相关论文已于Science发表，郑文山博士和赵诗杰博士是共通第一作者。相信随着方法学的不断突破，人们对于菌群的研究和认知也将被拓展到新的高度。

微生物单细胞测序肠道菌群菌株水平

Cell：肠道培养大突破，轻松揭示细菌-免疫-神经对话

今天的Cell，报道了直接分段培养肠道以做相关研究的器官培养系统，这是里程碑似的方法学，值得特别关注！特别推荐给大家。

Gut microbiota Enteric nervous system regulatory T cells neuropeptides substance P