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肠道菌群与疾病

Cell：肠道菌群与人类疾病间的因果关系被夸大（观点）

人源菌群鼠模型（HMA）是体内植入人体肠道/粪便菌群的无菌鼠类模型，为目前研究肠道菌群和疾病之间因果关系的主流手段。现有大量使用HMA证明多种诸如炎症、过敏、肿瘤等与肠道菌群成因果关系，但已知在人体中能确定具有因果关系的只有两种：幽门螺旋杆菌导致人患胃癌和艰难梭菌感染导致人腹泻。作者认为啮齿动物无法还原人体，自身生理结构、处所和饮食等都会造成不同结果，因此对该领域的研究结论需谨慎说明。在这里补充原文作者提出的相关建议：1）探索HMA中与疾病相关的菌群变化；2）使用考虑了生物差异性的供体样本量量；3）要将供体的重复组数量考虑进实验设计中；4）不混合供体样本以确保个体间差异；5）确保菌群移植成功，如特定的“失衡”菌群特征是否在受体内出现；6）诚实探讨动物实验不足；7）相关性分析HMA多组学数据和可能的菌群特征后进行功能性实验；

肠道菌群与疾病 causality Chronic disease Dysbiosis Fecal transplant

利用小鼠模型研究人体肠道菌群也许并不准确

① 小鼠肠道菌群与人体肠道菌群构成差异很大，只有4%的菌群具有高度的相似性；② 首先，小鼠和人类在基因层面上不同；③ 其次，小鼠肠道和人体肠道的生理结构和生化环境不同：表现在肠道各部位构成、大小、pH值、粘膜蛋白等；④ 再者，两菌群在菌群种类、数量上都不同，虽然两者都主要含有拟杆菌和厚壁菌门；⑤ 最后，不同品种的小鼠的肠道菌群不同，对食物的反应也不同；小鼠的居住环境也有影响；⑥ 用小鼠模型实验结果解释人体肠道菌群并不准确。

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